MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 10363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014152	A	6	6	1183573	1183578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014152	AGG	2	6	1183584	1183589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014152	A	7	7	1185248	1185254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014152	GA	3	6	1185257	1185262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_014152	GTTTT	2	10	1185273	1185282	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014152	ATT	2	6	1185291	1185296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014152	T	7	7	1185319	1185325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014152	GAG	3	9	1185337	1185345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_014152	TTA	2	6	1185442	1185447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_014152	ATT	2	6	1185457	1185462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014152	TA	4	8	1185476	1185483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014152	AAG	2	6	1185496	1185501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_014152	TAT	2	6	1191904	1191909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_014152	TTG	2	6	1191948	1191953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014152	GA	3	6	1192023	1192028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014152	GAG	2	6	1194023	1194028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014152	AGA	2	6	1197140	1197145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014152	AAG	2	6	1197148	1197153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014152	ATTT	2	8	1197180	1197187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014152	GT	3	6	1200209	1200214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_014152	T	6	6	1200277	1200282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014152	ATT	2	6	1200318	1200323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014152	A	6	6	1200344	1200349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014152	AC	3	6	1200352	1200357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_014152	A	6	6	1200393	1200398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_014152	AGG	2	6	1200419	1200424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014152	AAT	2	6	1200425	1200430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_014152	TA	3	6	1200437	1200442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014152	G	6	6	1201883	1201888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014152	T	7	7	1202886	1202892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_014152	A	6	6	1202961	1202966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_014152	T	6	6	1202972	1202977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_014152	A	6	6	1202983	1202988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_014152	GGA	2	6	1205042	1205047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_014152	TGA	2	6	1207529	1207534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_014152	AAT	2	6	1207551	1207556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_014152	T	6	6	1207556	1207561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_014152	CAG	2	6	1211692	1211697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_014152	TTA	2	6	1213124	1213129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_014152	AG	3	6	1213438	1213443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_014152	CTTT	2	8	1214245	1214252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_014152	T	7	7	1214250	1214256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_014152	AAT	2	6	1214263	1214268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_014152	AGT	2	6	1214318	1214323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_014152	GAT	2	6	1214419	1214424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_014152	GTA	2	6	1216638	1216643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_014152	CAA	2	6	1216665	1216670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_014152	A	6	6	1216678	1216683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_014152	GAC	2	6	1216693	1216698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_014152	GAA	2	6	1216729	1216734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_014152	A	6	6	1216743	1216748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_014152	A	7	7	1216813	1216819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_014152	T	7	7	1217024	1217030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_014152	TAT	2	6	1217051	1217056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_014152	ATT	2	6	1217065	1217070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014152	TTA	2	6	1217078	1217083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_014152	GTA	2	6	1218415	1218420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014152	GTTT	2	8	1219094	1219101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014152	A	6	6	1219107	1219112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_014152	A	7	7	1219123	1219129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_014152	ATTT	2	8	1219175	1219182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_014152	CAGTT	2	10	1219225	1219234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4063	NC_014152	TA	3	6	1219295	1219300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014152	ATG	2	6	1219315	1219320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014152	GGA	2	6	1219365	1219370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_014152	TGAA	2	8	1219372	1219379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_014152	A	6	6	1219418	1219423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_014152	AT	3	6	1219446	1219451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_014152	TTTA	2	8	1219474	1219481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_014152	TTA	2	6	1219515	1219520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_014152	AAG	2	6	1219527	1219532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014152	T	6	6	1219611	1219616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_014152	A	7	7	1220914	1220920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_014152	TA	3	6	1220956	1220961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_014152	AGG	2	6	1220998	1221003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_014152	AAG	2	6	1221373	1221378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_014152	TTG	2	6	1221462	1221467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_014152	A	6	6	1221468	1221473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_014152	A	6	6	1221484	1221489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_014152	TTTCAA	2	12	1222269	1222280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4081	NC_014152	TTTCT	2	10	1222368	1222377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4082	NC_014152	AGT	2	6	1222494	1222499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_014152	GTG	2	6	1222518	1222523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_014152	CAAAAA	2	12	1224589	1224600	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4085	NC_014152	CAA	2	6	1224618	1224623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_014152	A	6	6	1224622	1224627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_014152	ATA	2	6	1224757	1224762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_014152	T	7	7	1224823	1224829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_014152	T	6	6	1224842	1224847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_014152	AGAA	2	8	1224943	1224950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_014152	TAT	2	6	1225044	1225049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_014152	GAAT	2	8	1225056	1225063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_014152	AT	3	6	1225097	1225102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014152	A	6	6	1225107	1225112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014152	CAA	2	6	1225147	1225152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_014152	T	8	8	1225176	1225183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_014152	AAT	2	6	1225205	1225210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_014152	GTT	2	6	1225223	1225228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014152	AGG	2	6	1225304	1225309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_014152	A	7	7	1225613	1225619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014152	GGC	2	6	1225657	1225662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_014152	TAA	2	6	1225790	1225795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014152	TGG	2	6	1225797	1225802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_014152	TTA	2	6	1225894	1225899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014152	TTA	2	6	1225908	1225913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014152	GTT	2	6	1225921	1225926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014152	TTA	2	6	1225936	1225941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014152	TTA	2	6	1225950	1225955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014152	TTA	2	6	1225964	1225969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014152	TTA	2	6	1225978	1225983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014152	TTA	2	6	1225992	1225997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014152	ACTA	2	8	1226007	1226014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_014152	ATT	3	9	1226254	1226262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014152	A	7	7	1226310	1226316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014152	GT	3	6	1226325	1226330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_014152	GA	3	6	1226344	1226349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014152	A	6	6	1226394	1226399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014152	A	6	6	1226415	1226420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014152	T	8	8	1226429	1226436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014152	AT	3	6	1226493	1226498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014152	T	7	7	1227848	1227854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014152	GGAA	2	8	1227961	1227968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014152	TG	3	6	1227998	1228003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_014152	A	6	6	1228011	1228016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_014152	AAT	2	6	1228018	1228023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_014152	AT	3	6	1228026	1228031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_014152	TA	3	6	1228047	1228052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014152	T	6	6	1228893	1228898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014152	A	7	7	1228925	1228931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_014152	TTA	2	6	1228932	1228937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_014152	AGG	2	6	1228938	1228943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_014152	AGG	2	6	1230991	1230996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_014152	A	7	7	1233238	1233244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_014152	ATCA	2	8	1233279	1233286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_014152	ATTA	2	8	1233295	1233302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_014152	A	6	6	1284534	1284539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4274	NC_014152	A	6	6	1285833	1285838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4405	NC_014152	AGG	2	6	1331926	1331931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4407	NC_014152	GGT	2	6	1334601	1334606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4408	NC_014152	TGA	2	6	1339078	1339083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4426	NC_014152	GTA	2	6	1343232	1343237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4433	NC_014152	AT	3	6	1343575	1343580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4434	NC_014152	AGG	2	6	1343604	1343609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4435	NC_014152	TGG	2	6	1344260	1344265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4438	NC_014152	T	6	6	1344388	1344393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4452	NC_014152	GTCT	2	8	1348284	1348291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4466	NC_014152	ATG	2	6	1351856	1351861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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