MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 4024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015315	CAC	2	6	766224	766229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_015315	CT	3	6	766309	766314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_015315	GGC	2	6	766318	766323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_015315	CGG	2	6	766358	766363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_015315	G	6	6	766443	766448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015315	T	6	6	767512	767517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015315	CCG	2	6	768409	768414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_015315	CGG	2	6	768427	768432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_015315	A	6	6	773125	773130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015315	TAT	3	9	774484	774492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015315	TAT	2	6	774511	774516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015315	TA	3	6	774575	774580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015315	CTT	2	6	776759	776764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_015315	CTT	2	6	778115	778120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_015315	TAT	2	6	778554	778559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015315	TTA	2	6	778563	778568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015315	TCCC	2	8	782333	782340	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1518	NC_015315	G	6	6	782347	782352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015315	C	6	6	782362	782367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1520	NC_015315	CTT	2	6	782375	782380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_015315	GA	3	6	787003	787008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015315	TA	4	8	787031	787038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015315	TCC	2	6	787048	787053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_015315	GCC	2	6	787553	787558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_015315	TC	3	6	790502	790507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_015315	ATA	2	6	790533	790538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015315	AAT	2	6	790545	790550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015315	TTTA	2	8	790551	790558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015315	ATT	3	9	790581	790589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015315	TCTT	2	8	790590	790597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_015315	AATAT	2	10	790616	790625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015315	TTG	2	6	790682	790687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015315	TCT	2	6	790726	790731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_015315	CT	3	6	792053	792058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_015315	AT	4	8	792073	792080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015315	AAC	2	6	792131	792136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_015315	ATA	2	6	792159	792164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015315	TAT	2	6	792202	792207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015315	TA	3	6	792212	792217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015315	CCT	2	6	793857	793862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_015315	GCC	2	6	794701	794706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_015315	GCG	2	6	794712	794717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_015315	GCG	2	6	794720	794725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_015315	GGA	2	6	794766	794771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015315	AATT	2	8	797752	797759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015315	ATT	2	6	797770	797775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015315	ATG	2	6	797789	797794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015315	AATA	2	8	797795	797802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015315	TGGA	2	8	797806	797813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015315	CG	3	6	798122	798127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_015315	GCC	2	6	798142	798147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_015315	CGC	2	6	798218	798223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_015315	CCTGT	2	10	798233	798242	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1554	NC_015315	GT	3	6	798288	798293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015315	GAG	2	6	798326	798331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015315	CGC	2	6	798358	798363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_015315	TTA	2	6	798410	798415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015315	GAG	2	6	798416	798421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015315	GTCG	2	8	798438	798445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_015315	CAT	2	6	798471	798476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_015315	CCG	2	6	798532	798537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_015315	TCG	2	6	798549	798554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_015315	CGGC	2	8	798556	798563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_015315	CGA	2	6	798643	798648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_015315	CCG	2	6	798672	798677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_015315	AAC	2	6	801984	801989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015315	GAAG	2	8	802020	802027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015315	CGC	2	6	802052	802057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_015315	TCCAT	2	10	802088	802097	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1570	NC_015315	GGT	2	6	802101	802106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015315	ACG	2	6	802229	802234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_015315	CTT	2	6	802300	802305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_015315	ATG	2	6	802339	802344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015315	CTAA	2	8	802367	802374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_015315	TTAGT	2	10	802403	802412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015315	TA	3	6	802418	802423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015315	GAA	2	6	802450	802455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_015315	ATTA	2	8	803279	803286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015315	CGT	2	6	804841	804846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_015315	A	6	6	804865	804870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015315	A	6	6	812040	812045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015315	TCA	2	6	812095	812100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015315	GGC	2	6	812103	812108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_015315	GAG	2	6	812115	812120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015315	GGT	2	6	812133	812138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015315	GCG	3	9	812161	812169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_015315	TTC	2	6	818026	818031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_015315	TC	3	6	818038	818043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_015315	ATA	2	6	820511	820516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015315	AGG	2	6	821525	821530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015315	CGGC	2	8	821570	821577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_015315	G	6	6	822499	822504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015315	GCC	2	6	822506	822511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_015315	TAA	2	6	824894	824899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015315	CGAGC	2	10	824916	824925	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1596	NC_015315	GC	3	6	824924	824929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_015315	GCCT	2	8	824933	824940	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_015315	GCC	2	6	824970	824975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_015315	CTC	2	6	826478	826483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_015315	TAC	2	6	828716	828721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_015315	A	6	6	828724	828729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_015315	TATAAA	2	12	828734	828745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015315	CGC	2	6	831929	831934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_015315	TTA	2	6	831947	831952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015315	ATT	2	6	831967	831972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015315	ACG	2	6	835858	835863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_015315	CGG	2	6	835925	835930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_015315	TCA	2	6	841727	841732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_015315	CGG	2	6	841747	841752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_015315	GGCC	2	8	841775	841782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_015315	TAA	2	6	842303	842308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015315	AAG	2	6	842873	842878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015315	TA	3	6	843170	843175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015315	CTT	2	6	844374	844379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_015315	TGA	2	6	844447	844452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015315	GGC	2	6	844462	844467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_015315	AAAT	2	8	846246	846253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015315	GTAG	2	8	851156	851163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015315	CGG	2	6	851170	851175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015315	CAG	2	6	852298	852303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_015315	GCC	2	6	852310	852315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_015315	A	6	6	852343	852348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015315	TAA	2	6	852386	852391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015315	GCC	2	6	855701	855706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_015315	CCT	2	6	856547	856552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_015315	AGGC	2	8	856614	856621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_015315	CGT	2	6	856649	856654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_015315	CCAT	2	8	856706	856713	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_015315	CCG	2	6	858339	858344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_015315	CTG	2	6	858359	858364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_015315	AAAATA	2	12	858965	858976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015315	TTA	2	6	859020	859025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_015315	TA	5	10	859037	859046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015315	GAAA	2	8	859047	859054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015315	AGAT	2	8	859068	859075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_015315	GT	3	6	862319	862324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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