MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 3425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014804	AT	3	6	628136	628141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014804	AGAAA	2	10	632113	632122	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014804	ACC	2	6	633578	633583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_014804	AGA	2	6	633600	633605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014804	TTA	2	6	633639	633644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014804	GGT	2	6	635697	635702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014804	T	6	6	636486	636491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014804	ACT	2	6	637276	637281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_014804	TC	3	6	637290	637295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_014804	TGA	2	6	637370	637375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014804	CCA	2	6	640170	640175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_014804	TATT	2	8	640197	640204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014804	T	7	7	640203	640209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014804	TTG	2	6	640211	640216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014804	TTCAAA	2	12	640218	640229	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1016	NC_014804	A	6	6	640250	640255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014804	T	6	6	641556	641561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014804	TC	3	6	642448	642453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_014804	T	6	6	642463	642468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014804	AG	3	6	642529	642534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014804	TACT	2	8	642541	642548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_014804	ATT	2	6	647214	647219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014804	TGG	2	6	647243	647248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014804	ATC	2	6	648845	648850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014804	GTA	2	6	648861	648866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014804	T	6	6	648884	648889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014804	TA	3	6	648905	648910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014804	GGT	2	6	648950	648955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014804	AGA	2	6	649843	649848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014804	ACC	2	6	652556	652561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_014804	ACC	2	6	652591	652596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_014804	GAAG	2	8	652642	652649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014804	AGG	2	6	652657	652662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014804	TAC	2	6	653072	653077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_014804	TTCT	2	8	653081	653088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_014804	CTT	2	6	653093	653098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_014804	ATC	2	6	653816	653821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_014804	TCA	2	6	653843	653848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_014804	CTT	2	6	654744	654749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014804	T	6	6	654748	654753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014804	TGG	2	6	654828	654833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014804	GCCC	2	8	654902	654909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1043	NC_014804	TGG	2	6	654915	654920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014804	CCGG	2	8	654922	654929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_014804	GGC	2	6	654960	654965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014804	AGTT	2	8	655016	655023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014804	ACC	2	6	655745	655750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_014804	AT	3	6	657416	657421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014804	TTC	2	6	659488	659493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014804	TCC	2	6	659494	659499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_014804	A	6	6	659522	659527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014804	CCT	2	6	661410	661415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_014804	T	6	6	661450	661455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014804	GGT	2	6	661506	661511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014804	TTTTG	2	10	661534	661543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014804	C	6	6	661659	661664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1057	NC_014804	TGGA	2	8	661765	661772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014804	ACC	2	6	662403	662408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_014804	ATT	2	6	666156	666161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014804	TG	3	6	666174	666179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014804	ACA	2	6	666194	666199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014804	ACC	2	6	668321	668326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_014804	AT	3	6	668344	668349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014804	TA	3	6	668362	668367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014804	T	6	6	668370	668375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014804	TGCA	2	8	668447	668454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_014804	CAA	2	6	668502	668507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_014804	CAA	2	6	668521	668526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014804	AAG	3	9	668552	668560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014804	T	6	6	672268	672273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014804	TGGG	2	8	672286	672293	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014804	AAC	2	6	673211	673216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_014804	ATG	2	6	674915	674920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014804	GGT	2	6	674974	674979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014804	TTCTT	2	10	675688	675697	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1076	NC_014804	AT	3	6	677171	677176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014804	TAAA	2	8	677711	677718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014804	TGA	2	6	677777	677782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014804	GGGAA	2	10	677791	677800	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014804	GAT	2	6	677801	677806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014804	TTC	2	6	678686	678691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014804	CAT	2	6	678713	678718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_014804	ATG	2	6	678756	678761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014804	ATA	2	6	678767	678772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014804	ATA	2	6	678795	678800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014804	CCA	2	6	679896	679901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_014804	GGT	2	6	680633	680638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014804	TCACC	2	10	681418	681427	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1089	NC_014804	CAT	2	6	682487	682492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014804	A	6	6	682494	682499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014804	CAC	2	6	683028	683033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_014804	ATT	2	6	683043	683048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014804	TAT	2	6	683075	683080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014804	TCA	2	6	683261	683266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_014804	ATT	2	6	684373	684378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014804	A	6	6	684483	684488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014804	AGC	2	6	684526	684531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014804	CAT	2	6	684541	684546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014804	TAA	2	6	684559	684564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014804	T	7	7	685748	685754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014804	CAT	2	6	685758	685763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014804	CCA	2	6	685767	685772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_014804	ATT	2	6	685778	685783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014804	TAA	2	6	685786	685791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014804	AT	3	6	685797	685802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014804	T	6	6	685809	685814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014804	TGTT	2	8	685839	685846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014804	TTG	2	6	685877	685882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014804	AAG	2	6	685964	685969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014804	A	6	6	687003	687008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014804	ATT	2	6	687511	687516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014804	AG	3	6	687557	687562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014804	TGT	2	6	687607	687612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014804	TTA	2	6	687618	687623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014804	A	6	6	687637	687642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014804	ATTT	2	8	687659	687666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014804	ATATTT	2	12	687683	687694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014804	GGT	2	6	687765	687770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014804	TCT	2	6	689637	689642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014804	GGT	2	6	689962	689967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014804	GATT	2	8	689975	689982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014804	AAC	2	6	690023	690028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014804	TGA	2	6	690047	690052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014804	GTA	2	6	691806	691811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014804	GAT	2	6	691906	691911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014804	AGT	2	6	691921	691926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014804	TGTT	2	8	692269	692276	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014804	AC	3	6	692291	692296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_014804	GAT	2	6	692338	692343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014804	TGA	2	6	692366	692371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014804	AGG	2	6	692407	692412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014804	AAG	2	6	694567	694572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014804	ACC	2	6	695461	695466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_014804	CAA	2	6	696912	696917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_014804	TTA	2	6	699863	699868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_014804	AT	3	6	844493	844498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1473	NC_014804	TCT	2	6	862897	862902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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