MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 8754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014964	ATA	2	6	18	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014964	TAT	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014964	TAAA	2	8	40	47	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014964	AGG	2	6	73	78	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014964	T	6	6	1456	1461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014964	TAA	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014964	ATT	2	6	1503	1508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014964	TCT	2	6	1565	1570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014964	ACT	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014964	CTTAT	2	10	1591	1600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014964	TAT	2	6	1602	1607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014964	A	7	7	1620	1626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014964	T	6	6	2778	2783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014964	ACC	2	6	8738	8743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014964	TAC	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014964	CTT	2	6	8805	8810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014964	CAT	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014964	TTTG	2	8	8856	8863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014964	T	6	6	8878	8883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014964	A	6	6	8884	8889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014964	TATAT	2	10	8927	8936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014964	TATAT	2	10	8943	8952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014964	AAT	2	6	9012	9017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014964	ATTTT	2	10	9030	9039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014964	ATAAA	2	10	9065	9074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014964	CTT	2	6	14496	14501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014964	ATA	2	6	14521	14526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014964	A	7	7	14601	14607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014964	T	7	7	14614	14620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014964	T	6	6	14636	14641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014964	ATT	2	6	14660	14665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014964	AAT	2	6	14677	14682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014964	TGC	2	6	14704	14709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014964	AG	3	6	14799	14804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014964	GGT	2	6	14807	14812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014964	CGG	2	6	14869	14874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014964	TTA	2	6	14880	14885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014964	GGT	2	6	14964	14969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014964	GGA	2	6	14977	14982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014964	AGG	2	6	16539	16544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014964	CGG	2	6	23917	23922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014964	GGAGAA	2	12	23987	23998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014964	AT	3	6	24013	24018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014964	T	6	6	24028	24033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014964	T	6	6	24059	24064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014964	AGG	2	6	24070	24075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014964	TGA	2	6	25804	25809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014964	AGG	2	6	25823	25828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014964	A	7	7	27036	27042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014964	ATT	2	6	27056	27061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014964	TA	3	6	27065	27070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014964	TAA	2	6	27083	27088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014964	CCCAGC	2	12	28732	28743	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014964	AAG	2	6	28778	28783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014964	TTTG	2	8	30184	30191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014964	T	7	7	30237	30243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014964	TTC	2	6	30292	30297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014964	ATC	2	6	30361	30366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014964	TTAA	2	8	30369	30376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014964	T	6	6	30387	30392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014964	CCT	2	6	30416	30421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014964	TAT	2	6	30429	30434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014964	TAAAAA	2	12	30462	30473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014964	CCG	2	6	30476	30481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014964	TC	3	6	30669	30674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014964	AAT	2	6	30678	30683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014964	TAT	2	6	30694	30699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014964	AT	3	6	30704	30709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014964	A	7	7	30732	30738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014964	TTTG	2	8	30745	30752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014964	GAG	2	6	30787	30792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014964	AGT	2	6	31339	31344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014964	AGT	2	6	31352	31357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014964	ATA	2	6	31358	31363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014964	A	6	6	31366	31371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014964	ATA	2	6	31373	31378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014964	AGT	2	6	31399	31404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014964	AG	3	6	31420	31425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014964	TGG	3	9	31427	31435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014964	ATT	2	6	31580	31585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014964	AT	3	6	32878	32883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014964	TA	3	6	32902	32907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014964	T	7	7	33061	33067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014964	CAAC	2	8	33073	33080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014964	CCT	2	6	33162	33167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014964	TAT	2	6	33180	33185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014964	TAT	2	6	33201	33206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014964	T	6	6	33206	33211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014964	T	6	6	33298	33303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014964	TTC	2	6	33310	33315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014964	TAT	2	6	33341	33346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014964	AT	3	6	33345	33350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014964	GTT	2	6	33514	33519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014964	T	6	6	34690	34695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014964	T	7	7	35487	35493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014964	CAC	2	6	36260	36265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014964	TAT	2	6	36283	36288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014964	TATAA	2	10	36354	36363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014964	AGG	2	6	36390	36395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014964	TTA	2	6	36650	36655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014964	TTC	2	6	36665	36670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014964	AGG	2	6	36683	36688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014964	A	6	6	37188	37193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014964	AGG	2	6	37417	37422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014964	ATTTT	2	10	38525	38534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014964	TA	4	8	38540	38547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014964	AT	3	6	38555	38560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014964	A	6	6	38564	38569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014964	AAT	2	6	38575	38580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014964	AAAAGC	2	12	38645	38656	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014964	T	6	6	39067	39072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014964	AGC	2	6	39139	39144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014964	TAA	2	6	39174	39179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014964	TTTTA	2	10	39184	39193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014964	AGG	2	6	39226	39231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014964	AGA	2	6	40254	40259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014964	A	6	6	40268	40273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014964	AGG	2	6	40282	40287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014964	T	6	6	42005	42010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014964	AGG	2	6	42030	42035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014964	TCTTTT	2	12	43536	43547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014964	T	6	6	43544	43549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014964	TAA	2	6	43568	43573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014964	AAGCA	2	10	43607	43616	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014964	TTATTT	2	12	43622	43633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014964	A	6	6	43682	43687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014964	CCT	2	6	43773	43778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014964	T	7	7	44480	44486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014964	A	6	6	44498	44503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014964	ACC	2	6	45169	45174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014964	GAAG	2	8	45306	45313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014964	TGA	2	6	45334	45339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014964	GATG	2	8	45368	45375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014964	AT	3	6	45435	45440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014964	CAG	2	6	45548	45553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014964	AAGG	2	8	45586	45593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014964	AGG	2	6	45604	45609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014964	CCG	2	6	47040	47045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_014964	GTAC	2	8	47057	47064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014964	GGT	2	6	47065	47070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014964	AATAA	2	10	47085	47094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014964	CTG	2	6	47125	47130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014964	T	6	6	47145	47150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014964	CCG	2	6	47175	47180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_014964	AC	3	6	47186	47191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014964	T	6	6	47308	47313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014964	GGT	2	6	47344	47349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014964	AGG	2	6	51006	51011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014964	AAT	2	6	52177	52182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_014964	CCTA	2	8	121803	121810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
444	NC_014964	CCTA	2	8	121870	121877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
445	NC_014964	CCTA	2	8	121936	121943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
446	NC_014964	CCTA	2	8	122001	122008	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
447	NC_014964	CCTA	2	8	122067	122074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
448	NC_014964	CCTA	2	8	122134	122141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
449	NC_014964	CCTA	2	8	122200	122207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
450	NC_014964	AAG	2	6	122253	122258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_014964	CCTA	2	8	122266	122273	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_014964	CCG	2	6	122287	122292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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455	NC_014964	CCTA	2	8	122401	122408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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461	NC_014964	CCTA	2	8	122602	122609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
462	NC_014964	CCTA	2	8	122668	122675	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
463	NC_014964	CCTA	2	8	122735	122742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
464	NC_014964	CCTA	2	8	122803	122810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_014964	AGG	2	6	122851	122856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
466	NC_014964	CCTA	2	8	122871	122878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
467	NC_014964	A	7	7	122907	122913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_014964	CCTA	2	8	122938	122945	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
469	NC_014964	CTT	2	6	122973	122978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_014964	TAA	2	6	122987	122992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014964	CCTA	2	8	123004	123011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
473	NC_014964	CTG	2	6	123040	123045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_014964	AAAC	2	8	123089	123096	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
476	NC_014964	CCTA	2	8	123138	123145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
477	NC_014964	CCTA	2	8	123204	123211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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480	NC_014964	CCTA	2	8	123338	123345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
481	NC_014964	TTG	2	6	123377	123382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
482	NC_014964	AGTT	2	8	123392	123399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_014964	CCTA	2	8	123405	123412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
484	NC_014964	CCTA	2	8	123473	123480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
485	NC_014964	CCG	2	6	123510	123515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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488	NC_014964	TCT	2	6	123573	123578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_014964	CCTA	2	8	123610	123617	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
490	NC_014964	ACA	3	9	123630	123638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
491	NC_014964	TAT	2	6	123639	123644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_014964	CCTA	2	8	123677	123684	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
493	NC_014964	CCA	2	6	123717	123722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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495	NC_014964	CTT	2	6	123788	123793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
496	NC_014964	CCTA	2	8	123810	123817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
497	NC_014964	A	9	9	123852	123860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014964	CCTA	2	8	123876	123883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_014964	CCTA	2	8	123942	123949	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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