MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 11022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014410	A	6	6	35	40	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014410	TTG	2	6	51	56	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014410	T	9	9	60	68	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014410	ATAA	2	8	109	116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014410	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014410	AGG	2	6	150	155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014410	TAA	2	6	1506	1511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014410	TAA	2	6	1517	1522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014410	ATT	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014410	T	8	8	1528	1535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014410	TTG	2	6	1540	1545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014410	TAA	2	6	1553	1558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014410	TAT	2	6	1646	1651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014410	TAC	3	9	1652	1660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014410	TA	4	8	1667	1674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014410	T	6	6	1712	1717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014410	ACC	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014410	TTATT	2	10	6609	6618	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014410	TAT	2	6	6631	6636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014410	TAAAA	2	10	6652	6661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014410	TGA	2	6	6672	6677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014410	ATT	2	6	6681	6686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014410	A	7	7	6730	6736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014410	ATT	2	6	11156	11161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014410	AAG	2	6	11170	11175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014410	AT	5	10	11197	11206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014410	CCT	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014410	ATTAAA	2	12	12214	12225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014410	A	8	8	12223	12230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014410	T	7	7	12235	12241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014410	T	6	6	12258	12263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014410	TTTA	2	8	12282	12289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014410	A	6	6	12298	12303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014410	TAA	2	6	12321	12326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014410	TAA	2	6	12356	12361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014410	GAT	2	6	12381	12386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014410	AG	3	6	12412	12417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014410	GGT	2	6	12420	12425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014410	TGC	2	6	12426	12431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014410	AT	3	6	12448	12453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014410	AGT	2	6	12467	12472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014410	GGT	2	6	12569	12574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014410	T	7	7	12612	12618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014410	TTG	2	6	19834	19839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014410	AGG	2	6	19844	19849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014410	TTA	2	6	21519	21524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014410	ATATA	2	10	21533	21542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014410	A	6	6	21542	21547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014410	CGG	2	6	21592	21597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014410	AAG	2	6	21662	21667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014410	TTA	2	6	23470	23475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014410	ATT	2	6	24706	24711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014410	A	6	6	26297	26302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014410	CCT	2	6	26305	26310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014410	TAT	2	6	26317	26322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014410	CAAT	2	8	26350	26357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014410	ATT	2	6	26569	26574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014410	TA	3	6	26576	26581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014410	ATT	2	6	26585	26590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014410	TA	3	6	26599	26604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014410	TA	3	6	26606	26611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014410	ATA	2	6	26664	26669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014410	A	6	6	26683	26688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014410	GTATA	2	10	27258	27267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014410	ATTT	2	8	27268	27275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014410	AAG	2	6	27284	27289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014410	AAT	2	6	27302	27307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014410	TAT	2	6	27311	27316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014410	AG	3	6	27322	27327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014410	TGG	3	9	27329	27337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014410	TAA	2	6	27384	27389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014410	TGA	2	6	27413	27418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014410	T	6	6	27423	27428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014410	AGG	2	6	27490	27495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014410	ATT	2	6	28809	28814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014410	TAATA	2	10	28950	28959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014410	CCT	2	6	29058	29063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014410	CATA	2	8	29071	29078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014410	T	7	7	29085	29091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014410	ATTAA	3	15	29095	29109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014410	T	6	6	29264	29269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014410	AT	3	6	30511	30516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014410	TATT	2	8	30542	30549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014410	ATTTA	2	10	30567	30576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014410	ATA	2	6	30599	30604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014410	AAATAA	2	12	30605	30616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014410	T	6	6	30635	30640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014410	TA	3	6	30656	30661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014410	TAA	2	6	30665	30670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014410	TGG	2	6	33469	33474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014410	ATTTT	2	10	33478	33487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014410	T	6	6	33484	33489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014410	CTAATT	2	12	34131	34142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014410	T	6	6	34171	34176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014410	AGG	2	6	34179	34184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014410	CAG	2	6	34801	34806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014410	GGA	2	6	34838	34843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014410	ATA	2	6	34908	34913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014410	CTT	2	6	34977	34982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014410	TAT	2	6	35054	35059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014410	TTA	2	6	35250	35255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014410	GTC	2	6	35288	35293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014410	ATT	2	6	35427	35432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014410	ATT	2	6	35468	35473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014410	TGC	2	6	35519	35524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014410	AAAT	2	8	35545	35552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014410	T	6	6	35556	35561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014410	GAT	2	6	35605	35610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014410	TA	3	6	35619	35624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014410	A	6	6	35711	35716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014410	TCTT	2	8	35721	35728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014410	AGG	2	6	35734	35739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014410	T	6	6	35741	35746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014410	AATT	2	8	35759	35766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014410	AAT	2	6	35788	35793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014410	TAA	2	6	36616	36621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014410	T	6	6	36631	36636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014410	CTA	2	6	36643	36648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014410	AAT	2	6	36687	36692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014410	CAA	2	6	36699	36704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014410	TAT	3	9	36729	36737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014410	A	6	6	36749	36754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014410	TTAA	2	8	36769	36776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014410	TTA	2	6	36796	36801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014410	TAA	2	6	36808	36813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014410	T	6	6	36856	36861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014410	GAA	2	6	36892	36897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014410	A	6	6	36952	36957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014410	AT	3	6	36972	36977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014410	A	6	6	36979	36984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014410	ATT	2	6	36992	36997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014410	AATTAA	2	12	37014	37025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014410	ATT	2	6	38204	38209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014410	AAG	2	6	38212	38217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014410	TAAA	2	8	39448	39455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014410	AAAATA	2	12	39496	39507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014410	AACA	2	8	39521	39528	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014410	GAAA	2	8	39552	39559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014410	CAA	2	6	39621	39626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014410	TTG	2	6	39639	39644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014410	AAT	2	6	39654	39659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014410	A	6	6	39674	39679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014410	TTA	2	6	39766	39771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014410	TGA	2	6	39807	39812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014410	TGC	2	6	39950	39955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014410	TAA	2	6	39957	39962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014410	GTA	2	6	40047	40052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014410	AAG	2	6	40082	40087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014410	TTA	2	6	40119	40124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014410	TA	3	6	41476	41481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014410	TTAA	2	8	41512	41519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014410	ATT	2	6	41540	41545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014410	TAG	2	6	41568	41573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014410	AGT	2	6	41661	41666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014410	AGT	2	6	41713	41718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014410	CAT	2	6	41798	41803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_014410	TCA	2	6	42441	42446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_014410	TAG	2	6	42568	42573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_014410	AGA	2	6	42602	42607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014410	ATA	2	6	42644	42649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_014410	T	8	8	49738	49745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014410	TAA	2	6	49797	49802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_014410	AATA	2	8	51608	51615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_014410	GAGG	2	8	51698	51705	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_014410	A	6	6	72980	72985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_014410	GAG	2	6	73025	73030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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