MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 4024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015315	CCCGGC	2	12	1321338	1321349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_015315	CTC	2	6	1321358	1321363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_015315	CCA	2	6	1321408	1321413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_015315	CCG	2	6	1321441	1321446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_015315	CCG	2	6	1321474	1321479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_015315	CCT	2	6	1321508	1321513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2507	NC_015315	CGG	2	6	1321540	1321545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_015315	CCT	2	6	1321559	1321564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_015315	CTC	2	6	1321569	1321574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2510	NC_015315	CCCGC	2	10	1321624	1321633	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2511	NC_015315	GAG	2	6	1321667	1321672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_015315	GCC	2	6	1321680	1321685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_015315	CG	3	6	1321687	1321692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_015315	CT	3	6	1321727	1321732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_015315	GTA	2	6	1321733	1321738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_015315	CGTA	2	8	1321746	1321753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_015315	GCC	2	6	1321793	1321798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_015315	CCT	2	6	1321808	1321813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_015315	TAGA	2	8	1321820	1321827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015315	CCT	3	9	1321840	1321848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_015315	CAG	2	6	1321931	1321936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_015315	AAAT	2	8	1323095	1323102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_015315	TAAA	2	8	1323110	1323117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_015315	TGTAC	2	10	1323128	1323137	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2525	NC_015315	T	6	6	1323142	1323147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_015315	ATTT	2	8	1323150	1323157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_015315	AT	3	6	1323158	1323163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_015315	TTA	2	6	1323187	1323192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_015315	AAG	2	6	1323220	1323225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_015315	CCTTT	2	10	1323865	1323874	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2531	NC_015315	GCC	2	6	1323887	1323892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_015315	CCCT	2	8	1323933	1323940	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2533	NC_015315	GCC	2	6	1323968	1323973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_015315	TCC	2	6	1324087	1324092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_015315	CGG	2	6	1324180	1324185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_015315	CCGTG	2	10	1324201	1324210	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2537	NC_015315	GATC	2	8	1324295	1324302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2538	NC_015315	GCG	2	6	1324309	1324314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_015315	CCCG	2	8	1324405	1324412	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2540	NC_015315	CAC	2	6	1325164	1325169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_015315	CCA	2	6	1325177	1325182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2542	NC_015315	CCG	2	6	1325253	1325258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_015315	GA	3	6	1325328	1325333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_015315	GCC	2	6	1325371	1325376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_015315	CGC	2	6	1326010	1326015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_015315	AGGCGT	2	12	1326053	1326064	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2547	NC_015315	GCG	2	6	1326082	1326087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_015315	TACCC	2	10	1326499	1326508	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2549	NC_015315	CT	3	6	1326510	1326515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2550	NC_015315	GTC	2	6	1327143	1327148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_015315	CCCT	2	8	1327237	1327244	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2552	NC_015315	CAG	2	6	1327259	1327264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_015315	CGT	2	6	1327279	1327284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_015315	AGA	2	6	1327305	1327310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_015315	ACA	2	6	1327372	1327377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_015315	CA	3	6	1327403	1327408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2557	NC_015315	AG	3	6	1327420	1327425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_015315	CGC	3	9	1327445	1327453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_015315	CGCC	2	8	1327465	1327472	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2560	NC_015315	C	6	6	1327507	1327512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2561	NC_015315	C	7	7	1327540	1327546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2562	NC_015315	TCT	2	6	1327557	1327562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_015315	GCC	2	6	1327603	1327608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_015315	GGC	2	6	1327752	1327757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2566	NC_015315	GGGC	2	8	1327828	1327835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2567	NC_015315	GGC	2	6	1327848	1327853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_015315	TGC	2	6	1327854	1327859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_015315	GAC	2	6	1327878	1327883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_015315	CGA	2	6	1327926	1327931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_015315	TGG	2	6	1327977	1327982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_015315	CGG	2	6	1328072	1328077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_015315	GCC	2	6	1328134	1328139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_015315	GCG	2	6	1328486	1328491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_015315	AC	3	6	1328550	1328555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_015315	CCTGG	2	10	1328694	1328703	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2577	NC_015315	GCC	2	6	1328715	1328720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2578	NC_015315	CGG	2	6	1328899	1328904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2580	NC_015315	CGG	2	6	1328998	1329003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2584	NC_015315	TCG	2	6	1329127	1329132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2588	NC_015315	GCT	2	6	1329305	1329310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_015315	CCCGGT	2	12	1329390	1329401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_015315	C	6	6	1329445	1329450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2591	NC_015315	GGACC	2	10	1329485	1329494	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2592	NC_015315	CGG	2	6	1329534	1329539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_015315	G	6	6	1329571	1329576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_015315	TTGG	2	8	1329595	1329602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_015315	CCTACG	2	12	1329794	1329805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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2598	NC_015315	C	6	6	1329980	1329985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2599	NC_015315	GGC	2	6	1330055	1330060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_015315	GCC	2	6	1330066	1330071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_015315	CGG	2	6	1330160	1330165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_015315	CCGC	2	8	1330189	1330196	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2603	NC_015315	CGG	2	6	1330197	1330202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_015315	GTC	2	6	1330235	1330240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_015315	TTTGG	2	10	1330250	1330259	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_015315	TTTCC	2	10	1330330	1330339	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2607	NC_015315	CGAGC	2	10	1330475	1330484	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2608	NC_015315	CGG	2	6	1330513	1330518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_015315	GC	3	6	1330532	1330537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2610	NC_015315	AGG	2	6	1330569	1330574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_015315	C	6	6	1330620	1330625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2612	NC_015315	C	6	6	1330645	1330650	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2613	NC_015315	GTG	2	6	1330696	1330701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_015315	GT	3	6	1330711	1330716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_015315	CG	3	6	1330740	1330745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_015315	TCCT	2	8	1330928	1330935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2617	NC_015315	C	6	6	1330966	1330971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2618	NC_015315	GAC	2	6	1331052	1331057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2621	NC_015315	C	7	7	1331181	1331187	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2622	NC_015315	GGC	2	6	1331229	1331234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_015315	CCGG	2	8	1331259	1331266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2624	NC_015315	CAGC	2	8	1331284	1331291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2625	NC_015315	GCC	2	6	1331377	1331382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2628	NC_015315	CGG	2	6	1331443	1331448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_015315	GCCGG	2	10	1331522	1331531	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2630	NC_015315	CGG	2	6	1331589	1331594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_015315	CTG	2	6	1331716	1331721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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