MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 9534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	CAA	2	6	6	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013921	ATT	2	6	45	50	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013921	TTA	2	6	80	85	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013921	TAAA	2	8	108	115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013921	AAC	2	6	132	137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013921	GTT	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013921	GTT	2	6	171	176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013921	T	7	7	228	234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013921	T	8	8	240	247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013921	CAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013921	TA	3	6	287	292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013921	A	6	6	307	312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013921	ATTAA	2	10	321	330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013921	TTA	2	6	333	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013921	AATTA	2	10	341	350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013921	ATA	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013921	TAT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013921	AGG	2	6	411	416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013921	T	6	6	1794	1799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013921	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013921	CAA	2	6	1846	1851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013921	CTTT	2	8	1865	1872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013921	TAT	2	6	1907	1912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013921	ACT	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013921	TTATT	2	10	1930	1939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013921	TAT	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013921	A	7	7	1958	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013921	T	6	6	3117	3122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013921	ACC	2	6	9078	9083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013921	CTC	2	6	9112	9117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013921	TAC	2	6	9134	9139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013921	CTT	2	6	9145	9150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013921	CAT	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013921	A	6	6	9215	9220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013921	TATAT	2	10	9258	9267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013921	TAT	3	9	9287	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013921	TAA	3	9	9304	9312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013921	ATAAA	2	10	9385	9394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013921	ATA	2	6	14836	14841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013921	A	7	7	14972	14978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013921	T	7	7	14985	14991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013921	T	6	6	15007	15012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013921	ATT	2	6	15031	15036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013921	AAT	2	6	15048	15053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013921	TAAAGT	2	12	15063	15074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013921	GATAAA	2	12	15123	15134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013921	TGA	2	6	15138	15143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013921	AG	3	6	15170	15175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013921	GGTG	2	8	15178	15185	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013921	TAG	2	6	15252	15257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013921	GGT	2	6	15335	15340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013921	GATT	2	8	15381	15388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013921	TA	3	6	15391	15396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013921	G	6	6	15397	15402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013921	AGG	2	6	16912	16917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013921	CGG	2	6	24286	24291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013921	GGAGAA	2	12	24356	24367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013921	T	6	6	24398	24403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013921	T	6	6	24429	24434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013921	AGG	2	6	24440	24445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013921	TGA	2	6	26174	26179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013921	AGG	2	6	26193	26198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013921	A	6	6	27406	27411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013921	TGAAT	2	10	27412	27421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013921	ATT	2	6	27425	27430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013921	TAA	2	6	27461	27466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013921	CCT	2	6	29039	29044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013921	TAT	2	6	29052	29057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013921	TAAAAA	2	12	29085	29096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013921	CCG	2	6	29099	29104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013921	TC	3	6	29292	29297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013921	TTTAA	2	10	29309	29318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013921	AT	3	6	29327	29332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013921	A	7	7	29355	29361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013921	TTTG	2	8	29368	29375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013921	GAG	2	6	29410	29415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013921	AGT	2	6	29962	29967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013921	AGT	2	6	29975	29980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013921	ATA	2	6	29981	29986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013921	A	7	7	29989	29995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013921	AGT	2	6	30017	30022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013921	AG	3	6	30038	30043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013921	TGG	3	9	30045	30053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013921	GTT	2	6	30214	30219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013921	TAT	2	6	30220	30225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013921	TAT	2	6	31501	31506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013921	CTG	2	6	31543	31548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013921	CAG	2	6	31574	31579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013921	T	6	6	31681	31686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013921	CCT	2	6	31781	31786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013921	TAT	2	6	31799	31804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013921	TCC	2	6	33049	33054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013921	TA	3	6	33081	33086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013921	AT	3	6	33091	33096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013921	TTA	2	6	33139	33144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013921	TTA	2	6	33150	33155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013921	TTC	2	6	33162	33167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013921	TTTA	2	8	33172	33179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013921	CTTT	2	8	33181	33188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013921	TAAT	2	8	33218	33225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013921	A	7	7	33241	33247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013921	AATTAA	2	12	36019	36030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013921	TTA	2	6	36037	36042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013921	TA	3	6	36041	36046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013921	A	6	6	36200	36205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013921	AATTTT	2	12	36207	36218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013921	TAAT	2	8	36244	36251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013921	AT	3	6	36273	36278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013921	GGTA	2	8	36287	36294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013921	TACC	2	8	36304	36311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013921	ATT	2	6	36338	36343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013921	TAA	2	6	36367	36372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013921	ATA	2	6	36437	36442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013921	A	7	7	36452	36458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013921	TAT	2	6	36461	36466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013921	ATTGT	2	10	36943	36952	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013921	T	6	6	36971	36976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013921	AAT	2	6	37014	37019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013921	AGA	2	6	37043	37048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013921	TGG	2	6	37067	37072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013921	GA	3	6	37526	37531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013921	CT	3	6	37604	37609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013921	GA	3	6	37629	37634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013921	GT	3	6	37670	37675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013921	CT	4	8	37709	37716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013921	A	6	6	37799	37804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013921	ACA	2	6	37810	37815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013921	ATC	2	6	37818	37823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013921	AGT	2	6	37828	37833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013921	GT	3	6	37832	37837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013921	GGAA	2	8	38024	38031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013921	AAGC	2	8	38040	38047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013921	TGG	2	6	38103	38108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013921	T	6	6	38133	38138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013921	TA	3	6	38148	38153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013921	TAT	2	6	38229	38234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013921	T	7	7	38234	38240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013921	TAA	2	6	38259	38264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013921	TTC	2	6	38292	38297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013921	ATA	2	6	38337	38342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013921	AGA	2	6	38364	38369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013921	AT	3	6	40292	40297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013921	T	9	9	40299	40307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013921	AAT	2	6	41895	41900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013921	AGG	2	6	41937	41942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013921	ATT	2	6	41947	41952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013921	TTC	2	6	42912	42917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013921	TAT	2	6	42924	42929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013921	T	6	6	43022	43027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013921	TAA	2	6	43856	43861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013921	AAAT	2	8	43873	43880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_013921	GGT	2	6	47408	47413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_013921	GGT	2	6	47463	47468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_013921	TA	3	6	53138	53143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013921	ATTCA	2	10	53154	53163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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259	NC_013921	TAAGA	2	10	53241	53250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_013921	TTA	2	6	64141	64146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_013921	CTT	2	6	64229	64234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_013921	T	6	6	67614	67619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013921	ATTT	2	8	68652	68659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_013921	T	7	7	68671	68677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013921	T	6	6	68686	68691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013921	TCT	2	6	68742	68747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_013921	TAA	2	6	68773	68778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013921	TGA	2	6	70179	70184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013921	ATGG	2	8	70282	70289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
286	NC_013921	CCG	2	6	70333	70338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_013921	CAA	2	6	70425	70430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_013921	T	6	6	70453	70458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013921	AAG	2	6	70493	70498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013921	ATA	3	9	70507	70515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013921	TGA	2	6	70543	70548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_013921	AGG	2	6	70550	70555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_013921	AAC	2	6	72830	72835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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426	NC_013921	ATA	2	6	99617	99622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_013921	AT	3	6	99900	99905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_013921	CAG	2	6	100013	100018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_013921	CCG	2	6	101505	101510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
436	NC_013921	GTAC	2	8	101522	101529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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438	NC_013921	AATAA	2	10	101550	101559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_013921	TA	3	6	120522	120527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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