MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 9534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013921	AGA	2	6	381598	381603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013921	TCC	2	6	381619	381624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_013921	T	6	6	381625	381630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013921	GA	3	6	381639	381644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013921	C	6	6	381683	381688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1506	NC_013921	TG	3	6	381732	381737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_013921	TA	3	6	381756	381761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013921	AT	4	8	381781	381788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013921	AGG	2	6	381881	381886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013921	AAT	2	6	381887	381892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013921	ACG	2	6	381922	381927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_013921	GAA	2	6	381945	381950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013921	AAG	2	6	381962	381967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013921	CAC	2	6	381972	381977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_013921	TTG	2	6	382069	382074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013921	A	6	6	382083	382088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013921	GAATGC	2	12	382556	382567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1518	NC_013921	ATA	2	6	382600	382605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013921	T	7	7	382613	382619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013921	TTA	3	9	382656	382664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013921	TTAA	2	8	382743	382750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013921	GTTT	2	8	383630	383637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013921	CAT	2	6	384224	384229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_013921	TTATT	2	10	384241	384250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013921	ATA	2	6	384265	384270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013921	ACA	2	6	384274	384279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_013921	A	6	6	384288	384293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013921	AT	4	8	384296	384303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013921	ATA	2	6	384321	384326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_013921	T	6	6	385515	385520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013921	TAA	2	6	385532	385537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013921	TGG	3	9	385554	385562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013921	GAA	2	6	385584	385589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013921	AT	4	8	385599	385606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013921	AGAT	3	12	385700	385711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013921	ATAA	2	8	385716	385723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013921	A	6	6	385778	385783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013921	TAA	2	6	385864	385869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_013921	AG	3	6	385888	385893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013921	A	6	6	386011	386016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013921	T	7	7	386040	386046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013921	AGG	2	6	386068	386073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013921	AAG	2	6	393891	393896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013921	GA	3	6	396326	396331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013921	GTT	2	6	396723	396728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013921	T	6	6	396727	396732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013921	GA	3	6	407180	407185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013921	CA	3	6	409391	409396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_013921	TAT	2	6	409425	409430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013921	GGT	2	6	409493	409498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013921	TGAA	2	8	410833	410840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013921	GAC	2	6	410885	410890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_013921	TTTA	2	8	410911	410918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013921	GAA	2	6	410922	410927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013921	ATT	2	6	411080	411085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013921	CCTG	2	8	411156	411163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_013921	AC	3	6	411172	411177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_013921	T	7	7	411225	411231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013921	GT	4	8	411293	411300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_013921	A	6	6	413924	413929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013921	GCT	2	6	413930	413935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013921	CAG	2	6	413943	413948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_013921	T	6	6	413950	413955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013921	TATTT	2	10	413957	413966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013921	CTA	3	9	414047	414055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_013921	TAC	2	6	414136	414141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_013921	T	6	6	415384	415389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_013921	TAT	2	6	415428	415433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013921	T	6	6	415448	415453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013921	AGT	2	6	415496	415501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013921	TATT	2	8	415502	415509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013921	AAGAA	2	10	415624	415633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013921	TA	4	8	415672	415679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013921	A	6	6	415787	415792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013921	TCAAT	2	10	415800	415809	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1576	NC_013921	ATAC	2	8	415833	415840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_013921	TA	3	6	415900	415905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013921	AAAT	2	8	415924	415931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013921	AGT	2	6	415962	415967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013921	ATA	2	6	415984	415989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013921	AAC	3	9	416069	416077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013921	ACA	2	6	416085	416090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_013921	T	6	6	416108	416113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013921	TTTA	2	8	416158	416165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013921	TAG	2	6	416208	416213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013921	AAT	2	6	416214	416219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013921	TAT	2	6	416253	416258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013921	TAAA	2	8	416264	416271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013921	A	6	6	416269	416274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013921	ATA	2	6	416284	416289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_013921	AGACAA	2	12	416508	416519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1592	NC_013921	ATA	2	6	416543	416548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013921	AACA	2	8	416562	416569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_013921	GTT	2	6	416581	416586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013921	ATA	2	6	416599	416604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013921	ATG	2	6	416688	416693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013921	A	7	7	416755	416761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013921	AAAT	2	8	416839	416846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013921	TTTAT	2	10	416853	416862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_013921	T	8	8	417328	417335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_013921	T	6	6	417337	417342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013921	TTCT	2	8	417344	417351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_013921	ATA	2	6	417362	417367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013921	TTTA	2	8	417401	417408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013921	AGA	2	6	417425	417430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_013921	ATA	2	6	417471	417476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013921	A	6	6	417520	417525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013921	AGA	2	6	417620	417625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013921	TTG	2	6	417678	417683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013921	AGA	2	6	417755	417760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013921	ACT	2	6	417832	417837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_013921	A	6	6	417849	417854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013921	GCATT	2	10	417857	417866	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_013921	TAG	2	6	417880	417885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013921	TAG	2	6	417898	417903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013921	AT	3	6	417913	417918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013921	A	7	7	417930	417936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013921	TAA	2	6	417958	417963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013921	GAAA	2	8	418007	418014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013921	GATAAA	2	12	418028	418039	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013921	TAG	2	6	418156	418161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013921	A	6	6	418175	418180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013921	GATA	2	8	418220	418227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013921	T	7	7	418261	418267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_013921	TAA	2	6	418298	418303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_013921	TAG	2	6	418320	418325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013921	AGG	2	6	418376	418381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013921	AAT	2	6	418391	418396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013921	T	6	6	418400	418405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013921	AAT	2	6	418497	418502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013921	GA	3	6	418506	418511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013921	TAA	2	6	418518	418523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013921	AAG	2	6	418541	418546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013921	ATT	2	6	418593	418598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013921	TAA	2	6	418646	418651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013921	AGA	2	6	418752	418757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_013921	TA	4	8	418849	418856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_013921	AGG	2	6	419003	419008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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