MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2014	NC_014153	GAGCG	2	10	919630	919639	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2136	NC_014153	GAC	2	6	1005864	1005869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_014153	G	6	6	1007706	1007711	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2138	NC_014153	TTG	2	6	1007714	1007719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_014153	TGT	3	9	1009507	1009515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_014153	CTC	2	6	1009596	1009601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2141	NC_014153	G	6	6	1009602	1009607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_014153	CAGC	2	8	1009617	1009624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2143	NC_014153	CAT	2	6	1010529	1010534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2144	NC_014153	GC	3	6	1010558	1010563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2145	NC_014153	TCT	2	6	1010564	1010569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_014153	GCGG	2	8	1015557	1015564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2147	NC_014153	GAA	2	6	1016990	1016995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2150	NC_014153	CGG	2	6	1019268	1019273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2151	NC_014153	A	7	7	1019991	1019997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2152	NC_014153	TGG	2	6	1020129	1020134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_014153	GGC	2	6	1020142	1020147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2154	NC_014153	GCG	2	6	1020149	1020154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2155	NC_014153	TCGT	2	8	1020171	1020178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2157	NC_014153	CG	3	6	1024232	1024237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2158	NC_014153	CGAG	2	8	1024388	1024395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2159	NC_014153	GGT	2	6	1025359	1025364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2164	NC_014153	CG	3	6	1028073	1028078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2165	NC_014153	GC	3	6	1028103	1028108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2166	NC_014153	G	6	6	1028954	1028959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2167	NC_014153	GAA	2	6	1029824	1029829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2169	NC_014153	AGG	2	6	1031885	1031890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2171	NC_014153	AAGC	2	8	1031911	1031918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2172	NC_014153	GCT	2	6	1031920	1031925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2174	NC_014153	GTT	2	6	1037094	1037099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2184	NC_014153	TCCTG	2	10	1051186	1051195	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2208	NC_014153	ATT	2	6	1061418	1061423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2209	NC_014153	AAT	2	6	1061432	1061437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2210	NC_014153	GCC	2	6	1063323	1063328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2224	NC_014153	TTG	2	6	1066478	1066483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2233	NC_014153	GGC	2	6	1074784	1074789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2243	NC_014153	T	6	6	1089671	1089676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_014153	GGA	2	6	1089695	1089700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2247	NC_014153	CTTTT	2	10	1090622	1090631	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2248	NC_014153	CGCA	2	8	1090634	1090641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2249	NC_014153	CCCAGG	2	12	1092633	1092644	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2250	NC_014153	GGGCT	2	10	1093714	1093723	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2251	NC_014153	CAAA	2	8	1094451	1094458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2252	NC_014153	A	6	6	1094456	1094461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_014153	GTGCA	2	10	1094468	1094477	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2254	NC_014153	CGG	2	6	1094487	1094492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_014153	TGCCG	2	10	1094969	1094978	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2256	NC_014153	TGA	2	6	1095008	1095013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2260	NC_014153	A	6	6	1096734	1096739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2261	NC_014153	GCA	2	6	1096841	1096846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_014153	CCGT	2	8	1096868	1096875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2263	NC_014153	GA	3	6	1097931	1097936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2264	NC_014153	G	6	6	1102428	1102433	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2265	NC_014153	AGC	2	6	1102468	1102473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2266	NC_014153	GGCGCG	2	12	1102475	1102486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2268	NC_014153	TGC	2	6	1102529	1102534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2383	NC_014153	CTA	2	6	1159757	1159762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2385	NC_014153	CTGG	2	8	1159808	1159815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2396	NC_014153	CATGCC	2	12	1160234	1160245	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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2399	NC_014153	GAC	2	6	1160398	1160403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2400	NC_014153	GCA	2	6	1160460	1160465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2401	NC_014153	GCT	2	6	1160475	1160480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2402	NC_014153	TGC	2	6	1160561	1160566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2403	NC_014153	GCG	2	6	1160576	1160581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2404	NC_014153	TGG	2	6	1160639	1160644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2405	NC_014153	CGG	2	6	1160744	1160749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2406	NC_014153	CGC	3	9	1160771	1160779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2407	NC_014153	GC	3	6	1160791	1160796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2408	NC_014153	CAG	2	6	1160826	1160831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2409	NC_014153	ACC	2	6	1160842	1160847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2410	NC_014153	CAACA	2	10	1161744	1161753	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2412	NC_014153	GGT	2	6	1161936	1161941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2413	NC_014153	GAA	2	6	1161997	1162002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2414	NC_014153	ATG	2	6	1162093	1162098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2416	NC_014153	A	6	6	1162527	1162532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2420	NC_014153	TCAAA	2	10	1162726	1162735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2421	NC_014153	CTTG	2	8	1163984	1163991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2422	NC_014153	TCG	2	6	1164039	1164044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2426	NC_014153	AGCA	2	8	1164172	1164179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2427	NC_014153	ACC	2	6	1164254	1164259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2429	NC_014153	GCGCA	2	10	1164448	1164457	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2431	NC_014153	CGAT	2	8	1166012	1166019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2432	NC_014153	TG	3	6	1171432	1171437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2433	NC_014153	CAT	2	6	1181343	1181348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2434	NC_014153	AGCA	2	8	1181421	1181428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2435	NC_014153	GCG	2	6	1181458	1181463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2439	NC_014153	CG	3	6	1182181	1182186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2440	NC_014153	ACA	2	6	1184130	1184135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2441	NC_014153	GCC	2	6	1184138	1184143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2446	NC_014153	C	6	6	1189269	1189274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2453	NC_014153	GCG	2	6	1189476	1189481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2454	NC_014153	GCG	2	6	1189548	1189553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2483	NC_014153	A	7	7	1212799	1212805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_014153	GGC	2	6	1212903	1212908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2491	NC_014153	TCG	2	6	1219849	1219854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2492	NC_014153	TGC	2	6	1219971	1219976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2499	NC_014153	AGC	2	6	1227081	1227086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2500	NC_014153	T	6	6	1227090	1227095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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