MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014153	AGG	2	6	714805	714810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014153	TTG	2	6	714860	714865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014153	CCG	2	6	714882	714887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_014153	CGT	2	6	714925	714930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_014153	TTG	2	6	714989	714994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014153	GAA	2	6	715003	715008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014153	A	6	6	715007	715012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014153	CAAA	2	8	715028	715035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_014153	G	6	6	715131	715136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014153	GCA	2	6	716224	716229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_014153	ATTT	2	8	720399	720406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014153	TTG	2	6	720408	720413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014153	TGA	2	6	720437	720442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014153	GCG	2	6	720509	720514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_014153	CCG	2	6	720553	720558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_014153	GTG	2	6	720610	720615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014153	TGG	2	6	720653	720658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014153	CAA	2	6	720772	720777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_014153	CAT	2	6	720786	720791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_014153	GC	3	6	720809	720814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_014153	AACC	2	8	720988	720995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_014153	GCA	2	6	721028	721033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_014153	CAT	2	6	721046	721051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_014153	CGA	2	6	721061	721066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014153	CCA	2	6	721079	721084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_014153	GTT	2	6	721105	721110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014153	ATT	2	6	721147	721152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014153	TA	3	6	721198	721203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014153	TCA	2	6	721213	721218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_014153	GCA	2	6	721279	721284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_014153	AAC	2	6	721330	721335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_014153	GCAG	2	8	721368	721375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_014153	GACA	2	8	721384	721391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_014153	GTT	2	6	721414	721419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_014153	CGC	2	6	721469	721474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_014153	ACG	2	6	721504	721509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_014153	CGCC	2	8	721523	721530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1538	NC_014153	GGTA	2	8	721551	721558	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014153	GCTTC	2	10	721571	721580	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1540	NC_014153	TGT	2	6	721593	721598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014153	GGCG	2	8	721653	721660	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_014153	GCTGG	2	10	722411	722420	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1543	NC_014153	TGC	2	6	722455	722460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_014153	G	6	6	724776	724781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014153	CGG	2	6	724802	724807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_014153	A	6	6	730493	730498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014153	AAC	2	6	731012	731017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_014153	G	6	6	731049	731054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014153	ATT	2	6	731055	731060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_014153	GGC	2	6	733326	733331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_014153	TTCT	2	8	733345	733352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_014153	TGC	2	6	736474	736479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_014153	GCG	3	9	736492	736500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_014153	CAC	2	6	738789	738794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_014153	GGC	2	6	742977	742982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_014153	TGAA	2	8	743996	744003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014153	AGC	2	6	744017	744022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_014153	GC	3	6	744076	744081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_014153	GAG	2	6	744114	744119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014153	CGC	2	6	745509	745514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_014153	CAC	2	6	745533	745538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_014153	GCG	2	6	747131	747136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_014153	GCC	2	6	747169	747174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_014153	TGC	2	6	747176	747181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_014153	CAT	2	6	749119	749124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014153	T	6	6	749191	749196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014153	TTG	2	6	749218	749223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014153	ATT	2	6	749265	749270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_014153	T	6	6	749336	749341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014153	CTT	2	6	751420	751425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_014153	GT	3	6	752917	752922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014153	GGC	2	6	752926	752931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_014153	AGC	2	6	752944	752949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_014153	CGGG	2	8	752991	752998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_014153	CT	3	6	753063	753068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_014153	TCA	2	6	753164	753169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_014153	AAT	2	6	755254	755259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014153	TTG	2	6	755324	755329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_014153	TGC	2	6	755337	755342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_014153	TTG	2	6	755365	755370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014153	CGC	2	6	755428	755433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_014153	ACG	2	6	755472	755477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_014153	GCG	2	6	755481	755486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_014153	CGCGG	2	10	755570	755579	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1585	NC_014153	T	6	6	755638	755643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014153	GAA	2	6	755648	755653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_014153	GGC	2	6	755656	755661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_014153	GCC	3	9	755677	755685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_014153	CG	3	6	755718	755723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_014153	GC	3	6	755761	755766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_014153	GCCA	2	8	755948	755955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_014153	GC	3	6	756014	756019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_014153	CTG	2	6	756041	756046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_014153	CG	3	6	756087	756092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_014153	GGCGCT	2	12	756100	756111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_014153	CCA	2	6	756129	756134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_014153	TGG	2	6	756174	756179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014153	GC	5	10	756226	756235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_014153	GCT	3	9	756340	756348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_014153	ATG	4	12	756377	756388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014153	AGC	2	6	756405	756410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_014153	CGC	3	9	756428	756436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_014153	CGC	2	6	756454	756459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_014153	GAT	2	6	756460	756465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014153	CGGCC	2	10	756478	756487	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1606	NC_014153	CGA	3	9	756568	756576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_014153	TCA	2	6	756582	756587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_014153	TGC	2	6	756606	756611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_014153	AAG	2	6	756635	756640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014153	GGCC	2	8	756682	756689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_014153	CAT	2	6	756691	756696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_014153	CGA	2	6	756697	756702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_014153	GAC	2	6	756776	756781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_014153	ATC	2	6	756786	756791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_014153	CAG	2	6	756833	756838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_014153	CGA	2	6	756898	756903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_014153	ACG	2	6	756924	756929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_014153	ACT	2	6	756972	756977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_014153	AGC	2	6	756981	756986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_014153	CCG	2	6	757007	757012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_014153	TCGAT	2	10	757014	757023	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1622	NC_014153	ATCA	2	8	757085	757092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_014153	CAGC	2	8	757120	757127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_014153	ACG	2	6	757140	757145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_014153	CGG	2	6	757180	757185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_014153	G	6	6	757230	757235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014153	GC	3	6	757251	757256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_014153	TCA	3	9	757312	757320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_014153	GC	3	6	757336	757341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_014153	GCT	2	6	757361	757366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_014153	TGG	3	9	757426	757434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014153	GC	4	8	757444	757451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_014153	CAT	2	6	757458	757463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1635	NC_014153	CG	4	8	757690	757697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2000	NC_014153	ATG	2	6	904290	904295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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