MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_014153	CCT	2	6	3278196	3278201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7002	NC_014153	TTC	2	6	3278222	3278227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_014153	GTA	2	6	3278229	3278234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_014153	TCG	2	6	3278245	3278250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_014153	CGA	2	6	3278296	3278301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_014153	GAA	2	6	3278404	3278409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_014153	CACTA	2	10	3278418	3278427	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7008	NC_014153	GGA	2	6	3278457	3278462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_014153	CTC	2	6	3278547	3278552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_014153	CCCGCA	2	12	3278597	3278608	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_014153	CG	3	6	3278669	3278674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7012	NC_014153	CAT	2	6	3278821	3278826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_014153	CG	3	6	3278872	3278877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7014	NC_014153	ACC	3	9	3278920	3278928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_014153	GGCCGA	2	12	3278960	3278971	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_014153	CAG	2	6	3278988	3278993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_014153	CA	3	6	3279011	3279016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7018	NC_014153	AGG	2	6	3279025	3279030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_014153	TTCGA	2	10	3279087	3279096	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7020	NC_014153	CTG	3	9	3279110	3279118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_014153	GCT	3	9	3279127	3279135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_014153	TCG	2	6	3279146	3279151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_014153	GATC	2	8	3279239	3279246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7024	NC_014153	GCC	2	6	3285719	3285724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_014153	CGG	2	6	3285747	3285752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_014153	CATTC	2	10	3285785	3285794	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7027	NC_014153	GCC	2	6	3288426	3288431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7028	NC_014153	CGG	2	6	3288457	3288462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_014153	CTG	2	6	3288535	3288540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_014153	TCG	2	6	3288586	3288591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_014153	GATT	2	8	3288604	3288611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_014153	CAA	2	6	3288688	3288693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_014153	A	6	6	3288692	3288697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_014153	CGA	2	6	3288785	3288790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_014153	GCT	2	6	3288799	3288804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_014153	TTGC	2	8	3293141	3293148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7037	NC_014153	CGCTC	2	10	3297293	3297302	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7038	NC_014153	TTG	2	6	3297819	3297824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_014153	GAA	2	6	3298382	3298387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_014153	TC	3	6	3298470	3298475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_014153	TGC	2	6	3298608	3298613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_014153	CCGA	2	8	3298633	3298640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7043	NC_014153	CGGG	2	8	3299895	3299902	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7044	NC_014153	GCA	2	6	3299910	3299915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_014153	GCAA	2	8	3299938	3299945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7046	NC_014153	CAA	2	6	3299956	3299961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_014153	CG	3	6	3300933	3300938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7048	NC_014153	CTC	2	6	3302391	3302396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_014153	A	6	6	3302528	3302533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_014153	AAC	2	6	3302543	3302548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_014153	ACT	2	6	3302630	3302635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_014153	TCG	2	6	3302698	3302703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_014153	ACG	2	6	3302709	3302714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_014153	GCA	2	6	3302721	3302726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_014153	AGC	2	6	3302736	3302741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_014153	CAT	2	6	3302748	3302753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_014153	TGG	2	6	3302763	3302768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_014153	CTG	2	6	3302818	3302823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_014153	AG	3	6	3305428	3305433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_014153	GGGC	2	8	3306978	3306985	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7061	NC_014153	CG	3	6	3307037	3307042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_014153	GCA	2	6	3307074	3307079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_014153	GCCAGG	2	12	3307102	3307113	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_014153	C	6	6	3307114	3307119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7065	NC_014153	GATG	2	8	3307147	3307154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_014153	TGAA	2	8	3307166	3307173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_014153	ACA	2	6	3307823	3307828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_014153	GC	3	6	3308484	3308489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_014153	GGGT	2	8	3308547	3308554	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_014153	ACC	2	6	3308588	3308593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7071	NC_014153	A	6	6	3309215	3309220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_014153	T	6	6	3309242	3309247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_014153	TGC	2	6	3309250	3309255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_014153	GC	3	6	3310763	3310768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_014153	GTT	2	6	3313304	3313309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_014153	ACCG	2	8	3313315	3313322	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7077	NC_014153	GC	3	6	3314600	3314605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7078	NC_014153	GGC	2	6	3314606	3314611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_014153	AGG	2	6	3314647	3314652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_014153	GAC	2	6	3315889	3315894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_014153	TCC	2	6	3316928	3316933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7082	NC_014153	GAT	2	6	3317510	3317515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_014153	GAC	2	6	3317539	3317544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_014153	CG	3	6	3317610	3317615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7085	NC_014153	GGCT	2	8	3318754	3318761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7086	NC_014153	GC	3	6	3318789	3318794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_014153	GCA	2	6	3318894	3318899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_014153	TCT	2	6	3318925	3318930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_014153	T	6	6	3318956	3318961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_014153	CGG	3	9	3321454	3321462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_014153	ACA	2	6	3321478	3321483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_014153	GCA	2	6	3321491	3321496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_014153	TGCAG	2	10	3321527	3321536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7094	NC_014153	GA	3	6	3321558	3321563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_014153	CCT	2	6	3324575	3324580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7096	NC_014153	GCC	2	6	3324595	3324600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7097	NC_014153	CAGC	2	8	3324620	3324627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7098	NC_014153	TCT	2	6	3324656	3324661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_014153	CAA	2	6	3324710	3324715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_014153	GGC	2	6	3324739	3324744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_014153	CAGG	2	8	3324797	3324804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7102	NC_014153	CTG	2	6	3324822	3324827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_014153	CCCCT	2	10	3326117	3326126	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7104	NC_014153	GCC	2	6	3326142	3326147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7105	NC_014153	G	6	6	3326168	3326173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_014153	CCCG	2	8	3326234	3326241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7107	NC_014153	TG	3	6	3329898	3329903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_014153	GC	3	6	3329904	3329909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_014153	GCC	2	6	3329945	3329950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7110	NC_014153	GC	3	6	3330123	3330128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7111	NC_014153	C	7	7	3332072	3332078	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7112	NC_014153	GTG	2	6	3332184	3332189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_014153	GCT	2	6	3332854	3332859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_014153	GC	3	6	3332873	3332878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7115	NC_014153	CGCGC	2	10	3332912	3332921	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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7117	NC_014153	CGC	2	6	3335650	3335655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_014153	CTC	2	6	3339793	3339798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7119	NC_014153	GC	3	6	3339848	3339853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7120	NC_014153	GGGT	2	8	3340970	3340977	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_014153	GCCT	2	8	3341006	3341013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7122	NC_014153	GCT	2	6	3341020	3341025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_014153	TGC	3	9	3341031	3341039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_014153	CGCGC	2	10	3341564	3341573	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7125	NC_014153	GCAC	2	8	3341596	3341603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7126	NC_014153	GCCC	2	8	3341604	3341611	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7127	NC_014153	CTTT	2	8	3342741	3342748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7128	NC_014153	GCG	2	6	3343963	3343968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_014153	TGC	2	6	3343982	3343987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_014153	AGCA	2	8	3344126	3344133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7131	NC_014153	TCC	2	6	3344139	3344144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7133	NC_014153	TGCC	2	8	3344237	3344244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7134	NC_014153	GAAC	2	8	3344255	3344262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7141	NC_014153	GATTT	2	10	3344470	3344479	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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7144	NC_014153	AT	3	6	3344546	3344551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7145	NC_014153	AATC	2	8	3347259	3347266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7153	NC_014153	CG	3	6	3351239	3351244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7263	NC_014153	CGA	2	6	3383679	3383684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7264	NC_014153	GC	3	6	3383686	3383691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7265	NC_014153	GGC	2	6	3383733	3383738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7266	NC_014153	CGGCG	2	10	3383747	3383756	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7267	NC_014153	CGCA	2	8	3383760	3383767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7268	NC_014153	CG	3	6	3383783	3383788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7269	NC_014153	TGG	2	6	3383859	3383864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7270	NC_014153	CG	3	6	3383871	3383876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7271	NC_014153	CTG	2	6	3383905	3383910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7272	NC_014153	CGA	3	9	3383958	3383966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7274	NC_014153	GACG	2	8	3384036	3384043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7277	NC_014153	GC	4	8	3384240	3384247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7278	NC_014153	GC	3	6	3384258	3384263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7279	NC_014153	ACG	2	6	3384290	3384295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7280	NC_014153	GCCA	2	8	3384328	3384335	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7281	NC_014153	GAT	2	6	3384387	3384392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7282	NC_014153	CTG	2	6	3384394	3384399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7284	NC_014153	CGG	2	6	3384528	3384533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7285	NC_014153	GCT	2	6	3384540	3384545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7286	NC_014153	CG	3	6	3384550	3384555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7287	NC_014153	GCC	2	6	3384607	3384612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7290	NC_014153	CCTG	2	8	3384703	3384710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7291	NC_014153	GCC	2	6	3384809	3384814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7292	NC_014153	TTG	2	6	3388711	3388716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7294	NC_014153	CGCA	2	8	3389925	3389932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7295	NC_014153	GTC	2	6	3390673	3390678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7299	NC_014153	TGGC	2	8	3390747	3390754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7300	NC_014153	AAGC	2	8	3390760	3390767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7301	NC_014153	GCA	2	6	3390774	3390779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7302	NC_014153	CCGC	2	8	3390814	3390821	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7303	NC_014153	TTC	2	6	3390832	3390837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7304	NC_014153	CGGA	2	8	3390882	3390889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7305	NC_014153	CG	3	6	3393337	3393342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7306	NC_014153	TGCG	2	8	3393346	3393353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7307	NC_014153	TGT	2	6	3395065	3395070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7308	NC_014153	GC	3	6	3395121	3395126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7309	NC_014153	TCA	2	6	3395205	3395210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7313	NC_014153	CAG	3	9	3395492	3395500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7317	NC_014153	CG	3	6	3396312	3396317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7318	NC_014153	A	6	6	3396321	3396326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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