MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 chromosome

Total Repeats: 2046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014926	AGG	2	6	34	39	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014926	GAG	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014926	AGG	2	6	3831	3836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014926	TCC	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014926	TTA	2	6	8082	8087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014926	A	6	6	8112	8117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014926	CA	3	6	8124	8129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014926	ATT	3	9	8243	8251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014926	AT	4	8	8260	8267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014926	TA	3	6	8269	8274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014926	AT	4	8	8292	8299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014926	CAA	2	6	11456	11461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014926	TGA	2	6	13386	13391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014926	TAA	2	6	14555	14560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014926	AAAGT	2	10	14576	14585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014926	GAAAA	2	10	14599	14608	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014926	A	6	6	14622	14627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014926	CTTT	2	8	16012	16019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014926	TAA	2	6	16031	16036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014926	T	6	6	16101	16106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014926	GA	3	6	16129	16134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014926	TAA	2	6	16175	16180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014926	A	8	8	16186	16193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014926	T	6	6	16315	16320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014926	AG	3	6	20125	20130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014926	CAG	2	6	20143	20148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014926	TTC	2	6	20237	20242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014926	TCA	2	6	20283	20288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014926	TCC	2	6	24646	24651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014926	GTTT	2	8	26397	26404	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014926	CCT	2	6	31907	31912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014926	ATG	2	6	31955	31960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014926	TCCC	2	8	32643	32650	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_014926	AAC	2	6	34324	34329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014926	GTTT	2	8	34337	34344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014926	CGC	2	6	34377	34382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014926	AGG	2	6	34390	34395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014926	CT	3	6	34862	34867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014926	ACC	2	6	35071	35076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014926	CCAG	2	8	35121	35128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014926	TCC	2	6	35939	35944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014926	T	6	6	35953	35958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014926	AAAC	2	8	35968	35975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014926	GGA	2	6	36024	36029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014926	T	6	6	38536	38541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014926	ACA	2	6	39534	39539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014926	AGG	2	6	39547	39552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014926	GTC	2	6	44560	44565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014926	AAAC	2	8	47833	47840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014926	AAT	2	6	50249	50254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014926	TAA	3	9	50302	50310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014926	AAG	2	6	50328	50333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014926	ACTTA	2	10	50341	50350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014926	AAG	2	6	50447	50452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014926	T	6	6	50503	50508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014926	GA	3	6	50531	50536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014926	T	6	6	50576	50581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014926	T	6	6	50597	50602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014926	TAAA	2	8	50629	50636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014926	CGGGC	2	10	50647	50656	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014926	TGG	2	6	50671	50676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014926	TGC	2	6	50719	50724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014926	TAA	2	6	50726	50731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014926	ACC	2	6	50737	50742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014926	TAT	2	6	56327	56332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014926	TC	3	6	56362	56367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014926	ACC	2	6	56384	56389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014926	AGG	2	6	57162	57167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014926	TGT	2	6	59636	59641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014926	TTACG	2	10	59642	59651	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014926	ATT	2	6	59677	59682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014926	CCT	2	6	60844	60849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014926	ATT	2	6	60862	60867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014926	TC	3	6	61644	61649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014926	GA	3	6	61664	61669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014926	G	6	6	61677	61682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014926	CCT	2	6	63832	63837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014926	AGG	2	6	63869	63874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014926	CCCG	2	8	63937	63944	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_014926	TATT	2	8	63998	64005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014926	C	6	6	64045	64050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_014926	AAG	2	6	64052	64057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014926	GA	3	6	64078	64083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014926	TCCT	2	8	66678	66685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014926	GA	3	6	73540	73545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014926	CAG	2	6	73566	73571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014926	AGG	2	6	73573	73578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014926	CT	3	6	73631	73636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014926	AG	3	6	73672	73677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014926	G	6	6	73710	73715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014926	GCC	2	6	73739	73744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014926	CTT	2	6	73747	73752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014926	TAG	2	6	73785	73790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014926	A	6	6	73885	73890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014926	CA	3	6	73987	73992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014926	A	7	7	73998	74004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014926	TG	3	6	74016	74021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014926	CTCC	2	8	74614	74621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_014926	T	6	6	74669	74674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014926	TAA	2	6	74683	74688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014926	TTAA	2	8	74716	74723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014926	AGGG	2	8	74740	74747	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014926	TTTAA	2	10	74757	74766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014926	GCG	2	6	74783	74788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014926	CGC	2	6	74800	74805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014926	CCT	2	6	74999	75004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014926	CCTG	2	8	76286	76293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014926	GTT	2	6	76301	76306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014926	TAT	2	6	76310	76315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014926	G	6	6	76324	76329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014926	C	6	6	76335	76340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_014926	C	7	7	76980	76986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_014926	TCC	2	6	77864	77869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014926	TCC	2	6	77882	77887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014926	TCC	2	6	77895	77900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014926	ATT	2	6	82268	82273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014926	GGA	2	6	82302	82307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014926	TCC	2	6	83545	83550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014926	CTT	3	9	84716	84724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014926	ATT	2	6	84731	84736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014926	AGG	2	6	84799	84804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014926	GGGA	2	8	85683	85690	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014926	CCG	2	6	86360	86365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014926	GACC	2	8	91367	91374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014926	CCT	2	6	91990	91995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014926	GGAG	2	8	92030	92037	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014926	GCCT	2	8	95153	95160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014926	ATA	2	6	95174	95179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014926	TTA	2	6	95828	95833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014926	TCC	2	6	97070	97075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014926	TC	3	6	97152	97157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014926	TAAA	2	8	97193	97200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014926	T	6	6	97215	97220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014926	A	6	6	97248	97253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014926	TCCC	2	8	97274	97281	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_014926	CGG	2	6	97365	97370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014926	G	6	6	97406	97411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014926	GCTCT	2	10	105459	105468	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014926	CT	3	6	105588	105593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014926	GGCCC	2	10	105620	105629	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_014926	TC	3	6	105630	105635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014926	ACT	2	6	105640	105645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014926	CCT	2	6	105704	105709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014926	TAAT	2	8	107123	107130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014926	CTCC	2	8	107786	107793	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_014926	TTA	2	6	107806	107811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014926	T	7	7	107896	107902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014926	CT	3	6	110873	110878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014926	GGA	2	6	113141	113146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014926	TTG	2	6	115067	115072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014926	GAG	2	6	115093	115098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014926	GAG	2	6	115126	115131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014926	TCAGC	2	10	115170	115179	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_014926	GAA	2	6	115224	115229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014926	GAG	2	6	115246	115251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014926	CAA	2	6	115263	115268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014926	GTT	3	9	115359	115367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014926	CCG	2	6	115443	115448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_014926	CCT	2	6	115466	115471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_014926	GCT	2	6	115477	115482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_014926	TTTGAG	2	12	115488	115499	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014926	GGCTC	2	10	115513	115522	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_014926	AGG	2	6	115612	115617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_014926	ATG	2	6	115695	115700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014926	ACC	2	6	115734	115739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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169	NC_014926	GCT	2	6	115796	115801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_014926	GAG	2	6	115896	115901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014926	GGC	2	6	115982	115987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_014926	GTT	2	6	116004	116009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_014926	A	6	6	116286	116291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_014926	CTT	2	6	118408	118413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_014926	AGTTC	2	10	118587	118596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_014926	TCC	2	6	123635	123640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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192	NC_014926	C	6	6	147698	147703	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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273	NC_014926	ATA	2	6	154971	154976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_014926	A	6	6	173028	173033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014926	GA	3	6	173080	173085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014926	TAA	2	6	177957	177962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014926	ATT	2	6	177967	177972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014926	TTCC	2	8	177978	177985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
284	NC_014926	CTTT	2	8	177989	177996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
285	NC_014926	TCC	2	6	180009	180014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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288	NC_014926	CGGGG	2	10	181496	181505	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
289	NC_014926	GAG	2	6	183855	183860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014926	GCCCC	2	10	185687	185696	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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423	NC_014926	AGG	2	6	302410	302415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_014926	T	6	6	313607	313612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_014926	AAT	2	6	313651	313656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_014926	TAAA	2	8	351987	351994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_014926	TA	3	6	368799	368804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014926	CCCG	2	8	369385	369392	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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