MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 10363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014152	A	7	7	1529910	1529916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014152	TTC	2	6	1529980	1529985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_014152	ATC	2	6	1529988	1529993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_014152	GCA	2	6	1530005	1530010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_014152	AGC	2	6	1530048	1530053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_014152	AGG	2	6	1530089	1530094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014152	ACT	2	6	1530181	1530186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_014152	ATT	2	6	1530192	1530197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014152	T	6	6	1530201	1530206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014152	G	6	6	1530261	1530266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014152	T	6	6	1530312	1530317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014152	AGC	2	6	1530367	1530372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_014152	CTTT	2	8	1531036	1531043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_014152	TA	3	6	1531053	1531058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014152	A	7	7	1531108	1531114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014152	AAT	2	6	1531400	1531405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014152	A	7	7	1531438	1531444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014152	TTC	2	6	1531508	1531513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_014152	ATC	2	6	1531516	1531521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_014152	GCA	2	6	1531533	1531538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_014152	AGC	2	6	1531576	1531581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_014152	AGG	2	6	1531617	1531622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_014152	AAC	2	6	1531651	1531656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_014152	ACT	2	6	1531709	1531714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_014152	TA	3	6	1531775	1531780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014152	TGGA	2	8	1531819	1531826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014152	AAT	2	6	1531869	1531874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_014152	TAA	2	6	1532955	1532960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_014152	CA	3	6	1533393	1533398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_014152	T	6	6	1533561	1533566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014152	TAA	2	6	1533608	1533613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_014152	AAT	2	6	1533637	1533642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_014152	A	7	7	1533675	1533681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014152	TTC	2	6	1533743	1533748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5038	NC_014152	AGG	2	6	1533852	1533857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_014152	AAC	2	6	1533886	1533891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_014152	ACT	2	6	1533944	1533949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_014152	TA	3	6	1534010	1534015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014152	GGAA	2	8	1534055	1534062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014152	AAT	2	6	1534104	1534109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014152	AACT	2	8	1534263	1534270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_014152	ATTG	2	8	1534295	1534302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014152	GAT	2	6	1534321	1534326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014152	TAA	2	6	1535064	1535069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014152	T	6	6	1535248	1535253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014152	TAA	2	6	1535295	1535300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014152	AAT	2	6	1535324	1535329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014152	A	7	7	1535362	1535368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014152	T	7	7	1537413	1537419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014152	A	6	6	1537431	1537436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_014152	ATT	2	6	1537452	1537457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_014152	ACC	2	6	1537490	1537495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_014152	CAA	2	6	1537513	1537518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_014152	ATTT	2	8	1537536	1537543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_014152	ATG	2	6	1537551	1537556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014152	ATG	2	6	1537579	1537584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014152	CTT	2	6	1537618	1537623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_014152	TCT	2	6	1537741	1537746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_014152	AT	3	6	1537747	1537752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_014152	TAA	2	6	1537814	1537819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014152	TAG	2	6	1537838	1537843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014152	A	7	7	1537880	1537886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014152	CAC	2	6	1539940	1539945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5070	NC_014152	AAAT	2	8	1539995	1540002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5075	NC_014152	T	7	7	1541665	1541671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_014152	TTA	2	6	1543427	1543432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_014152	A	6	6	1543438	1543443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_014152	TAA	2	6	1543502	1543507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_014152	ATTAA	2	10	1543605	1543614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_014152	TTTC	2	8	1546635	1546642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5093	NC_014152	CGG	2	6	1549264	1549269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5096	NC_014152	CAA	2	6	1549461	1549466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_014152	TA	3	6	1549568	1549573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014152	CGATT	2	10	1549862	1549871	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5099	NC_014152	AT	3	6	1549901	1549906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_014152	GAAA	2	8	1551176	1551183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014152	TCT	2	6	1551216	1551221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5105	NC_014152	GGC	2	6	1551609	1551614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5109	NC_014152	ATC	2	6	1552194	1552199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5111	NC_014152	TTAG	2	8	1552232	1552239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_014152	TTTAA	2	10	1553935	1553944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_014152	TAA	2	6	1553967	1553972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014152	CATTA	2	10	1554741	1554750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5115	NC_014152	AT	3	6	1554768	1554773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014152	GTA	2	6	1554806	1554811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5118	NC_014152	A	6	6	1554876	1554881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014152	GTT	2	6	1554933	1554938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_014152	CAA	2	6	1554968	1554973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_014152	GGAA	2	8	1555032	1555039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014152	A	7	7	1555060	1555066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_014152	TA	3	6	1555100	1555105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014152	AAC	2	6	1555159	1555164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_014152	TGC	2	6	1555252	1555257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5129	NC_014152	TTCG	2	8	1555532	1555539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_014152	AG	3	6	1555630	1555635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_014152	TTA	2	6	1555669	1555674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_014152	TGC	2	6	1555776	1555781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5243	NC_014152	A	6	6	1620885	1620890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_014152	CACC	2	8	1621747	1621754	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5252	NC_014152	T	6	6	1622651	1622656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_014152	TGC	2	6	1622662	1622667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5259	NC_014152	TTC	2	6	1623140	1623145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_014152	CTGA	2	8	1623200	1623207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5262	NC_014152	CTG	2	6	1623217	1623222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_014152	CCA	2	6	1623226	1623231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_014152	CT	3	6	1623249	1623254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5265	NC_014152	TC	3	6	1623280	1623285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5400	NC_014152	CGTT	2	8	1678633	1678640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5401	NC_014152	TGC	2	6	1678690	1678695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5402	NC_014152	AAG	2	6	1678701	1678706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5403	NC_014152	CAA	2	6	1678759	1678764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5404	NC_014152	CTTA	2	8	1678789	1678796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5409	NC_014152	A	6	6	1678970	1678975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5410	NC_014152	T	6	6	1678993	1678998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5435	NC_014152	GGA	2	6	1680359	1680364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5452	NC_014152	GA	3	6	1681214	1681219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5453	NC_014152	TGG	2	6	1681283	1681288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5465	NC_014152	AT	3	6	1681756	1681761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5478	NC_014152	GCT	2	6	1682732	1682737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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