MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 4024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015315	AGG	2	6	466544	466549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015315	CTC	2	6	466553	466558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_015315	AT	3	6	466602	466607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015315	TA	3	6	466612	466617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015315	TGA	2	6	466633	466638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015315	GC	3	6	469088	469093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_015315	CCGAG	2	10	469145	469154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1008	NC_015315	CGG	2	6	469175	469180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_015315	GCC	2	6	469199	469204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_015315	TA	3	6	471190	471195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015315	GCC	2	6	471202	471207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_015315	AT	3	6	471218	471223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015315	CGC	2	6	471655	471660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_015315	CTG	2	6	471701	471706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015315	AGA	2	6	476911	476916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015315	GCC	2	6	476963	476968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_015315	AAG	2	6	478849	478854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015315	GAT	2	6	478883	478888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015315	GCC	2	6	482246	482251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_015315	TGA	2	6	482264	482269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015315	CG	3	6	482282	482287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_015315	TA	3	6	483882	483887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015315	TTG	2	6	485366	485371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015315	GTA	2	6	486170	486175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015315	TA	3	6	486251	486256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015315	AAAG	2	8	487869	487876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015315	CCAG	2	8	487901	487908	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_015315	A	6	6	487934	487939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015315	ATATTG	2	12	487944	487955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015315	ATT	2	6	487961	487966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015315	AATA	2	8	487972	487979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015315	AT	3	6	488008	488013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015315	G	6	6	493020	493025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015315	GA	3	6	497707	497712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015315	CGC	2	6	497715	497720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_015315	AAAT	2	8	501932	501939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015315	TAT	2	6	506221	506226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015315	T	6	6	506228	506233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015315	AGG	2	6	506346	506351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015315	CGT	2	6	506353	506358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015315	CCT	2	6	506376	506381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015315	GAG	2	6	508319	508324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015315	CGG	2	6	508325	508330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_015315	AGG	3	9	508967	508975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015315	TTA	2	6	510386	510391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015315	T	6	6	511492	511497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015315	ACA	2	6	511507	511512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015315	GCC	2	6	513834	513839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_015315	CGC	2	6	513855	513860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_015315	AT	3	6	513893	513898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015315	CGC	2	6	521500	521505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_015315	CAAA	2	8	525093	525100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_015315	GGC	2	6	525138	525143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015315	CGG	2	6	525151	525156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015315	CG	3	6	525541	525546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_015315	CGG	2	6	525569	525574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015315	AT	3	6	525595	525600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015315	AGT	2	6	525607	525612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015315	TCA	2	6	526574	526579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015315	TAG	2	6	526615	526620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015315	TCTAGA	2	12	527772	527783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1062	NC_015315	CG	3	6	528399	528404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_015315	A	6	6	528498	528503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015315	CTG	2	6	528553	528558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015315	CT	3	6	528560	528565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_015315	ACG	2	6	528614	528619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015315	TA	5	10	528655	528664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015315	GA	3	6	531997	532002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015315	ATATA	2	10	535836	535845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015315	GGC	2	6	537672	537677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015315	GTC	2	6	537728	537733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015315	TAT	2	6	537774	537779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015315	GAG	2	6	538454	538459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015315	AT	3	6	538470	538475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015315	ACC	2	6	538487	538492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_015315	CGG	2	6	538545	538550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015315	CT	3	6	538574	538579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_015315	TCA	2	6	540083	540088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015315	ATTT	2	8	540089	540096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015315	AACTC	2	10	540158	540167	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1081	NC_015315	ATC	2	6	540187	540192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015315	GGA	2	6	540204	540209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015315	GGC	2	6	540217	540222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015315	GAG	2	6	540235	540240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015315	CGA	2	6	540290	540295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015315	TGA	2	6	540778	540783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015315	TAA	2	6	541303	541308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015315	TAAA	2	8	541331	541338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015315	AT	3	6	541366	541371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015315	CCG	2	6	543670	543675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_015315	GGC	2	6	543700	543705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015315	C	6	6	543707	543712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1093	NC_015315	CGA	2	6	543761	543766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_015315	ATTTTT	2	12	543816	543827	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015315	CAA	2	6	543842	543847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_015315	AG	3	6	544972	544977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015315	CGAC	2	8	544979	544986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_015315	AGT	2	6	545010	545015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015315	AT	3	6	545036	545041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015315	TTAT	2	8	545042	545049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015315	ATT	2	6	545058	545063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015315	AAT	2	6	545106	545111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015315	ATATA	2	10	551474	551483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015315	ATAA	2	8	551492	551499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015315	GTA	2	6	551510	551515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015315	T	6	6	551530	551535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015315	AGAGG	2	10	552294	552303	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015315	GGC	2	6	555422	555427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015315	GCG	2	6	555475	555480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015315	GGA	2	6	559602	559607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015315	CGG	2	6	562138	562143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_015315	TAAT	2	8	565099	565106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015315	AT	3	6	565105	565110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015315	TAA	3	9	567278	567286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015315	TGT	2	6	567302	567307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015315	CCT	2	6	567674	567679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_015315	ATA	2	6	567733	567738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015315	TAT	2	6	567742	567747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015315	A	6	6	567786	567791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015315	AG	3	6	567845	567850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015315	AGGG	2	8	567876	567883	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015315	CCT	2	6	576378	576383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_015315	CGA	2	6	576414	576419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_015315	CTC	2	6	576485	576490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_015315	GAG	2	6	576511	576516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015315	CCT	2	6	576556	576561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_015315	CAT	2	6	576621	576626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015315	CTC	2	6	576685	576690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_015315	GCGG	2	8	576691	576698	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_015315	TGA	2	6	576852	576857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015315	ATA	2	6	578507	578512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015315	TA	3	6	578511	578516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015315	ATT	2	6	578524	578529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015315	AAT	2	6	578534	578539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015315	TA	3	6	583113	583118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015315	AGGGC	2	10	583389	583398	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1137	NC_015315	CGG	2	6	583427	583432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1264	NC_015315	TATT	2	8	639720	639727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_015315	GTC	2	6	642067	642072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_015315	T	6	6	653297	653302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_015315	GTA	2	6	654763	654768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_015315	GGCAA	2	10	654902	654911	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1270	NC_015315	CGATG	2	10	655083	655092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1271	NC_015315	GGC	2	6	655203	655208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_015315	ACG	2	6	655319	655324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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