MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 9534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013921	TAAATT	2	12	1148696	1148707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_013921	AAG	2	6	1149360	1149365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_013921	TAT	2	6	1149407	1149412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013921	A	6	6	1150321	1150326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_013921	TGA	2	6	1150361	1150366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_013921	A	6	6	1151583	1151588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_013921	GGA	2	6	1151589	1151594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_013921	ATA	2	6	1151616	1151621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_013921	TAC	2	6	1153183	1153188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_013921	T	7	7	1153191	1153197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_013921	AATT	2	8	1153199	1153206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_013921	TAA	2	6	1153225	1153230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013921	TGGT	2	8	1153231	1153238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013921	TGG	2	6	1153270	1153275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013921	A	7	7	1153326	1153332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_013921	AGG	3	9	1153360	1153368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_013921	ACTTAT	2	12	1155504	1155515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4518	NC_013921	T	7	7	1155515	1155521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_013921	TATAA	2	10	1155536	1155545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013921	ATT	2	6	1155556	1155561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_013921	TTA	2	6	1155562	1155567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_013921	GGT	2	6	1155575	1155580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_013921	T	7	7	1159569	1159575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_013921	AT	3	6	1159591	1159596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_013921	TAA	2	6	1159642	1159647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013921	ATA	2	6	1159671	1159676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_013921	TTA	2	6	1159690	1159695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_013921	GTG	2	6	1159712	1159717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_013921	T	6	6	1160816	1160821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_013921	TA	3	6	1160823	1160828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013921	AGG	2	6	1160830	1160835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_013921	CCT	2	6	1162041	1162046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_013921	AGG	2	6	1162058	1162063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013921	ATTT	2	8	1162067	1162074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013921	TAT	2	6	1162105	1162110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_013921	T	7	7	1165498	1165504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_013921	T	7	7	1167266	1167272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_013921	A	6	6	1167288	1167293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_013921	AGG	3	9	1167308	1167316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_013921	CCT	2	6	1168756	1168761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_013921	AT	3	6	1168767	1168772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_013921	AGG	2	6	1168808	1168813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013921	TA	4	8	1170106	1170113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013921	TAA	2	6	1170121	1170126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_013921	AAT	2	6	1170133	1170138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_013921	TTA	2	6	1170145	1170150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_013921	GTAAA	2	10	1170158	1170167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_013921	A	6	6	1170172	1170177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_013921	AAG	2	6	1170354	1170359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013921	AGA	2	6	1170360	1170365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_013921	TTA	2	6	1171503	1171508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013921	AGG	2	6	1171514	1171519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_013921	ATG	2	6	1172306	1172311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_013921	ATT	2	6	1172328	1172333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_013921	TAT	2	6	1172343	1172348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_013921	T	6	6	1172364	1172369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_013921	TA	3	6	1172375	1172380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_013921	CAAA	2	8	1172395	1172402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_013921	A	6	6	1172426	1172431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_013921	ATA	3	9	1172442	1172450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013921	GTA	2	6	1172477	1172482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_013921	ACAA	2	8	1172483	1172490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_013921	AGA	2	6	1172532	1172537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_013921	AGA	2	6	1172545	1172550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_013921	AAAG	2	8	1172579	1172586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_013921	AGG	2	6	1173543	1173548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_013921	ATA	2	6	1173549	1173554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_013921	T	7	7	1174826	1174832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_013921	AGG	2	6	1174864	1174869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_013921	CTT	2	6	1174870	1174875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_013921	AGG	2	6	1175591	1175596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_013921	A	6	6	1176234	1176239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_013921	GTA	2	6	1176246	1176251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_013921	GGC	3	9	1176252	1176260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_013921	CAG	2	6	1176262	1176267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_013921	ATG	2	6	1176270	1176275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_013921	AGC	3	9	1176284	1176292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_013921	ATG	2	6	1176294	1176299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_013921	AAGT	2	8	1176307	1176314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_013921	GTT	2	6	1176347	1176352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_013921	AGA	2	6	1176398	1176403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_013921	T	6	6	1176405	1176410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_013921	TA	3	6	1176439	1176444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_013921	TAAA	2	8	1176487	1176494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_013921	GA	3	6	1176563	1176568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_013921	T	6	6	1176570	1176575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_013921	AGTAAA	2	12	1176599	1176610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_013921	ATA	2	6	1176633	1176638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_013921	GTA	2	6	1176699	1176704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013921	AGG	2	6	1176713	1176718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_013921	T	10	10	1176880	1176889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_013921	GAAA	2	8	1176891	1176898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_013921	AAGAG	2	10	1176904	1176913	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_013921	ACT	2	6	1176987	1176992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_013921	TAA	2	6	1177011	1177016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013921	GGA	2	6	1177054	1177059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_013921	TAA	2	6	1177078	1177083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013921	TCAT	2	8	1177129	1177136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_013921	A	6	6	1177178	1177183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_013921	GAAA	2	8	1177205	1177212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013921	A	6	6	1177231	1177236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013921	GGT	2	6	1177289	1177294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013921	AGTA	2	8	1177297	1177304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_013921	AAAT	2	8	1177311	1177318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_013921	ATA	2	6	1177340	1177345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_013921	T	6	6	1177355	1177360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_013921	TAGACG	2	12	1177374	1177385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4609	NC_013921	TGG	2	6	1177393	1177398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_013921	T	7	7	1177476	1177482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_013921	ATTT	2	8	1177483	1177490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013921	ATA	2	6	1177501	1177506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_013921	AGG	2	6	1177512	1177517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_013921	TATAA	2	10	1178010	1178019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_013921	A	7	7	1178018	1178024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_013921	ATA	2	6	1178033	1178038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_013921	GGAGA	2	10	1178039	1178048	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013921	T	6	6	1180538	1180543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_013921	AGG	2	6	1180599	1180604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_013921	TAA	2	6	1180611	1180616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_013921	AT	3	6	1180689	1180694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_013921	ACGA	2	8	1180784	1180791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4623	NC_013921	ATGG	2	8	1180807	1180814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_013921	TTA	2	6	1180890	1180895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_013921	CT	3	6	1180909	1180914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_013921	CGT	2	6	1180965	1180970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_013921	TAA	2	6	1181189	1181194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013921	ATT	2	6	1181199	1181204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_013921	CTT	2	6	1181311	1181316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_013921	ATA	2	6	1181343	1181348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_013921	TTTC	2	8	1181369	1181376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4632	NC_013921	T	6	6	1181412	1181417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4634	NC_013921	CTAT	2	8	1181433	1181440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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