MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 chromosome

Total Repeats: 11022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014410	AAC	2	6	172532	172537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014410	TAAA	2	8	172555	172562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014410	AT	3	6	172576	172581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014410	ATG	2	6	172642	172647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014410	A	6	6	172667	172672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014410	GA	3	6	172695	172700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014410	GGT	2	6	172720	172725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014410	TAT	2	6	173349	173354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014410	CTC	2	6	173355	173360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_014410	AT	3	6	173374	173379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014410	TAT	2	6	173431	173436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014410	ATC	2	6	173440	173445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_014410	GATT	2	8	173487	173494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014410	GTTAT	2	10	173570	173579	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014410	A	6	6	176137	176142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014410	AAT	2	6	176150	176155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014410	TTC	2	6	176236	176241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_014410	GCA	2	6	176247	176252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014410	AAG	2	6	176320	176325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014410	TGA	2	6	176329	176334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014410	AT	3	6	176345	176350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014410	CAG	2	6	176380	176385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_014410	A	6	6	176389	176394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014410	CAG	2	6	176421	176426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014410	TTG	2	6	176472	176477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014410	CAT	2	6	176505	176510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014410	TTAA	2	8	176522	176529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014410	T	6	6	176587	176592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014410	AT	3	6	176641	176646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014410	T	7	7	176646	176652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014410	AT	3	6	176668	176673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014410	GCA	2	6	176684	176689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_014410	A	7	7	176699	176705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014410	T	6	6	176777	176782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014410	T	7	7	176797	176803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014410	TC	3	6	176806	176811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_014410	CTTTT	2	10	176825	176834	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_014410	CAT	2	6	176851	176856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_014410	ATA	2	6	176873	176878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014410	AT	3	6	176954	176959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014410	AAGC	2	8	176997	177004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_014410	AAG	2	6	177015	177020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014410	ATA	2	6	177025	177030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014410	CAT	2	6	177038	177043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014410	TTC	2	6	177045	177050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014410	ATTC	2	8	177164	177171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_014410	TTA	2	6	177205	177210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014410	TCAT	2	8	177217	177224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_014410	CTT	2	6	177233	177238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014410	TTTG	2	8	177325	177332	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014410	ATA	2	6	177339	177344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014410	T	7	7	177392	177398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014410	A	6	6	177437	177442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014410	TAT	2	6	177452	177457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014410	TAAAAA	2	12	177500	177511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014410	T	6	6	177569	177574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014410	CTAT	2	8	177575	177582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_014410	CATTC	2	10	177615	177624	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1059	NC_014410	TTTC	2	8	177659	177666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_014410	GAA	2	6	177680	177685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014410	TC	3	6	177690	177695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_014410	CAAA	2	8	177727	177734	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_014410	AT	3	6	177767	177772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014410	TGA	2	6	177783	177788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014410	ATT	2	6	177812	177817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014410	ATT	2	6	177841	177846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014410	TTTG	2	8	177862	177869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014410	TCT	2	6	177875	177880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014410	TTA	2	6	177881	177886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014410	CATT	2	8	177888	177895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_014410	TGGA	2	8	177928	177935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014410	TATTT	2	10	177945	177954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014410	CCT	2	6	178632	178637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_014410	TTATA	2	10	178667	178676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014410	TC	3	6	178713	178718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_014410	A	6	6	178777	178782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014410	CCTT	2	8	178826	178833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_014410	ATT	2	6	178836	178841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014410	A	6	6	178890	178895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014410	ATTA	2	8	178898	178905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014410	CTT	2	6	178910	178915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014410	TTC	2	6	178953	178958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_014410	ATTGG	2	10	179022	179031	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014410	AAT	2	6	179104	179109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014410	TTG	2	6	179115	179120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014410	CAA	2	6	179209	179214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_014410	AAT	2	6	179215	179220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014410	A	7	7	179229	179235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014410	A	6	6	179299	179304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014410	A	7	7	180767	180773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014410	A	6	6	180835	180840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014410	TTAGGG	2	12	180867	180878	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014410	AT	3	6	180910	180915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_014410	A	6	6	180959	180964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014410	T	6	6	180995	181000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014410	T	6	6	181007	181012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014410	A	6	6	181013	181018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014410	ACTT	2	8	181057	181064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_014410	T	6	6	181104	181109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014410	TAAC	2	8	181126	181133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_014410	CCTT	2	8	181144	181151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_014410	AGGTAA	2	12	181175	181186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014410	ATT	3	9	181188	181196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014410	TAA	2	6	181202	181207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014410	GAA	2	6	181225	181230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014410	ATT	2	6	181309	181314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014410	TA	4	8	181321	181328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014410	AT	3	6	181332	181337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014410	AGT	2	6	181354	181359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014410	T	6	6	181378	181383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014410	ATT	2	6	181387	181392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014410	TCT	2	6	181409	181414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014410	ATA	2	6	181419	181424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014410	ATTAT	2	10	181450	181459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014410	TCTG	2	8	181491	181498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_014410	AAC	2	6	181503	181508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_014410	AT	4	8	182047	182054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014410	TAA	2	6	182072	182077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014410	ATT	2	6	182122	182127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014410	TAT	2	6	182440	182445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014410	TA	3	6	182460	182465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014410	AGG	2	6	182556	182561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014410	CGA	2	6	182563	182568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014410	TAA	2	6	182569	182574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014410	T	6	6	182585	182590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014410	CAT	2	6	182594	182599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_014410	CTT	2	6	182610	182615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_014410	TA	3	6	182642	182647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014410	TAA	2	6	182677	182682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014410	TCTT	2	8	182735	182742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_014410	TCA	2	6	182786	182791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014410	TCA	2	6	182813	182818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_014410	TTAT	2	8	182830	182837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014410	GTT	2	6	182881	182886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014410	T	7	7	182893	182899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014410	CAT	2	6	182959	182964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_014410	T	6	6	182984	182989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1158	NC_014410	GGT	2	6	188275	188280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1179	NC_014410	T	8	8	194908	194915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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