MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 chromosome

Total Repeats: 7922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014158	AGC	2	6	880814	880819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_014158	GGC	2	6	882114	882119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_014158	GCA	2	6	882137	882142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_014158	AGC	2	6	882151	882156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_014158	ATC	2	6	882159	882164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_014158	AGG	2	6	882247	882252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_014158	CCCA	2	8	882262	882269	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2008	NC_014158	GAGG	2	8	882314	882321	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_014158	GCG	2	6	882323	882328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_014158	CAG	2	6	882338	882343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_014158	CCG	2	6	882346	882351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_014158	CCA	2	6	882358	882363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2013	NC_014158	TGGG	2	8	882480	882487	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_014158	GAT	2	6	882509	882514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_014158	CAG	2	6	882551	882556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_014158	GGCGGT	2	12	882580	882591	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2017	NC_014158	CAC	2	6	882617	882622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2018	NC_014158	GAT	2	6	882632	882637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_014158	CAC	2	6	882651	882656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2020	NC_014158	TTG	2	6	882678	882683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_014158	CAC	2	6	882686	882691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_014158	AGC	2	6	882735	882740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_014158	CAG	2	6	882800	882805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_014158	CGC	3	9	882808	882816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2025	NC_014158	AGC	2	6	882828	882833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_014158	ACC	2	6	882859	882864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2029	NC_014158	GCG	3	9	882907	882915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_014158	GT	3	6	884505	884510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_014158	GCC	2	6	884514	884519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_014158	ACCCGG	2	12	884525	884536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2033	NC_014158	ACCGA	2	10	884612	884621	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2034	NC_014158	GGCA	2	8	885606	885613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2035	NC_014158	CTGC	2	8	885629	885636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2036	NC_014158	CCA	2	6	885651	885656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2037	NC_014158	CGC	2	6	894907	894912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2038	NC_014158	GTC	2	6	894919	894924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_014158	GTG	2	6	902730	902735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_014158	CAA	3	9	905348	905356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_014158	TATG	2	8	905357	905364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_014158	AC	4	8	905367	905374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2043	NC_014158	CGG	3	9	906904	906912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_014158	GC	3	6	909526	909531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_014158	CG	3	6	909532	909537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2046	NC_014158	GGT	2	6	909584	909589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_014158	TTGA	2	8	909632	909639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_014158	AAAT	2	8	910933	910940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_014158	CG	3	6	912872	912877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2050	NC_014158	TCG	2	6	912934	912939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_014158	CCG	2	6	913802	913807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2052	NC_014158	TCC	2	6	914936	914941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2053	NC_014158	CAG	2	6	916248	916253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_014158	CGAT	2	8	916267	916274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2055	NC_014158	CAGA	2	8	916308	916315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2056	NC_014158	CAGCC	2	10	917835	917844	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2057	NC_014158	CGA	2	6	917931	917936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_014158	ACA	2	6	917958	917963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_014158	CA	3	6	917977	917982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2060	NC_014158	CCGCC	2	10	918319	918328	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2061	NC_014158	CGG	2	6	918330	918335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_014158	ACG	2	6	920007	920012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_014158	CGT	3	9	920036	920044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_014158	CGT	2	6	921273	921278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_014158	CGT	2	6	921296	921301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_014158	CCGC	2	8	921306	921313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2067	NC_014158	TCG	2	6	921348	921353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_014158	TTCA	2	8	921400	921407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2069	NC_014158	ACG	2	6	921440	921445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2070	NC_014158	GTAAT	2	10	921481	921490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_014158	CGA	2	6	924187	924192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2073	NC_014158	CCG	2	6	924648	924653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2074	NC_014158	GCCA	2	8	924658	924665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2075	NC_014158	GTG	2	6	927540	927545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_014158	TAG	2	6	927548	927553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2080	NC_014158	CTG	2	6	934272	934277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2083	NC_014158	CGCT	2	8	938241	938248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2089	NC_014158	AGGGG	2	10	944041	944050	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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2092	NC_014158	GCGCC	2	10	950749	950758	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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2094	NC_014158	CCG	2	6	950802	950807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2095	NC_014158	CAG	2	6	950839	950844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2096	NC_014158	TGCG	2	8	951082	951089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2097	NC_014158	TGA	2	6	951111	951116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2099	NC_014158	CG	3	6	951126	951131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2101	NC_014158	CAC	2	6	951205	951210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2102	NC_014158	CGG	2	6	951252	951257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_014158	CGT	2	6	951297	951302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_014158	CGGTG	2	10	951321	951330	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2105	NC_014158	GCT	2	6	951355	951360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2112	NC_014158	CTA	2	6	951684	951689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_014158	GTA	2	6	951695	951700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2115	NC_014158	CGG	2	6	953140	953145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_014158	TCAT	2	8	953183	953190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2117	NC_014158	ATC	2	6	956511	956516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2119	NC_014158	GTCG	3	12	962378	962389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2120	NC_014158	GA	3	6	962489	962494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2123	NC_014158	ACGG	2	8	962591	962598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2124	NC_014158	GGTG	2	8	962608	962615	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_014158	CGG	2	6	962667	962672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2128	NC_014158	GCA	2	6	962771	962776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2130	NC_014158	GTA	2	6	965818	965823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_014158	CGAA	2	8	965825	965832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2132	NC_014158	TCC	2	6	965834	965839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2133	NC_014158	CGA	2	6	967084	967089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_014158	ACC	2	6	967108	967113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2135	NC_014158	CGC	2	6	967186	967191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2136	NC_014158	GCC	2	6	969784	969789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2137	NC_014158	CCG	2	6	969802	969807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2138	NC_014158	TCA	2	6	969818	969823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2140	NC_014158	CAT	2	6	969901	969906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2142	NC_014158	GCC	2	6	969923	969928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2148	NC_014158	AATT	2	8	979635	979642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2235	NC_014158	GC	3	6	1057980	1057985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2251	NC_014158	GTT	2	6	1077796	1077801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_014158	GGTGC	2	10	1077806	1077815	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2253	NC_014158	GTG	2	6	1077851	1077856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_014158	CGG	2	6	1077880	1077885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_014158	GCG	2	6	1077893	1077898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2256	NC_014158	CGG	2	6	1077925	1077930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_014158	ACG	2	6	1077933	1077938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2259	NC_014158	GCC	2	6	1078022	1078027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2260	NC_014158	AGC	2	6	1078093	1078098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2261	NC_014158	CCCG	2	8	1078153	1078160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2262	NC_014158	AGG	3	9	1078188	1078196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_014158	GTC	2	6	1078246	1078251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2265	NC_014158	GATC	2	8	1078294	1078301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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