MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 7185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015500	TTA	2	6	170578	170583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015500	AG	3	6	170606	170611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015500	ATCCA	2	10	170648	170657	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
504	NC_015500	TCA	2	6	170725	170730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015500	TCG	2	6	172014	172019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_015500	ATT	2	6	172080	172085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015500	TGT	2	6	172170	172175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015500	GGA	2	6	172200	172205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015500	AC	3	6	172217	172222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_015500	AAT	2	6	172244	172249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015500	TAATT	2	10	172525	172534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015500	TTGA	2	8	172657	172664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015500	CTTC	2	8	172714	172721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_015500	TAA	2	6	172727	172732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015500	TTC	2	6	172752	172757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015500	TGC	2	6	172766	172771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015500	TTTTA	2	10	172837	172846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015500	CTT	2	6	172874	172879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015500	TACGG	2	10	172906	172915	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
520	NC_015500	TCG	2	6	172945	172950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015500	GACA	2	8	172954	172961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_015500	A	6	6	173025	173030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015500	T	9	9	173072	173080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015500	CTG	2	6	173129	173134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015500	CTC	2	6	173143	173148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_015500	TCC	2	6	173237	173242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_015500	T	6	6	173292	173297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015500	CTC	2	6	173343	173348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_015500	CCG	2	6	173358	173363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_015500	CGG	2	6	173369	173374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015500	CCGT	2	8	174767	174774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_015500	GTT	2	6	174786	174791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015500	CG	3	6	175825	175830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_015500	GAAAA	2	10	175856	175865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015500	CAAA	2	8	176220	176227	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_015500	CG	3	6	176296	176301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_015500	CCGG	2	8	176475	176482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_015500	CGG	2	6	176527	176532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015500	AGC	3	9	176572	176580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015500	T	6	6	176621	176626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015500	GCG	2	6	176641	176646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015500	TGT	2	6	176674	176679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015500	GTT	2	6	177445	177450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015500	GCG	2	6	177455	177460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015500	CGG	2	6	177474	177479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015500	T	7	7	177481	177487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015500	CTC	2	6	177858	177863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_015500	A	6	6	178252	178257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015500	GCG	2	6	178336	178341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015500	CCG	2	6	178473	178478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_015500	CAG	2	6	180866	180871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015500	CAT	2	6	182696	182701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015500	CCG	2	6	182747	182752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_015500	ACA	2	6	182802	182807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015500	GCG	2	6	183262	183267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015500	T	6	6	183377	183382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015500	A	6	6	188083	188088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015500	GCC	2	6	188138	188143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_015500	T	7	7	188145	188151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015500	TTTC	2	8	188247	188254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_015500	GCCG	2	8	188291	188298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_015500	GCG	2	6	188343	188348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015500	GC	3	6	188355	188360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_015500	ATA	2	6	189284	189289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015500	A	7	7	189291	189297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015500	CT	3	6	189342	189347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_015500	T	6	6	189359	189364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015500	CGG	2	6	189439	189444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015500	GGA	2	6	189464	189469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015500	TCG	2	6	191846	191851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015500	A	7	7	191911	191917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015500	CGA	2	6	191945	191950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015500	G	6	6	192006	192011	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015500	ATTC	2	8	194609	194616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_015500	TGT	2	6	194636	194641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015500	GAC	2	6	195506	195511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015500	CGG	2	6	195513	195518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015500	ATT	2	6	195535	195540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015500	CCT	2	6	198825	198830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015500	TCC	2	6	199703	199708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_015500	A	6	6	199797	199802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015500	TCT	2	6	199826	199831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015500	AGA	2	6	199873	199878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015500	GTG	2	6	199885	199890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015500	GCC	2	6	200013	200018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_015500	GCC	2	6	200097	200102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_015500	GCAC	2	8	200123	200130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015500	GC	3	6	200132	200137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_015500	TGA	2	6	200144	200149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015500	CGC	4	12	201436	201447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_015500	CGG	2	6	201496	201501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015500	CGG	2	6	201532	201537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015500	GC	3	6	202560	202565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_015500	GCG	3	9	202585	202593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015500	CGG	2	6	202594	202599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015500	CCG	2	6	203303	203308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_015500	CGCTG	2	10	203345	203354	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
598	NC_015500	GCC	2	6	203368	203373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_015500	CCGC	2	8	203394	203401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
600	NC_015500	A	7	7	203428	203434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015500	TTG	2	6	203444	203449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015500	GAG	2	6	203541	203546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015500	A	6	6	205417	205422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015500	GAAC	2	8	205466	205473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_015500	TGC	2	6	205475	205480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015500	A	6	6	205517	205522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015500	CGG	2	6	205534	205539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015500	CCG	2	6	205570	205575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_015500	AGG	2	6	205602	205607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015500	AGG	2	6	207918	207923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015500	A	6	6	209355	209360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015500	CTG	2	6	209420	209425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015500	T	7	7	209426	209432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015500	CGG	2	6	209472	209477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015500	GGC	2	6	216632	216637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015500	GCCGC	2	10	217717	217726	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
617	NC_015500	CCG	3	9	217754	217762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_015500	GCC	2	6	217776	217781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_015500	T	7	7	217814	217820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015500	T	6	6	217845	217850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015500	TGC	2	6	217878	217883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015500	T	9	9	217905	217913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015500	GAG	2	6	217926	217931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015500	TCG	2	6	218340	218345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015500	TCA	2	6	218382	218387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015500	TGC	2	6	218405	218410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015500	AAGCC	2	10	218424	218433	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
628	NC_015500	TCC	2	6	218447	218452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_015500	GGA	2	6	218927	218932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015500	CGG	2	6	221734	221739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015500	AGC	2	6	221743	221748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015500	GC	3	6	221757	221762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_015500	GC	3	6	222203	222208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_015500	CCG	2	6	222215	222220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_015500	GTA	2	6	223123	223128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015500	ATG	2	6	223148	223153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015500	A	6	6	223173	223178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015500	CGC	2	6	223193	223198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_015500	CTG	2	6	224157	224162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015500	GGC	2	6	224168	224173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_015500	GC	3	6	224202	224207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_015500	ATT	2	6	224718	224723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_015500	CTG	2	6	224774	224779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_015500	T	6	6	224788	224793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_015500	TGC	2	6	224797	224802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_015500	GTT	2	6	224857	224862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
648	NC_015500	GTC	2	6	224874	224879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_015500	T	7	7	224918	224924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_015500	A	7	7	224983	224989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_015500	T	6	6	225009	225014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_015500	T	6	6	225024	225029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_015500	AAAAAT	2	12	225046	225057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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659	NC_015500	TTG	2	6	226189	226194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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667	NC_015500	GCA	2	6	227436	227441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_015500	A	8	8	227580	227587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NC_015500	T	6	6	227607	227612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
674	NC_015500	T	6	6	227622	227627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
675	NC_015500	AAG	2	6	227644	227649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
676	NC_015500	A	6	6	227650	227655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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714	NC_015500	TAATA	2	10	237111	237120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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732	NC_015500	CGG	2	6	250827	250832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
733	NC_015500	CGG	2	6	250883	250888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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