MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 8754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014964	ATA	2	6	191196	191201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014964	T	7	7	191556	191562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014964	TA	3	6	191585	191590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014964	TAT	2	6	191620	191625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014964	AGG	2	6	191630	191635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014964	T	8	8	193188	193195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014964	AT	3	6	193222	193227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014964	ATT	2	6	193237	193242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014964	GGATG	2	10	193253	193262	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014964	T	10	10	195553	195562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014964	T	8	8	195568	195575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014964	AT	4	8	195587	195594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014964	T	6	6	199675	199680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014964	AT	3	6	199682	199687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014964	TTAG	2	8	199699	199706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014964	GGA	2	6	199723	199728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014964	T	7	7	200383	200389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014964	TAC	3	9	200416	200424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014964	A	6	6	200425	200430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014964	AGG	2	6	200452	200457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014964	CATAA	2	10	202521	202530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_014964	AAT	2	6	202550	202555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014964	AGG	2	6	202570	202575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014964	CCA	2	6	202786	202791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_014964	GAA	2	6	202799	202804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014964	TCT	2	6	202808	202813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014964	TAAAA	2	10	202832	202841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014964	GA	3	6	202908	202913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014964	GAA	2	6	204003	204008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014964	AGG	2	6	206168	206173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014964	AGG	2	6	207938	207943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014964	T	6	6	207946	207951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014964	A	6	6	208649	208654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014964	T	7	7	208679	208685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014964	ATA	2	6	208722	208727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014964	ATC	2	6	208756	208761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1038	NC_014964	TAT	2	6	208885	208890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014964	TAT	2	6	208905	208910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014964	T	6	6	209093	209098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1042	NC_014964	TAT	2	6	209228	209233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014964	AGG	2	6	209252	209257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014964	TAC	2	6	210772	210777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014964	TAT	2	6	210798	210803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014964	ATTT	2	8	210869	210876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014964	ATT	2	6	214143	214148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014964	TA	3	6	214973	214978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014964	TTA	2	6	215139	215144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014964	AATGAA	2	12	215152	215163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_014964	TGA	2	6	215240	215245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014964	AAC	2	6	215274	215279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014964	GTA	2	6	215287	215292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014964	T	6	6	215345	215350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014964	AAG	2	6	215351	215356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_014964	GGA	2	6	215409	215414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014964	TA	3	6	215415	215420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014964	GGA	2	6	215423	215428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014964	TCC	2	6	218666	218671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_014964	T	6	6	218676	218681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014964	ATT	2	6	218800	218805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014964	GCA	2	6	218807	218812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014964	AT	3	6	218819	218824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014964	AAG	2	6	218829	218834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014964	ATA	2	6	218883	218888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014964	TAT	2	6	218955	218960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014964	T	7	7	218960	218966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014964	AT	3	6	219093	219098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014964	TGG	2	6	219108	219113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014964	ATT	2	6	219130	219135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014964	TAGGA	2	10	219150	219159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014964	TGGCA	2	10	219165	219174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1076	NC_014964	TA	3	6	219175	219180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014964	ATT	2	6	219196	219201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014964	TGG	2	6	219375	219380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014964	TATT	2	8	219490	219497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_014964	TC	3	6	219520	219525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_014964	T	6	6	219540	219545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014964	ATT	2	6	219549	219554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014964	CCT	2	6	220585	220590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_014964	ATTTT	2	10	222401	222410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014964	TATT	2	8	222417	222424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014964	TAT	2	6	222439	222444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014964	ACA	2	6	222465	222470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014964	T	7	7	222502	222508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014964	TA	4	8	222516	222523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014964	ATT	2	6	222556	222561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014964	CAAA	2	8	222591	222598	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1095	NC_014964	TAA	2	6	222642	222647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014964	A	7	7	222654	222660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014964	ACAAT	2	10	222672	222681	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_014964	ATT	2	6	222694	222699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014964	ATA	2	6	222740	222745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_014964	AATT	2	8	222819	222826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014964	ATT	2	6	222852	222857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014964	ATA	2	6	222861	222866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014964	ATATA	2	10	223583	223592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014964	GAT	2	6	223620	223625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014964	AAGGAG	2	12	224765	224776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014964	ATG	2	6	224814	224819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014964	AAG	3	9	224847	224855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014964	ATG	2	6	224878	224883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014964	TAAA	2	8	224886	224893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014964	T	7	7	224895	224901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014964	TATAG	2	10	224938	224947	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014964	T	7	7	224973	224979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014964	T	6	6	224984	224989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014964	TAA	2	6	228981	228986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014964	TAAA	2	8	229006	229013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014964	GAT	2	6	229024	229029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014964	A	6	6	229033	229038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014964	ACA	2	6	229134	229139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_014964	A	6	6	229188	229193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014964	T	6	6	229204	229209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014964	TAAT	2	8	229227	229234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014964	CCG	2	6	229929	229934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_014964	T	7	7	229950	229956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014964	ATTTT	2	10	229957	229966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014964	T	7	7	229963	229969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014964	AT	3	6	230015	230020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014964	AAT	2	6	230062	230067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014964	GGT	2	6	230072	230077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014964	AGT	2	6	230582	230587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014964	AGG	2	6	230617	230622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014964	TAA	2	6	234749	234754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014964	TTA	2	6	234755	234760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014964	AAAAT	2	10	234797	234806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014964	TGA	2	6	234872	234877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014964	T	7	7	234929	234935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014964	CCT	2	6	234948	234953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_014964	T	6	6	235637	235642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1163	NC_014964	AG	3	6	239705	239710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1165	NC_014964	T	6	6	239733	239738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_014964	TG	3	6	239764	239769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1260	NC_014964	TGT	2	6	268128	268133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_014964	T	6	6	268158	268163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_014964	ATC	2	6	268185	268190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_014964	A	6	6	268281	268286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1268	NC_014964	A	6	6	268383	268388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_014964	ATA	2	6	268398	268403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_014964	GATT	2	8	268418	268425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_014964	AAAGC	2	10	268430	268439	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1272	NC_014964	ATT	2	6	268471	268476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_014964	GCT	2	6	268560	268565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_014964	GAG	2	6	268587	268592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_014964	AGAAA	2	10	268625	268634	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1277	NC_014964	ATG	2	6	268742	268747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_014964	ACC	2	6	299771	299776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_014964	TAGT	2	8	299781	299788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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