MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermodesulfobium narugense DSM 14796 chromosome

Total Repeats: 4829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015499	AATGT	2	10	257806	257815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015499	ATA	2	6	257842	257847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015499	TA	3	6	257846	257851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015499	AGGA	2	8	259288	259295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015499	ATA	2	6	260292	260297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015499	AGG	2	6	260308	260313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015499	AAT	2	6	262731	262736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015499	AAT	2	6	262752	262757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015499	AGG	2	6	262761	262766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015499	AACA	2	8	268697	268704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_015499	CCT	2	6	270540	270545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_015499	ATA	2	6	271125	271130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015499	AAG	2	6	271202	271207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015499	T	6	6	271218	271223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015499	TA	3	6	271274	271279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015499	TA	3	6	271285	271290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015499	ATTA	2	8	271298	271305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015499	ATA	2	6	271312	271317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015499	AT	3	6	275429	275434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015499	A	7	7	280535	280541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015499	ATTT	2	8	280559	280566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015499	AGG	2	6	283246	283251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015499	GTT	2	6	285527	285532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015499	A	6	6	285627	285632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015499	TCCC	2	8	285651	285658	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
526	NC_015499	T	6	6	285668	285673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015499	AGT	2	6	286554	286559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015499	T	6	6	286562	286567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015499	AGG	2	6	286576	286581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015499	ACT	2	6	286890	286895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015499	AGG	2	6	286907	286912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015499	ATT	2	6	287858	287863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015499	T	6	6	287862	287867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015499	AT	3	6	287889	287894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015499	T	7	7	295006	295012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015499	TCC	2	6	297058	297063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_015499	AATT	2	8	297068	297075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015499	TAT	3	9	297855	297863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015499	AATT	2	8	297874	297881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015499	GTT	2	6	297882	297887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015499	T	8	8	297889	297896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015499	AT	3	6	297915	297920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015499	ATT	2	6	297959	297964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015499	AGG	2	6	298758	298763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015499	TAAT	2	8	299926	299933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015499	CAAT	2	8	299943	299950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_015499	TAAT	2	8	300484	300491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015499	TTTAT	2	10	300511	300520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015499	T	6	6	300520	300525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015499	TTA	2	6	300528	300533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015499	AGG	2	6	300537	300542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015499	GA	3	6	300543	300548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015499	T	7	7	302509	302515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015499	AAT	2	6	302523	302528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015499	ATTT	2	8	302533	302540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015499	T	6	6	302538	302543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015499	AGG	2	6	302544	302549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015499	T	6	6	304726	304731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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562	NC_015499	A	6	6	310139	310144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015499	ATTT	2	8	310262	310269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015499	GT	3	6	310275	310280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015499	AAG	2	6	310308	310313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015499	TAA	2	6	310318	310323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015499	ATG	2	6	310331	310336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015499	GA	3	6	310338	310343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015499	T	7	7	312229	312235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015499	A	6	6	312236	312241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015499	ATT	2	6	312260	312265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015499	TAA	2	6	312281	312286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015499	TTAAA	2	10	313117	313126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015499	GA	3	6	313154	313159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015499	AGG	2	6	313202	313207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015499	GTTT	2	8	313232	313239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015499	TTTTG	2	10	313267	313276	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_015499	ATG	2	6	313467	313472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_015499	ATTG	2	8	313667	313674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_015499	ATA	2	6	318825	318830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015499	TA	3	6	318832	318837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015499	AATAA	2	10	318846	318855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015499	AAAT	2	8	318859	318866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015499	ATA	2	6	318892	318897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015499	TA	3	6	318896	318901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015499	ATA	3	9	318899	318907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015499	TGG	3	9	318921	318929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015499	TTTAC	2	10	322985	322994	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
597	NC_015499	TAATA	2	10	323013	323022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_015499	AGG	2	6	323105	323110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015499	CGG	2	6	323534	323539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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603	NC_015499	TCT	2	6	323560	323565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015499	GT	3	6	323575	323580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015499	A	7	7	324520	324526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015499	TCA	2	6	324587	324592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_015499	CCT	2	6	325720	325725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_015499	ATT	2	6	325729	325734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015499	TTAAAC	2	12	325739	325750	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
612	NC_015499	A	6	6	325758	325763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015499	TAA	2	6	325795	325800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015499	TAA	2	6	325817	325822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015499	TA	3	6	325826	325831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015499	T	6	6	325832	325837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015499	TCC	2	6	330445	330450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_015499	A	7	7	330487	330493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015499	AAC	2	6	332421	332426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015499	CAA	2	6	332429	332434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015499	AAT	2	6	332453	332458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015499	T	6	6	332462	332467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015499	T	6	6	332473	332478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015499	TAT	3	9	332488	332496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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626	NC_015499	ATG	2	6	332647	332652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015499	ATA	2	6	332796	332801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015499	TAG	2	6	332823	332828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015499	GTT	2	6	333706	333711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015499	TCG	2	6	333841	333846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015499	T	6	6	333867	333872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015499	TTTA	2	8	333929	333936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015499	CTT	2	6	334010	334015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015499	GGC	2	6	334055	334060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015499	GCTT	2	8	334095	334102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_015499	CA	3	6	334201	334206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_015499	GAAA	2	8	334214	334221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015499	GAG	2	6	334236	334241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015499	GCA	2	6	334363	334368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015499	CGC	2	6	334410	334415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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642	NC_015499	CAG	2	6	334509	334514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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