MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014153	CTGCG	2	10	2311254	2311263	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5002	NC_014153	CGG	2	6	2311306	2311311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_014153	CGT	2	6	2315273	2315278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_014153	GAA	2	6	2315307	2315312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014153	TCC	2	6	2316318	2316323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_014153	CG	3	6	2316370	2316375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_014153	A	6	6	2316405	2316410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014153	TGT	2	6	2316432	2316437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014153	TC	3	6	2316480	2316485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_014153	CGCC	2	8	2316500	2316507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5011	NC_014153	CAA	2	6	2319021	2319026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_014153	TCG	2	6	2319055	2319060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_014153	A	6	6	2319069	2319074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014153	GAG	2	6	2319163	2319168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014153	CAC	2	6	2322621	2322626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_014153	CTC	2	6	2327438	2327443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_014153	T	6	6	2327448	2327453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014153	GCG	2	6	2327478	2327483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_014153	GCG	2	6	2327510	2327515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_014153	A	6	6	2332419	2332424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014153	A	7	7	2332441	2332447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014153	G	6	6	2332448	2332453	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_014153	C	6	6	2332460	2332465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5024	NC_014153	CG	3	6	2332810	2332815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_014153	TGT	2	6	2333566	2333571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014153	T	6	6	2333599	2333604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014153	CGC	2	6	2335094	2335099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_014153	TCAA	2	8	2335249	2335256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_014153	GCG	2	6	2338646	2338651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_014153	T	6	6	2338653	2338658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014153	CAC	2	6	2340954	2340959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_014153	CAAG	2	8	2342890	2342897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_014153	CGC	2	6	2342902	2342907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_014153	TTG	2	6	2342927	2342932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014153	GCA	2	6	2342937	2342942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_014153	CATG	2	8	2342943	2342950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_014153	TCC	2	6	2343658	2343663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_014153	AAAC	2	8	2343682	2343689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_014153	GC	3	6	2345937	2345942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_014153	A	6	6	2347295	2347300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014153	TCC	2	6	2347429	2347434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_014153	TCC	2	6	2347481	2347486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_014153	CGC	2	6	2347525	2347530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_014153	GCA	2	6	2347534	2347539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_014153	CTG	2	6	2347571	2347576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_014153	A	6	6	2347597	2347602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014153	TCT	2	6	2347608	2347613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_014153	CG	3	6	2348132	2348137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_014153	CGG	2	6	2348147	2348152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_014153	T	7	7	2348153	2348159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014153	CCG	2	6	2348166	2348171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_014153	CCCG	2	8	2352114	2352121	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5053	NC_014153	G	6	6	2352131	2352136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_014153	TACGGC	2	12	2352167	2352178	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_014153	GC	3	6	2352244	2352249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_014153	CAT	2	6	2352326	2352331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_014153	TGC	2	6	2352350	2352355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_014153	CAG	2	6	2352370	2352375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_014153	CGTGG	2	10	2352391	2352400	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5060	NC_014153	ATC	2	6	2352431	2352436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_014153	GTC	2	6	2352456	2352461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_014153	TGCG	2	8	2352568	2352575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_014153	T	7	7	2362387	2362393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014153	AAAG	2	8	2362401	2362408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014153	CGA	2	6	2362414	2362419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_014153	CAA	2	6	2362465	2362470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_014153	AAGT	2	8	2362499	2362506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014153	CG	3	6	2362658	2362663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_014153	AGG	2	6	2362771	2362776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_014153	CGT	2	6	2362807	2362812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_014153	GCA	3	9	2362863	2362871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_014153	GC	3	6	2362898	2362903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_014153	CGC	2	6	2362910	2362915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_014153	CGT	2	6	2363286	2363291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_014153	TGG	2	6	2363411	2363416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_014153	TGC	2	6	2364654	2364659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_014153	A	6	6	2364713	2364718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_014153	T	8	8	2364819	2364826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_014153	TC	4	8	2364842	2364849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_014153	TC	3	6	2364854	2364859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_014153	TGCC	2	8	2364885	2364892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_014153	GA	3	6	2364921	2364926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_014153	CG	3	6	2366174	2366179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_014153	CTT	2	6	2366217	2366222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_014153	CTG	2	6	2367173	2367178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_014153	CGC	2	6	2367192	2367197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_014153	GCG	2	6	2367213	2367218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_014153	AGGC	2	8	2367258	2367265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_014153	CTC	2	6	2369538	2369543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_014153	CGC	2	6	2370775	2370780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_014153	GCC	2	6	2374493	2374498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_014153	GCG	2	6	2374544	2374549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_014153	AAC	2	6	2374550	2374555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_014153	CTC	2	6	2374576	2374581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_014153	GAAGC	2	10	2374584	2374593	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5096	NC_014153	GCG	2	6	2374688	2374693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_014153	GGC	2	6	2375345	2375350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_014153	TGGGG	2	10	2375386	2375395	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_014153	GTTT	2	8	2376410	2376417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_014153	A	6	6	2376431	2376436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_014153	CAC	2	6	2376515	2376520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_014153	ATG	2	6	2376555	2376560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014153	G	6	6	2376627	2376632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_014153	AGA	2	6	2376672	2376677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014153	CGC	2	6	2380312	2380317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_014153	CTTT	2	8	2381536	2381543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_014153	GCC	2	6	2381608	2381613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_014153	CCTGCC	2	12	2381624	2381635	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_014153	GC	3	6	2381682	2381687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_014153	GCG	2	6	2381698	2381703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_014153	GCCC	2	8	2385078	2385085	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5112	NC_014153	GTT	2	6	2387372	2387377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_014153	TTGCC	2	10	2388464	2388473	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5114	NC_014153	TGG	2	6	2388576	2388581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014153	GGTTG	3	15	2388593	2388607	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014153	ATG	2	6	2388654	2388659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_014153	GGC	2	6	2388738	2388743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_014153	GC	3	6	2388761	2388766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_014153	ACG	2	6	2388776	2388781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_014153	GCA	2	6	2388808	2388813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_014153	GGC	2	6	2388819	2388824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_014153	GGA	2	6	2388851	2388856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014153	GTC	2	6	2388870	2388875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_014153	GCG	2	6	2388913	2388918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_014153	A	6	6	2388925	2388930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014153	AGCC	2	8	2388968	2388975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_014153	AGT	2	6	2388990	2388995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_014153	GCG	2	6	2389039	2389044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_014153	A	6	6	2389078	2389083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_014153	CGG	2	6	2389157	2389162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_014153	GCG	2	6	2391742	2391747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_014153	GCC	2	6	2391772	2391777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_014153	GGGCG	2	10	2394552	2394561	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5134	NC_014153	GCG	2	6	2395888	2395893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_014153	CAA	2	6	2396364	2396369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5155	NC_014153	CGG	2	6	2408421	2408426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5239	NC_014153	GCAAG	2	10	2451631	2451640	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5246	NC_014153	GGCG	2	8	2453593	2453600	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5249	NC_014153	TCT	2	6	2456096	2456101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_014153	GGC	2	6	2459098	2459103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5254	NC_014153	TCTA	2	8	2462145	2462152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5255	NC_014153	CACT	2	8	2462842	2462849	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5256	NC_014153	TGT	2	6	2466112	2466117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_014153	GT	3	6	2466116	2466121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_014153	CGG	2	6	2466127	2466132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_014153	GATTT	2	10	2468914	2468923	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_014153	TTTC	2	8	2468958	2468965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5261	NC_014153	CTG	2	6	2469010	2469015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_014153	TCAAC	2	10	2469017	2469026	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5263	NC_014153	CCG	2	6	2469130	2469135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_014153	GC	7	14	2469166	2469179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5265	NC_014153	TGC	2	6	2469180	2469185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_014153	TCA	2	6	2471652	2471657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5267	NC_014153	TCCCC	2	10	2472302	2472311	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5268	NC_014153	CAC	2	6	2472315	2472320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5269	NC_014153	CAC	2	6	2472326	2472331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5270	NC_014153	GTG	2	6	2472338	2472343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_014153	CCCGA	2	10	2473239	2473248	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5272	NC_014153	ACCG	2	8	2473257	2473264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5273	NC_014153	CGC	2	6	2475370	2475375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5274	NC_014153	CAGCC	2	10	2475399	2475408	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5275	NC_014153	TGC	2	6	2475449	2475454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5278	NC_014153	ACA	2	6	2478319	2478324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5279	NC_014153	CAA	2	6	2478374	2478379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5280	NC_014153	A	7	7	2479861	2479867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_014153	AAG	2	6	2479871	2479876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_014153	GCT	2	6	2485314	2485319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5284	NC_014153	CG	4	8	2488379	2488386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5285	NC_014153	GGA	2	6	2489868	2489873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5288	NC_014153	TGT	2	6	2493906	2493911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5295	NC_014153	A	7	7	2499133	2499139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5296	NC_014153	CCGA	2	8	2499180	2499187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5299	NC_014153	GTT	2	6	2504188	2504193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5305	NC_014153	TA	3	6	2505209	2505214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5342	NC_014153	CTGC	2	8	2527379	2527386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5363	NC_014153	CCCG	2	8	2551336	2551343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5364	NC_014153	CG	3	6	2551354	2551359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5370	NC_014153	TG	3	6	2558870	2558875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5377	NC_014153	CGG	3	9	2562950	2562958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5379	NC_014153	ATG	2	6	2564731	2564736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5381	NC_014153	CGA	2	6	2565008	2565013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5382	NC_014153	CTGCG	2	10	2565088	2565097	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5383	NC_014153	TGT	2	6	2565104	2565109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5385	NC_014153	TGG	2	6	2565252	2565257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5387	NC_014153	GCG	2	6	2565311	2565316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5388	NC_014153	CGG	2	6	2568407	2568412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_014153	TCGG	2	8	2568415	2568422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5390	NC_014153	GATC	2	8	2568426	2568433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5391	NC_014153	TCGG	2	8	2568441	2568448	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5392	NC_014153	ATC	2	6	2570484	2570489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5393	NC_014153	AGTG	2	8	2574075	2574082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_014153	AAAGC	2	10	2574134	2574143	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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