MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermodesulfobium narugense DSM 14796 chromosome

Total Repeats: 4829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015499	CAA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015499	TAA	2	6	1450	1455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015499	TAA	2	6	1461	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015499	TAAT	2	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015499	A	7	7	1547	1553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015499	TAT	3	9	1580	1588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015499	TAG	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015499	TATTTT	2	12	10222	10233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015499	T	6	6	10230	10235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015499	AGG	2	6	13522	13527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015499	A	7	7	21050	21056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015499	CCT	2	6	21092	21097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015499	CTT	2	6	21188	21193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015499	AAT	2	6	21259	21264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015499	AT	3	6	21272	21277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015499	TGA	2	6	21329	21334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015499	AAT	2	6	21350	21355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015499	GA	3	6	21362	21367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015499	A	7	7	25888	25894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015499	T	6	6	29762	29767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015499	TAT	2	6	29779	29784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015499	TA	3	6	29807	29812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015499	T	6	6	29818	29823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015499	A	6	6	29840	29845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015499	TTTA	2	8	30647	30654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015499	TA	3	6	30653	30658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015499	TAA	2	6	30673	30678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015499	ATT	2	6	30681	30686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015499	TA	4	8	30706	30713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015499	ATT	2	6	30716	30721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015499	AGG	2	6	30765	30770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015499	TAA	3	9	33451	33459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015499	TAAA	2	8	33466	33473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015499	A	8	8	36478	36485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015499	TTAA	2	8	37103	37110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015499	TC	3	6	37953	37958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015499	TA	3	6	37990	37995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015499	ATTA	2	8	38026	38033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015499	TA	3	6	38080	38085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015499	AATAT	2	10	39462	39471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015499	AGG	2	6	39825	39830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015499	TAA	2	6	41542	41547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015499	T	8	8	41586	41593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015499	T	7	7	41595	41601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015499	TA	3	6	41604	41609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015499	TAT	2	6	41614	41619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015499	AAT	2	6	41640	41645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015499	ATT	2	6	45040	45045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015499	T	6	6	45800	45805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015499	TAA	3	9	45811	45819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015499	TAT	2	6	45820	45825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015499	AGA	2	6	45826	45831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015499	AT	3	6	45847	45852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015499	A	6	6	45872	45877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015499	ATT	3	9	49783	49791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015499	AAT	3	9	49792	49800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015499	TAT	3	9	49801	49809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015499	AGG	2	6	49814	49819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015499	ATTTA	2	10	50483	50492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015499	T	6	6	50536	50541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015499	TTTA	2	8	50551	50558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015499	TAA	2	6	50580	50585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015499	TAA	2	6	51721	51726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015499	A	6	6	51747	51752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015499	AGG	2	6	55496	55501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015499	AGG	2	6	57052	57057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015499	AGG	2	6	58332	58337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015499	TTAT	2	8	61362	61369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015499	ATT	2	6	61382	61387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015499	AATT	2	8	61388	61395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015499	TAAA	3	12	61402	61413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015499	CCT	2	6	63659	63664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015499	ATT	2	6	63689	63694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015499	T	7	7	63702	63708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015499	ATA	2	6	63728	63733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015499	TAA	2	6	63736	63741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015499	AT	3	6	65359	65364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015499	T	7	7	66064	66070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015499	ATC	2	6	66077	66082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015499	AT	3	6	66083	66088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015499	TCT	2	6	66093	66098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015499	TTA	2	6	69145	69150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015499	ATA	2	6	69151	69156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015499	GAC	2	6	69244	69249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015499	AC	3	6	69269	69274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015499	TAACA	2	10	69281	69290	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015499	ATTA	3	12	69304	69315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015499	AAT	2	6	69317	69322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015499	ATTAAA	2	12	69332	69343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015499	GGT	2	6	69363	69368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015499	TA	3	6	70003	70008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015499	A	6	6	70016	70021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015499	CAA	2	6	70039	70044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015499	GTA	2	6	70067	70072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015499	ACC	2	6	71764	71769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015499	ACAA	2	8	71887	71894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015499	ATTA	3	12	73101	73112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015499	ATTAAA	2	12	73129	73140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015499	AAGG	2	8	73153	73160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015499	TG	3	6	74976	74981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015499	CT	3	6	74987	74992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015499	T	6	6	75035	75040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015499	T	6	6	75082	75087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015499	GGA	2	6	75092	75097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015499	CAA	2	6	77094	77099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015499	GGGT	2	8	77100	77107	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015499	A	6	6	77121	77126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015499	GTG	2	6	78985	78990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015499	ACC	2	6	79052	79057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015499	ACAA	2	8	79176	79183	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015499	AT	3	6	79258	79263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015499	TAAA	2	8	79335	79342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015499	ATTA	3	12	79367	79378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015499	ATTAAA	2	12	79395	79406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015499	AAGG	2	8	79419	79426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015499	AAAT	2	8	84392	84399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015499	TTAA	2	8	89203	89210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015499	CCT	2	6	90693	90698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015499	ATA	2	6	90715	90720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015499	TAT	2	6	90738	90743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015499	A	6	6	90785	90790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015499	CTC	2	6	93271	93276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015499	TA	3	6	93297	93302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015499	T	6	6	93306	93311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015499	AGC	2	6	99319	99324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015499	TCC	2	6	99347	99352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015499	CCT	2	6	99385	99390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015499	TTA	2	6	99445	99450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015499	AT	3	6	99456	99461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015499	TAA	2	6	99467	99472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015499	TAA	2	6	99490	99495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015499	T	10	10	99517	99526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015499	A	6	6	99542	99547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015499	CTT	2	6	99567	99572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015499	AGAA	2	8	99593	99600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015499	A	6	6	99617	99622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015499	AT	3	6	99635	99640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015499	GAA	2	6	99650	99655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015499	TA	3	6	99670	99675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015499	ATT	2	6	99753	99758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015499	TTTGT	2	10	99771	99780	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015499	TAC	2	6	99800	99805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015499	ATTT	2	8	99884	99891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015499	CTT	2	6	99966	99971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015499	A	7	7	99996	100002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015499	TA	3	6	100003	100008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015499	TAT	3	9	100015	100023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015499	TAC	2	6	100041	100046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015499	TAC	2	6	100059	100064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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