MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014153	ATGGG	2	10	2127593	2127602	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014153	TCG	2	6	2127628	2127633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_014153	CCG	2	6	2127658	2127663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_014153	GC	3	6	2127693	2127698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_014153	GAG	2	6	2127708	2127713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014153	GCC	2	6	2127770	2127775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_014153	AGC	2	6	2127778	2127783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_014153	CG	3	6	2127840	2127845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_014153	CTG	2	6	2127855	2127860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_014153	G	6	6	2127882	2127887	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014153	CGA	2	6	2127975	2127980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_014153	CAG	2	6	2128017	2128022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_014153	TGG	2	6	2128065	2128070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_014153	CGA	2	6	2128112	2128117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_014153	GCA	2	6	2128134	2128139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_014153	GAT	2	6	2128168	2128173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014153	TG	3	6	2128214	2128219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014153	TG	3	6	2130073	2130078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_014153	GAC	2	6	2131115	2131120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_014153	ACG	2	6	2131122	2131127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_014153	AGA	2	6	2131171	2131176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_014153	TAG	2	6	2131206	2131211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_014153	AG	4	8	2131237	2131244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_014153	GCG	2	6	2133165	2133170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_014153	GCCCT	2	10	2133183	2133192	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4526	NC_014153	GC	3	6	2133225	2133230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_014153	TCC	2	6	2133291	2133296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_014153	GCC	2	6	2133341	2133346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_014153	ATCG	2	8	2133361	2133368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_014153	CAG	2	6	2133462	2133467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_014153	GTC	2	6	2133472	2133477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_014153	GGC	2	6	2133552	2133557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_014153	GC	3	6	2133698	2133703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_014153	AGGC	2	8	2133704	2133711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4535	NC_014153	CAG	2	6	2133738	2133743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_014153	ACA	2	6	2133796	2133801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_014153	CGA	2	6	2133881	2133886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_014153	CAT	2	6	2133963	2133968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_014153	AG	3	6	2134019	2134024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014153	TCT	2	6	2134043	2134048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_014153	GC	3	6	2134058	2134063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_014153	CTC	2	6	2134082	2134087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_014153	TTG	2	6	2134099	2134104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_014153	GGAA	2	8	2134109	2134116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_014153	GGC	2	6	2134159	2134164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_014153	GC	3	6	2134202	2134207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_014153	CGG	2	6	2134251	2134256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_014153	CAAA	2	8	2134285	2134292	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_014153	CCA	2	6	2134316	2134321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_014153	TGT	2	6	2134332	2134337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014153	CTTG	2	8	2134359	2134366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_014153	TTG	2	6	2134438	2134443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014153	CAA	2	6	2134498	2134503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_014153	CCCA	2	8	2134527	2134534	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4555	NC_014153	CGC	2	6	2134582	2134587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_014153	ACG	2	6	2134603	2134608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_014153	AGC	2	6	2134629	2134634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_014153	GAC	3	9	2134639	2134647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_014153	TCG	2	6	2134665	2134670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_014153	TAAG	2	8	2134672	2134679	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014153	AGT	2	6	2134690	2134695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014153	GCC	2	6	2134845	2134850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_014153	GTC	2	6	2136368	2136373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_014153	CGA	2	6	2136381	2136386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_014153	GGT	2	6	2136433	2136438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_014153	CGG	2	6	2137066	2137071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_014153	CGC	3	9	2137898	2137906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_014153	GCA	2	6	2137949	2137954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_014153	GAA	2	6	2137986	2137991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014153	GAC	2	6	2138007	2138012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_014153	GAG	2	6	2138078	2138083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_014153	CAC	2	6	2138099	2138104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_014153	GCC	2	6	2138126	2138131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_014153	GCA	2	6	2138249	2138254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_014153	TCG	2	6	2138266	2138271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_014153	CGG	2	6	2138323	2138328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_014153	CAT	2	6	2139330	2139335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_014153	G	6	6	2142498	2142503	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014153	GCA	2	6	2143493	2143498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_014153	GA	3	6	2143543	2143548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_014153	CAA	2	6	2143612	2143617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_014153	ACC	2	6	2143697	2143702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_014153	CAC	2	6	2143703	2143708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_014153	CGGCC	2	10	2143742	2143751	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4585	NC_014153	CAC	2	6	2143779	2143784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_014153	GCCT	2	8	2143865	2143872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_014153	CAC	2	6	2143924	2143929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_014153	CCG	2	6	2143965	2143970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_014153	GCG	2	6	2143973	2143978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_014153	CAC	2	6	2144032	2144037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_014153	CA	3	6	2144081	2144086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_014153	CGCGT	2	10	2144110	2144119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4593	NC_014153	GCA	2	6	2144152	2144157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_014153	CGG	2	6	2144171	2144176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_014153	A	7	7	2144180	2144186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_014153	CGG	2	6	2144226	2144231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_014153	A	6	6	2144247	2144252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014153	GA	3	6	2144253	2144258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_014153	GTTCA	2	10	2144346	2144355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4600	NC_014153	A	6	6	2144370	2144375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014153	CGC	2	6	2144376	2144381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_014153	A	8	8	2144916	2144923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014153	TAA	2	6	2145817	2145822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_014153	CAC	2	6	2145838	2145843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_014153	C	7	7	2145850	2145856	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4606	NC_014153	CGCT	2	8	2146364	2146371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_014153	GAC	2	6	2146385	2146390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_014153	CCCA	2	8	2146559	2146566	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4609	NC_014153	GGGACG	2	12	2149069	2149080	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4610	NC_014153	GTCT	2	8	2149086	2149093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_014153	CGT	2	6	2149095	2149100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_014153	GT	3	6	2149099	2149104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_014153	GT	3	6	2149139	2149144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014153	GGC	2	6	2149240	2149245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_014153	CCT	2	6	2149287	2149292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_014153	CCG	2	6	2149302	2149307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_014153	TGA	2	6	2149408	2149413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_014153	CA	3	6	2149420	2149425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_014153	GAC	2	6	2149471	2149476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_014153	GC	4	8	2149573	2149580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_014153	GAA	2	6	2149588	2149593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_014153	CGA	2	6	2149668	2149673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_014153	CCG	2	6	2149679	2149684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_014153	GAA	2	6	2149701	2149706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_014153	CGG	2	6	2149724	2149729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_014153	ACG	2	6	2149764	2149769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_014153	ACCGGC	2	12	2149824	2149835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_014153	C	6	6	2149839	2149844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4629	NC_014153	GCA	2	6	2149873	2149878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_014153	CCG	2	6	2149889	2149894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_014153	CCG	2	6	2149903	2149908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4632	NC_014153	GCC	2	6	2149938	2149943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_014153	GGA	2	6	2149971	2149976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4635	NC_014153	GGCGC	2	10	2150025	2150034	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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4701	NC_014153	AATCG	2	10	2169718	2169727	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4702	NC_014153	G	6	6	2169737	2169742	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4753	NC_014153	TGC	3	9	2174918	2174926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4761	NC_014153	GCG	2	6	2178805	2178810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4888	NC_014153	CCT	2	6	2222849	2222854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4892	NC_014153	T	7	7	2230062	2230068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4893	NC_014153	CTT	2	6	2230072	2230077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4895	NC_014153	TGAT	2	8	2230112	2230119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4983	NC_014153	CTG	2	6	2300028	2300033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4984	NC_014153	TTG	2	6	2300132	2300137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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