MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014153	GGC	2	6	1227133	1227138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_014153	CGAC	2	8	1227680	1227687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_014153	TCG	2	6	1227713	1227718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_014153	GAC	2	6	1228882	1228887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_014153	GGA	2	6	1229984	1229989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_014153	AGGTCA	2	12	1233193	1233204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2507	NC_014153	GGGC	2	8	1235650	1235657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2508	NC_014153	AGG	2	6	1237243	1237248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_014153	ATTCA	2	10	1239570	1239579	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2510	NC_014153	AACCA	4	20	1239580	1239599	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2511	NC_014153	ATGCA	2	10	1241289	1241298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2512	NC_014153	TCC	2	6	1242101	1242106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_014153	AAT	2	6	1242112	1242117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_014153	T	7	7	1242168	1242174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_014153	ACA	2	6	1246722	1246727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_014153	CAT	2	6	1246741	1246746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_014153	A	6	6	1246780	1246785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_014153	AGG	2	6	1246797	1246802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_014153	GAC	2	6	1246808	1246813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_014153	TGAA	2	8	1248375	1248382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_014153	A	6	6	1248381	1248386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_014153	AATG	2	8	1249382	1249389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_014153	GTCGG	2	10	1250931	1250940	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2524	NC_014153	GA	4	8	1252203	1252210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_014153	G	6	6	1252223	1252228	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_014153	TGCC	2	8	1256740	1256747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_014153	G	6	6	1258879	1258884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_014153	CGG	2	6	1258889	1258894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_014153	A	6	6	1258903	1258908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_014153	GA	3	6	1258961	1258966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_014153	CCG	2	6	1259769	1259774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_014153	CCAG	2	8	1260056	1260063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_014153	ACG	2	6	1260072	1260077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_014153	GC	3	6	1260079	1260084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_014153	GCA	2	6	1260582	1260587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_014153	GGC	2	6	1260590	1260595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_014153	GCC	2	6	1260604	1260609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2538	NC_014153	CGTTG	2	10	1262671	1262680	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2539	NC_014153	AGC	2	6	1262686	1262691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_014153	CCG	2	6	1262720	1262725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_014153	CTTT	2	8	1268279	1268286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_014153	GGC	2	6	1270693	1270698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_014153	GA	3	6	1270735	1270740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_014153	GTC	2	6	1273087	1273092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_014153	GCG	2	6	1274633	1274638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_014153	GGTGT	2	10	1276682	1276691	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_014153	TTCA	2	8	1277440	1277447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2548	NC_014153	AGTG	2	8	1278324	1278331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_014153	T	6	6	1278562	1278567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_014153	GCTCGC	2	12	1278583	1278594	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_014153	GTC	2	6	1278599	1278604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_014153	AGG	2	6	1278616	1278621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_014153	T	6	6	1278668	1278673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_014153	GCA	2	6	1278696	1278701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_014153	CTT	2	6	1278718	1278723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_014153	GGC	2	6	1278736	1278741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_014153	CCT	2	6	1278781	1278786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2558	NC_014153	CGC	2	6	1278788	1278793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_014153	TGA	2	6	1278905	1278910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_014153	CGT	2	6	1279007	1279012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_014153	GGC	2	6	1279019	1279024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_014153	CAG	2	6	1279082	1279087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_014153	CAC	2	6	1279163	1279168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_014153	CTC	2	6	1279175	1279180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_014153	CAT	2	6	1279262	1279267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2570	NC_014153	GGC	2	6	1279392	1279397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_014153	CG	3	6	1279411	1279416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2572	NC_014153	CTT	2	6	1279418	1279423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_014153	CTG	2	6	1279472	1279477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2587	NC_014153	GCC	2	6	1279980	1279985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2588	NC_014153	ATCCAG	2	12	1280018	1280029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2590	NC_014153	CGG	2	6	1280093	1280098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2592	NC_014153	GCG	2	6	1280147	1280152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_014153	A	6	6	1280906	1280911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_014153	GGTG	2	8	1280921	1280928	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2597	NC_014153	TCG	2	6	1288870	1288875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_014153	GCC	2	6	1289308	1289313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_014153	TGC	2	6	1289344	1289349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_014153	GAC	2	6	1291779	1291784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2604	NC_014153	TCG	2	6	1291868	1291873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2607	NC_014153	TGG	2	6	1291933	1291938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_014153	CGC	2	6	1291960	1291965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2609	NC_014153	GC	3	6	1291964	1291969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2610	NC_014153	GCG	2	6	1291996	1292001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_014153	GAGC	2	8	1292024	1292031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_014153	GC	3	6	1292073	1292078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_014153	CGA	2	6	1292120	1292125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2615	NC_014153	GC	3	6	1292218	1292223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2627	NC_014153	GC	3	6	1292577	1292582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2628	NC_014153	GGC	2	6	1292612	1292617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2764	NC_014153	A	6	6	1401235	1401240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2765	NC_014153	TTG	2	6	1401255	1401260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2767	NC_014153	CG	4	8	1406166	1406173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2768	NC_014153	CTT	2	6	1406187	1406192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2796	NC_014153	TTGCC	2	10	1423246	1423255	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2843	NC_014153	CCG	2	6	1440645	1440650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2872	NC_014153	GCAA	2	8	1452734	1452741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2873	NC_014153	CCCG	2	8	1453703	1453710	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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2877	NC_014153	GGCGTA	2	12	1461474	1461485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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2879	NC_014153	CTTG	2	8	1462391	1462398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2880	NC_014153	A	7	7	1462481	1462487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2881	NC_014153	CT	3	6	1462521	1462526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2882	NC_014153	A	6	6	1462543	1462548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2883	NC_014153	TGG	2	6	1462550	1462555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2884	NC_014153	AGGA	2	8	1462643	1462650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2885	NC_014153	ATT	2	6	1462669	1462674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2886	NC_014153	T	6	6	1462681	1462686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2887	NC_014153	GGGT	2	8	1463414	1463421	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2888	NC_014153	TGC	2	6	1463442	1463447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2889	NC_014153	GGC	2	6	1463462	1463467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2890	NC_014153	GCG	2	6	1463481	1463486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2891	NC_014153	AAATTC	2	12	1463510	1463521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2892	NC_014153	TCC	2	6	1466042	1466047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2894	NC_014153	GTG	2	6	1466131	1466136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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