MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 10363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014152	CAA	2	6	2439441	2439446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_014152	A	6	6	2439490	2439495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_014152	AGG	2	6	2439500	2439505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_014152	TTGA	2	8	2440852	2440859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_014152	TCC	2	6	2443649	2443654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_014152	CTT	2	6	2443668	2443673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_014152	T	6	6	2443680	2443685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_014152	CCT	2	6	2444055	2444060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_014152	ACG	2	6	2444087	2444092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_014152	ATT	2	6	2444099	2444104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_014152	TTATT	2	10	2444116	2444125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_014152	TAC	2	6	2444129	2444134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_014152	ATT	2	6	2445659	2445664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_014152	TCT	2	6	2445665	2445670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_014152	A	6	6	2445676	2445681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_014152	TCT	2	6	2445684	2445689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_014152	CAA	2	6	2445710	2445715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_014152	GA	3	6	2445724	2445729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_014152	GAC	2	6	2446424	2446429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_014152	TCA	2	6	2446448	2446453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_014152	ATA	3	9	2446465	2446473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_014152	TTA	2	6	2447316	2447321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_014152	CAA	2	6	2447358	2447363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_014152	A	6	6	2447368	2447373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_014152	A	8	8	2447410	2447417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_014152	GAA	2	6	2447477	2447482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_014152	A	6	6	2447481	2447486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_014152	TC	3	6	2447948	2447953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_014152	TA	3	6	2448005	2448010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_014152	T	7	7	2448034	2448040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_014152	AATT	2	8	2448052	2448059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_014152	T	6	6	2448101	2448106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_014152	AAT	2	6	2448216	2448221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_014152	AGG	2	6	2448226	2448231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_014152	CAT	2	6	2448747	2448752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_014152	AT	3	6	2449075	2449080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_014152	T	6	6	2449097	2449102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_014152	ATA	2	6	2449104	2449109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_014152	CCT	2	6	2450215	2450220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_014152	ATT	2	6	2450308	2450313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_014152	A	6	6	2450351	2450356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_014152	AG	3	6	2450373	2450378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_014152	A	6	6	2450397	2450402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_014152	A	6	6	2450430	2450435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_014152	CTTT	2	8	2450460	2450467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8046	NC_014152	AATT	2	8	2450471	2450478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_014152	TAC	3	9	2450484	2450492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_014152	A	8	8	2450508	2450515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_014152	TTCTT	2	10	2450550	2450559	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8050	NC_014152	TTC	2	6	2450596	2450601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_014152	TTA	2	6	2450673	2450678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_014152	TA	3	6	2450677	2450682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_014152	AAACGA	2	12	2450684	2450695	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8054	NC_014152	T	7	7	2450720	2450726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_014152	TGT	2	6	2450728	2450733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_014152	AGT	2	6	2450774	2450779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8058	NC_014152	T	6	6	2450815	2450820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_014152	CGCTG	2	10	2450867	2450876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8060	NC_014152	TAA	2	6	2450891	2450896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_014152	CCG	2	6	2450907	2450912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8062	NC_014152	GTA	2	6	2450985	2450990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8064	NC_014152	ATG	2	6	2451094	2451099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8066	NC_014152	TGT	4	12	2451117	2451128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_014152	ATG	2	6	2451132	2451137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_014152	TCC	2	6	2452367	2452372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_014152	GCC	2	6	2452374	2452379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_014152	CTC	2	6	2453380	2453385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_014152	GTTT	2	8	2454801	2454808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_014152	TTTC	2	8	2454830	2454837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8074	NC_014152	AGGG	2	8	2454857	2454864	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_014152	GCAG	2	8	2454914	2454921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8076	NC_014152	TAC	2	6	2454969	2454974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8078	NC_014152	TGA	2	6	2455019	2455024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_014152	CCG	2	6	2455227	2455232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_014152	GCA	2	6	2455287	2455292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_014152	CCT	2	6	2455318	2455323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_014152	GCC	2	6	2455329	2455334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_014152	CCCA	2	8	2455369	2455376	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8084	NC_014152	GACT	2	8	2455388	2455395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_014152	TCCT	2	8	2455453	2455460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8088	NC_014152	T	7	7	2455541	2455547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_014152	TGG	2	6	2455589	2455594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_014152	ATA	2	6	2455816	2455821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_014152	ATT	2	6	2455851	2455856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_014152	AAAT	2	8	2455859	2455866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_014152	ATT	2	6	2455878	2455883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_014152	TTA	2	6	2458224	2458229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_014152	CTT	2	6	2458274	2458279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8102	NC_014152	GAAAA	2	10	2458350	2458359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_014152	GCG	2	6	2458369	2458374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_014152	A	7	7	2458530	2458536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8106	NC_014152	CCT	2	6	2459217	2459222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_014152	TCC	3	9	2459665	2459673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_014152	AT	3	6	2459676	2459681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_014152	AAAC	2	8	2459704	2459711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_014152	TAT	2	6	2459729	2459734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_014152	CAA	2	6	2459751	2459756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_014152	CTTT	2	8	2461031	2461038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8113	NC_014152	ACC	2	6	2462252	2462257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_014152	T	6	6	2462272	2462277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_014152	CTTT	2	8	2462283	2462290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8116	NC_014152	AACTC	2	10	2462327	2462336	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8117	NC_014152	GTT	2	6	2462354	2462359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_014152	A	6	6	2462385	2462390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_014152	TTAA	2	8	2462412	2462419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_014152	TCCT	2	8	2462798	2462805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8124	NC_014152	AGG	2	6	2463247	2463252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_014152	AGG	2	6	2463533	2463538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_014152	AATA	2	8	2464136	2464143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_014152	AG	3	6	2464148	2464153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_014152	TCC	2	6	2464163	2464168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_014152	GATG	2	8	2464224	2464231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_014152	CT	3	6	2464262	2464267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8131	NC_014152	AGT	2	6	2464276	2464281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_014152	AGC	2	6	2464284	2464289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8134	NC_014152	ATAA	2	8	2464322	2464329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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