MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 3425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014804	AC	3	6	880165	880170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_014804	TTTCT	2	10	880538	880547	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1503	NC_014804	TC	3	6	880571	880576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_014804	AAT	2	6	880668	880673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014804	TACC	2	8	880730	880737	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_014804	CAA	2	6	880776	880781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_014804	A	7	7	880828	880834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014804	A	6	6	880914	880919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014804	CAT	2	6	880940	880945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_014804	TAA	2	6	880957	880962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014804	CCA	2	6	880967	880972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_014804	AGAAC	2	10	880976	880985	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_014804	TAAT	2	8	881008	881015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014804	GA	3	6	881035	881040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014804	ACC	2	6	881075	881080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_014804	AAT	2	6	881142	881147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014804	GCA	2	6	881148	881153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_014804	ATT	2	6	881230	881235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014804	CTA	2	6	881264	881269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_014804	TAA	2	6	881273	881278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014804	AATC	2	8	881301	881308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_014804	TA	3	6	881345	881350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014804	A	6	6	881357	881362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014804	ATT	2	6	881368	881373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014804	GA	3	6	881425	881430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014804	AGG	2	6	881489	881494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014804	GTT	2	6	883286	883291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014804	CGG	2	6	884667	884672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_014804	GGT	2	6	884677	884682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014804	GC	3	6	884694	884699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_014804	CTTC	2	8	884745	884752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_014804	CAAG	2	8	884801	884808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_014804	TTCA	2	8	884814	884821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_014804	TTCAA	2	10	884841	884850	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1535	NC_014804	T	6	6	884869	884874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_014804	AGGTG	2	10	885385	885394	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014804	TAA	2	6	885407	885412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_014804	TGG	2	6	885434	885439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014804	GTT	2	6	885902	885907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014804	T	6	6	885938	885943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014804	GAAG	2	8	885949	885956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014804	AG	3	6	886380	886385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014804	TTG	2	6	886950	886955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014804	CTT	2	6	886957	886962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_014804	CAT	2	6	887047	887052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1547	NC_014804	GAAGA	2	10	888480	888489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_014804	CAAA	2	8	891001	891008	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_014804	GAAGC	2	10	891088	891097	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_014804	T	6	6	891247	891252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_014804	AGGG	2	8	891276	891283	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_014804	TAA	2	6	891284	891289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014804	TA	3	6	891310	891315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014804	T	6	6	891320	891325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014804	GTG	2	6	891337	891342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014804	AAAAG	2	10	892458	892467	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014804	AAG	2	6	893701	893706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014804	AACC	2	8	893715	893722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_014804	ATT	2	6	893731	893736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014804	A	7	7	895709	895715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014804	ACT	2	6	895717	895722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_014804	TAAC	2	8	895733	895740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_014804	TAA	2	6	896080	896085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014804	TCCT	2	8	897242	897249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_014804	CTT	2	6	897317	897322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014804	TGC	2	6	897363	897368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1568	NC_014804	AT	3	6	897400	897405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_014804	A	7	7	897457	897463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014804	AG	3	6	897471	897476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_014804	TC	3	6	899730	899735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_014804	A	6	6	899783	899788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014804	TAA	2	6	899790	899795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014804	T	6	6	899809	899814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1580	NC_014804	TATC	2	8	905260	905267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_014804	TA	3	6	907418	907423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014804	AT	3	6	907432	907437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014804	ATT	2	6	907450	907455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014804	GTA	2	6	907510	907515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1590	NC_014804	ATG	2	6	911124	911129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_014804	GA	3	6	914169	914174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014804	GAA	2	6	914200	914205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014804	ATAA	2	8	914283	914290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014804	CTTT	2	8	915939	915946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_014804	TA	4	8	921267	921274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_014804	TTA	2	6	921826	921831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014804	T	6	6	921907	921912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_014804	ATTTC	2	10	923972	923981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1608	NC_014804	A	6	6	924028	924033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014804	GAT	2	6	925312	925317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014804	TGA	2	6	925339	925344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014804	AGA	2	6	925507	925512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_014804	TAT	2	6	925522	925527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_014804	GAA	2	6	929177	929182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014804	CT	3	6	930641	930646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1617	NC_014804	A	6	6	930723	930728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014804	TAAT	2	8	933464	933471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014804	TAAA	2	8	933482	933489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014804	GA	3	6	934549	934554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014804	AAT	2	6	934564	934569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1623	NC_014804	CAA	2	6	935869	935874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_014804	AGA	2	6	935951	935956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_014804	AGGT	2	8	935998	936005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_014804	C	6	6	936020	936025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1627	NC_014804	CAC	3	9	936033	936041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1630	NC_014804	CCA	2	6	937877	937882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_014804	CAA	2	6	939976	939981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_014804	CAA	2	6	940023	940028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_014804	AAAACA	2	12	940119	940130	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1634	NC_014804	AAG	2	6	940136	940141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_014804	TTG	2	6	941074	941079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_014804	AG	3	6	941142	941147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_014804	TCC	2	6	941157	941162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1907	NC_014804	ATC	2	6	1118485	1118490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1908	NC_014804	C	6	6	1118490	1118495	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1909	NC_014804	AT	3	6	1118559	1118564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_014804	AAT	2	6	1119098	1119103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1911	NC_014804	A	6	6	1119114	1119119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1912	NC_014804	ATT	2	6	1119126	1119131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_014804	T	6	6	1119139	1119144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_014804	T	6	6	1119149	1119154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_014804	TAT	2	6	1119163	1119168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1931	NC_014804	AAAAG	2	10	1129752	1129761	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_014804	ATA	2	6	1129765	1129770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1939	NC_014804	ATT	2	6	1133484	1133489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1950	NC_014804	A	6	6	1139631	1139636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_014804	CTG	2	6	1139638	1139643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1975	NC_014804	TGG	2	6	1149771	1149776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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