MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 9534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013921	GCA	2	6	2357355	2357360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_013921	AAATT	2	10	2358663	2358672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_013921	AT	3	6	2358693	2358698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_013921	AT	3	6	2358715	2358720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_013921	AGA	2	6	2358736	2358741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_013921	AAAAGA	2	12	2358742	2358753	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_013921	CCT	2	6	2361304	2361309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9008	NC_013921	CTA	2	6	2361334	2361339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_013921	TTA	2	6	2361340	2361345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_013921	TAT	2	6	2361371	2361376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_013921	TGGTA	2	10	2361388	2361397	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_013921	CT	3	6	2361510	2361515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9013	NC_013921	TCT	2	6	2361565	2361570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_013921	TCC	2	6	2361592	2361597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9015	NC_013921	ATT	2	6	2361634	2361639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_013921	ATC	2	6	2361643	2361648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_013921	AT	4	8	2361721	2361728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_013921	CCA	2	6	2361811	2361816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_013921	T	7	7	2361831	2361837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_013921	GTT	2	6	2361851	2361856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_013921	AAG	2	6	2361881	2361886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_013921	TAT	2	6	2361929	2361934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_013921	AGA	2	6	2361978	2361983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_013921	TAG	2	6	2362003	2362008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_013921	TTG	2	6	2362118	2362123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_013921	TCT	2	6	2362191	2362196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_013921	T	7	7	2362196	2362202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_013921	T	6	6	2362255	2362260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_013921	CAG	2	6	2362261	2362266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_013921	TAT	2	6	2362280	2362285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_013921	CAA	2	6	2362306	2362311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_013921	T	7	7	2362350	2362356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_013921	A	6	6	2362398	2362403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_013921	TCA	2	6	2362431	2362436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_013921	TATCCT	2	12	2362445	2362456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_013921	T	6	6	2362480	2362485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_013921	CTT	2	6	2362501	2362506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_013921	AT	3	6	2362616	2362621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_013921	TA	3	6	2362640	2362645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_013921	ATTT	2	8	2362655	2362662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_013921	TGGCA	2	10	2362682	2362691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9042	NC_013921	TCA	2	6	2362722	2362727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_013921	ACTTC	2	10	2362731	2362740	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9044	NC_013921	AT	3	6	2362836	2362841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_013921	TAT	2	6	2362880	2362885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_013921	TGT	2	6	2362909	2362914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_013921	ATT	2	6	2362967	2362972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_013921	TA	3	6	2363044	2363049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_013921	ATT	2	6	2363055	2363060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_013921	C	6	6	2363779	2363784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9051	NC_013921	AAG	2	6	2363809	2363814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_013921	CTT	2	6	2363824	2363829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_013921	CA	4	8	2364652	2364659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9054	NC_013921	TGTA	2	8	2364670	2364677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_013921	TATG	2	8	2364699	2364706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_013921	TAT	2	6	2364746	2364751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_013921	A	6	6	2364826	2364831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_013921	CAA	2	6	2364877	2364882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_013921	CGG	2	6	2364907	2364912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_013921	CCAT	2	8	2364957	2364964	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9061	NC_013921	TCA	2	6	2365062	2365067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_013921	CTTT	2	8	2366465	2366472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9063	NC_013921	T	6	6	2366500	2366505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_013921	TA	4	8	2366575	2366582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_013921	ATT	2	6	2366604	2366609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_013921	AT	3	6	2366664	2366669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_013921	AT	4	8	2370102	2370109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_013921	ATA	2	6	2370126	2370131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_013921	A	6	6	2370146	2370151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_013921	TTG	2	6	2370188	2370193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_013921	A	6	6	2370202	2370207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_013921	TCC	2	6	2371467	2371472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9073	NC_013921	ATTT	2	8	2371478	2371485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_013921	TAT	2	6	2371505	2371510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_013921	CTC	2	6	2372513	2372518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9076	NC_013921	A	7	7	2372807	2372813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_013921	A	7	7	2372842	2372848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_013921	CTG	2	6	2372880	2372885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_013921	GCT	2	6	2372897	2372902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_013921	TA	3	6	2372955	2372960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_013921	T	6	6	2372991	2372996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_013921	T	6	6	2373002	2373007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_013921	ATT	2	6	2374316	2374321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_013921	AAAAGC	2	12	2375741	2375752	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9085	NC_013921	TA	4	8	2375757	2375764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_013921	A	8	8	2375772	2375779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_013921	A	7	7	2375854	2375860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_013921	T	6	6	2375873	2375878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_013921	ACC	2	6	2377182	2377187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9091	NC_013921	TATAT	2	10	2377430	2377439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_013921	T	6	6	2377445	2377450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_013921	CTTT	2	8	2377529	2377536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9094	NC_013921	A	8	8	2377616	2377623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_013921	ATA	2	6	2377668	2377673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9097	NC_013921	AT	3	6	2377687	2377692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_013921	T	6	6	2379523	2379528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_013921	ATT	2	6	2379633	2379638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_013921	TACT	3	12	2379642	2379653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9101	NC_013921	TAATA	2	10	2379654	2379663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_013921	AAAG	2	8	2379670	2379677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_013921	ATGG	2	8	2379718	2379725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_013921	TATT	2	8	2379773	2379780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_013921	TTTA	2	8	2379806	2379813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_013921	CCCT	2	8	2381549	2381556	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9107	NC_013921	T	6	6	2381563	2381568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_013921	A	7	7	2381585	2381591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_013921	T	7	7	2381592	2381598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_013921	TAA	2	6	2381609	2381614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_013921	TTA	2	6	2381622	2381627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_013921	A	6	6	2381651	2381656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_013921	CAA	2	6	2381672	2381677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_013921	ATA	2	6	2381692	2381697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_013921	TAA	2	6	2381730	2381735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_013921	A	6	6	2382436	2382441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_013921	T	6	6	2383589	2383594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_013921	ATA	2	6	2383595	2383600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_013921	A	7	7	2383667	2383673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_013921	TAAAAT	2	12	2383724	2383735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9122	NC_013921	ACCC	2	8	2383758	2383765	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9123	NC_013921	A	6	6	2392297	2392302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_013921	TGT	2	6	2392317	2392322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_013921	TAT	2	6	2392394	2392399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_013921	A	8	8	2392411	2392418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_013921	AAT	2	6	2392424	2392429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_013921	ATA	2	6	2392446	2392451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_013921	TAT	2	6	2392484	2392489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_013921	A	6	6	2392498	2392503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_013921	AT	3	6	2392518	2392523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9132	NC_013921	TCC	2	6	2393772	2393777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9133	NC_013921	CTG	2	6	2393795	2393800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9404	NC_013921	CTT	2	6	2420451	2420456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9405	NC_013921	TA	4	8	2420466	2420473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9406	NC_013921	ATTT	2	8	2420475	2420482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9432	NC_013921	AAG	2	6	2421317	2421322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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