MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermosediminibacter oceani DSM 16646 chromosome

Total Repeats: 7400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014377	TTA	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014377	CTTT	2	8	71	78	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014377	T	6	6	76	81	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014377	GAG	2	6	88	93	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014377	TTA	2	6	95	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014377	AT	3	6	1494	1499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014377	AT	3	6	1516	1521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014377	TAA	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014377	ACA	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014377	TTC	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014377	CA	3	6	1604	1609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014377	TAC	4	12	1634	1645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014377	A	6	6	1655	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014377	TTTA	2	8	9492	9499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014377	TAT	2	6	9533	9538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014377	AT	3	6	14074	14079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014377	TTA	2	6	14080	14085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014377	AGG	2	6	14122	14127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014377	GGT	2	6	14838	14843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014377	T	8	8	14855	14862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014377	ATA	2	6	14898	14903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014377	AAATA	2	10	14904	14913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014377	T	7	7	14927	14933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014377	ATA	2	6	14937	14942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014377	GGA	2	6	14946	14951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014377	TGC	2	6	15840	15845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014377	CCT	2	6	16837	16842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014377	TAT	2	6	16869	16874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014377	TAC	2	6	16902	16907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014377	TAA	2	6	16938	16943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014377	TCC	2	6	19286	19291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014377	AAAT	2	8	19295	19302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014377	CAG	2	6	19451	19456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014377	TA	3	6	19458	19463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014377	ATT	2	6	19477	19482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014377	AT	6	12	19483	19494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014377	TTTTAA	2	12	19517	19528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014377	TCA	2	6	19552	19557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014377	CTC	2	6	20132	20137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014377	TAT	2	6	20171	20176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014377	AAGA	2	8	20236	20243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014377	CTTT	2	8	20304	20311	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014377	ATTTT	2	10	20325	20334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014377	ATT	2	6	20354	20359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014377	TTGC	2	8	20368	20375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014377	AAAG	2	8	20380	20387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014377	GTA	2	6	22206	22211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014377	TAAAAA	2	12	22222	22233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014377	AGAGA	2	10	22234	22243	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014377	TCT	2	6	22252	22257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014377	T	6	6	22535	22540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014377	T	6	6	22614	22619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014377	AT	3	6	25531	25536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014377	TAT	2	6	25548	25553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014377	AG	3	6	25608	25613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014377	TGAAA	2	10	25676	25685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014377	GGT	2	6	25742	25747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014377	T	6	6	25785	25790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014377	GGGA	2	8	25833	25840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014377	AAC	2	6	28574	28579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014377	TGC	2	6	28598	28603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014377	ATCAAA	2	12	28629	28640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014377	AT	3	6	30169	30174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014377	T	6	6	31487	31492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014377	AC	3	6	31511	31516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014377	GTA	2	6	31538	31543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014377	GAG	2	6	31573	31578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014377	GTG	2	6	32451	32456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014377	T	8	8	33905	33912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014377	TAA	2	6	33992	33997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014377	T	8	8	34320	34327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014377	T	6	6	34332	34337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014377	CCTG	2	8	34350	34357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014377	TA	3	6	34363	34368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014377	G	6	6	34392	34397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014377	AG	3	6	35474	35479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014377	AGG	2	6	35575	35580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014377	ATT	2	6	36271	36276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014377	TG	3	6	36282	36287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014377	TTA	2	6	36396	36401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014377	T	6	6	36900	36905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014377	T	6	6	36936	36941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014377	AT	4	8	36968	36975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014377	AGT	2	6	36983	36988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014377	T	6	6	38679	38684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014377	ATA	2	6	38705	38710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014377	GAGG	2	8	39601	39608	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014377	TG	3	6	42277	42282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014377	AT	3	6	42285	42290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014377	GA	3	6	42316	42321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014377	T	6	6	45467	45472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014377	AT	3	6	45490	45495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014377	T	6	6	45801	45806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014377	A	7	7	45829	45835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014377	AGG	2	6	48269	48274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014377	CTTTT	2	10	48937	48946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014377	AAAT	2	8	49581	49588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014377	T	6	6	49916	49921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014377	A	6	6	50012	50017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014377	A	7	7	50023	50029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014377	TTC	2	6	50176	50181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014377	CCT	2	6	50244	50249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014377	CGG	2	6	50271	50276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014377	GCG	2	6	50300	50305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014377	CGA	2	6	50412	50417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014377	CCCG	2	8	50436	50443	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_014377	AAC	2	6	50461	50466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014377	CTG	2	6	50500	50505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014377	CAA	2	6	50541	50546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014377	GCC	2	6	50554	50559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014377	AAC	2	6	50638	50643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014377	CTTC	2	8	50712	50719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014377	CTGG	2	8	50763	50770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014377	AAT	3	9	50808	50816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014377	GGA	2	6	50827	50832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014377	GGC	2	6	50896	50901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014377	GGGC	2	8	50933	50940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014377	GCA	2	6	50963	50968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014377	GGC	2	6	50998	51003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014377	CCG	2	6	51035	51040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014377	TCCT	2	8	51046	51053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014377	TGC	2	6	51065	51070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014377	AGGAAG	2	12	51086	51097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014377	GCA	2	6	51106	51111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014377	CAG	2	6	51112	51117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014377	A	6	6	51159	51164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014377	CGGC	2	8	51166	51173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014377	CGG	2	6	51201	51206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014377	GAG	2	6	51240	51245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014377	GGT	2	6	51276	51281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014377	AT	3	6	51380	51385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014377	AAC	2	6	51403	51408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014377	ACG	2	6	51416	51421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014377	A	6	6	51439	51444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014377	ATA	2	6	51460	51465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014377	GCA	2	6	51476	51481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014377	T	6	6	51495	51500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014377	A	7	7	53608	53614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014377	GAAAA	2	10	53615	53624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014377	A	7	7	53627	53633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014377	CGG	2	6	53709	53714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014377	CCT	2	6	53715	53720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_014377	AGG	2	6	53726	53731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014377	TA	3	6	53749	53754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014377	AGC	2	6	53765	53770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014377	GGA	2	6	53772	53777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014377	GAC	2	6	53784	53789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014377	TA	3	6	53791	53796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014377	AAAGA	2	10	53836	53845	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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