MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 5438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_013889	CT	3	6	1927893	1927898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_013889	CAC	2	6	1927932	1927937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_013889	ACT	2	6	1928869	1928874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_013889	CGC	2	6	1928906	1928911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_013889	CG	3	6	1928974	1928979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_013889	ACT	2	6	1928987	1928992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_013889	CGC	2	6	1929024	1929029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_013889	ACT	2	6	1929074	1929079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_013889	CGC	2	6	1929111	1929116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_013889	CG	3	6	1929152	1929157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_013889	ACT	2	6	1929165	1929170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_013889	CGC	2	6	1929202	1929207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_013889	CG	3	6	1929243	1929248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_013889	CCG	2	6	1929257	1929262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_013889	CGC	2	6	1929266	1929271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_013889	CG	3	6	1929329	1929334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_013889	CCG	2	6	1929343	1929348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_013889	CGC	2	6	1929352	1929357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_013889	CGT	2	6	1929408	1929413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_013889	A	6	6	1929461	1929466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_013889	A	6	6	1929495	1929500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013889	TTG	2	6	1929537	1929542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013889	TA	3	6	1930715	1930720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013889	CAC	2	6	1930721	1930726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_013889	A	6	6	1930754	1930759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013889	GGT	2	6	1930785	1930790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013889	GGAA	2	8	1930818	1930825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_013889	AGA	2	6	1930859	1930864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_013889	AAG	2	6	1930867	1930872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_013889	A	6	6	1930931	1930936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013889	TTG	2	6	1931032	1931037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_013889	AGG	2	6	1931137	1931142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_013889	CCT	2	6	1931197	1931202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_013889	CAG	2	6	1931659	1931664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_013889	TGGT	2	8	1931985	1931992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013889	TAC	2	6	1931999	1932004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_013889	GAGG	2	8	1932014	1932021	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4040	NC_013889	G	6	6	1932070	1932075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013889	GGC	2	6	1932111	1932116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_013889	AT	3	6	1932150	1932155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013889	GAGCC	2	10	1932161	1932170	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4044	NC_013889	GAGCC	2	10	1932244	1932253	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4045	NC_013889	GTTG	2	8	1932269	1932276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_013889	GGGCT	2	10	1932293	1932302	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4047	NC_013889	CCCG	2	8	1932393	1932400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4048	NC_013889	GGC	2	6	1932410	1932415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013889	GAT	2	6	1933210	1933215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_013889	TG	3	6	1933248	1933253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013889	ATC	2	6	1933268	1933273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_013889	CGG	2	6	1933451	1933456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_013889	GC	3	6	1933474	1933479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_013889	GGC	2	6	1936019	1936024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4058	NC_013889	GCC	2	6	1938558	1938563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_013889	CA	3	6	1938601	1938606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_013889	CG	3	6	1938654	1938659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_013889	GCC	2	6	1938669	1938674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_013889	CGC	2	6	1939231	1939236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_013889	GGATG	2	10	1939245	1939254	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013889	GAT	2	6	1940049	1940054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013889	AC	3	6	1940166	1940171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_013889	GCG	2	6	1940239	1940244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_013889	GC	4	8	1940300	1940307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_013889	CGCA	2	8	1940364	1940371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_013889	CGAGCG	2	12	1940381	1940392	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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4071	NC_013889	GTG	2	6	1942823	1942828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013889	CCAA	2	8	1942834	1942841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_013889	T	6	6	1942871	1942876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_013889	CA	4	8	1942879	1942886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_013889	TTCGT	2	10	1944219	1944228	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4076	NC_013889	GCA	2	6	1944249	1944254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4078	NC_013889	AAC	2	6	1944315	1944320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_013889	TCT	2	6	1944661	1944666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4082	NC_013889	GTT	2	6	1945115	1945120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_013889	GC	4	8	1945133	1945140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_013889	CGCA	2	8	1945197	1945204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_013889	ACC	2	6	1947154	1947159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_013889	GCC	2	6	1948497	1948502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_013889	CGG	3	9	1948509	1948517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4089	NC_013889	CGG	2	6	1948585	1948590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_013889	CTC	2	6	1948603	1948608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_013889	GC	3	6	1950095	1950100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_013889	GCA	2	6	1950105	1950110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_013889	GGGCC	2	10	1951162	1951171	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4094	NC_013889	AG	4	8	1951206	1951213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_013889	TGA	2	6	1952327	1952332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_013889	TGCG	2	8	1952361	1952368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_013889	ACG	2	6	1952534	1952539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_013889	GT	3	6	1952575	1952580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_013889	TCA	2	6	1952585	1952590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_013889	GTC	2	6	1952603	1952608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_013889	GCG	2	6	1952633	1952638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_013889	CGC	2	6	1952641	1952646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_013889	CTG	2	6	1953445	1953450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_013889	TCCGG	2	10	1953478	1953487	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4105	NC_013889	GC	3	6	1953512	1953517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_013889	CGG	2	6	1953565	1953570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_013889	CGCTCG	2	12	1953600	1953611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_013889	GCG	2	6	1953637	1953642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_013889	GC	3	6	1953794	1953799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_013889	GT	3	6	1953832	1953837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_013889	GCCG	2	8	1963630	1963637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_013889	GCG	2	6	1963684	1963689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_013889	TCA	2	6	1963707	1963712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_013889	CCG	2	6	1963736	1963741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_013889	CT	3	6	1963753	1963758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_013889	CTTG	2	8	1963783	1963790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_013889	AAG	2	6	1963807	1963812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_013889	CGCTG	2	10	1963874	1963883	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4120	NC_013889	CGCTC	2	10	1963885	1963894	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4121	NC_013889	G	6	6	1963949	1963954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013889	CGG	2	6	1963970	1963975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_013889	ATGG	2	8	1963993	1964000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_013889	CG	3	6	1964028	1964033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_013889	CGCC	2	8	1964055	1964062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4126	NC_013889	GGCC	2	8	1964251	1964258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_013889	GCC	2	6	1964322	1964327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_013889	GC	3	6	1964334	1964339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_013889	CTT	2	6	1964385	1964390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_013889	AAG	2	6	1964401	1964406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_013889	GGCGC	2	10	1964427	1964436	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4132	NC_013889	ATC	2	6	1965036	1965041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_013889	AGG	2	6	1965086	1965091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_013889	CCGG	2	8	1965762	1965769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_013889	GTGTT	2	10	1967589	1967598	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4137	NC_013889	GTG	2	6	1970837	1970842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_013889	GCCGG	2	10	2035164	2035173	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4255	NC_013889	CCCG	2	8	2035270	2035277	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4256	NC_013889	GCC	2	6	2035358	2035363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4257	NC_013889	GTT	2	6	2035365	2035370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_013889	CG	3	6	2035473	2035478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4260	NC_013889	TAG	2	6	2035497	2035502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_013889	TGCG	2	8	2042804	2042811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4393	NC_013889	CCGT	2	8	2114740	2114747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4396	NC_013889	A	6	6	2114801	2114806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_013889	AACGCG	2	12	2114822	2114833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4433	NC_013889	TGCC	2	8	2137704	2137711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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