MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 5438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013889	GGT	2	6	526563	526568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013889	GCC	2	6	526618	526623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_013889	GC	3	6	526634	526639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_013889	AT	3	6	526667	526672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013889	CGG	2	6	526680	526685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013889	GC	3	6	531131	531136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_013889	CGC	2	6	531150	531155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_013889	GCGCT	2	10	534344	534353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1009	NC_013889	CG	3	6	534354	534359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_013889	ATA	2	6	534414	534419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013889	TTG	2	6	534434	534439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013889	GGA	2	6	542303	542308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013889	GC	3	6	542318	542323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_013889	CGT	2	6	542381	542386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_013889	GCCTG	2	10	542433	542442	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1016	NC_013889	C	6	6	542503	542508	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1017	NC_013889	T	6	6	542915	542920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013889	CGGA	2	8	542957	542964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_013889	GTG	2	6	543002	543007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013889	A	6	6	543065	543070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013889	TGG	2	6	543081	543086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013889	GCGG	2	8	543146	543153	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_013889	GGC	2	6	543155	543160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013889	CGG	2	6	543783	543788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_013889	TC	3	6	543862	543867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_013889	GGT	2	6	548724	548729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013889	CATG	2	8	548760	548767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_013889	CGG	2	6	548803	548808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013889	CGC	2	6	548844	548849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_013889	TTCA	2	8	549489	549496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_013889	CGA	2	6	549507	549512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_013889	TGA	2	6	550141	550146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013889	TTG	2	6	550169	550174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013889	GGA	2	6	550660	550665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013889	GAT	2	6	552396	552401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_013889	CGGG	3	12	552408	552419	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_013889	GTGG	2	8	552433	552440	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013889	TGA	2	6	552523	552528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013889	A	7	7	552531	552537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013889	CA	3	6	553537	553542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_013889	CCTG	2	8	553578	553585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_013889	TGA	2	6	553594	553599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013889	ACG	2	6	558295	558300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013889	GC	3	6	558348	558353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_013889	GAATG	2	10	559803	559812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013889	CGGGC	2	10	559838	559847	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1047	NC_013889	GCC	2	6	559860	559865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_013889	GGT	2	6	559953	559958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013889	AAGC	2	8	559967	559974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_013889	CG	4	8	560021	560028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_013889	GAA	2	6	566294	566299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_013889	G	6	6	566307	566312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013889	GCG	2	6	566369	566374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_013889	GC	3	6	566408	566413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_013889	GCC	2	6	567424	567429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_013889	CTT	2	6	567441	567446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013889	GAATA	2	10	568242	568251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013889	CG	3	6	568252	568257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_013889	AGC	2	6	568306	568311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013889	GCT	2	6	568339	568344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013889	AAG	2	6	568349	568354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013889	AGA	2	6	568366	568371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013889	C	6	6	568393	568398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1064	NC_013889	CAG	2	6	568408	568413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013889	CTC	2	6	568415	568420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_013889	TCC	2	6	568423	568428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_013889	TGG	2	6	568431	568436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013889	T	8	8	568465	568472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013889	CGGC	2	8	571531	571538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_013889	TAA	2	6	571667	571672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013889	AAAAT	2	10	571680	571689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013889	CCGTT	2	10	571765	571774	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1073	NC_013889	GA	3	6	571800	571805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013889	T	6	6	572342	572347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013889	GGCC	2	8	572946	572953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_013889	GCTC	2	8	573010	573017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_013889	TC	3	6	573055	573060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_013889	GT	3	6	573080	573085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013889	CG	3	6	573095	573100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_013889	GC	3	6	573119	573124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_013889	CCAT	2	8	574120	574127	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_013889	GAGC	2	8	574169	574176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_013889	CGG	2	6	574200	574205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013889	GC	3	6	574231	574236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_013889	GGC	2	6	574257	574262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013889	GCC	2	6	574266	574271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_013889	ATC	2	6	574274	574279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013889	CCAT	2	8	574292	574299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_013889	GAGC	2	8	574341	574348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_013889	CGG	2	6	574372	574377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_013889	GGC	2	6	574429	574434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013889	GCC	2	6	574438	574443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_013889	ATC	2	6	574446	574451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013889	ACT	2	6	574517	574522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_013889	GAGC	2	8	574566	574573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_013889	CGG	2	6	574597	574602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013889	GC	3	6	574628	574633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_013889	GGC	2	6	574654	574659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_013889	GCC	2	6	574663	574668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_013889	ATC	2	6	574671	574676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013889	ACT	2	6	574742	574747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013889	GGC	2	6	574879	574884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_013889	GCC	2	6	574888	574893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_013889	ATC	2	6	574896	574901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013889	TCCCT	2	10	574984	574993	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1106	NC_013889	A	6	6	575124	575129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013889	AGGAG	2	10	575131	575140	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013889	AG	3	6	575139	575144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013889	GCG	2	6	576302	576307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013889	G	6	6	576403	576408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013889	GC	3	6	581305	581310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_013889	A	6	6	581325	581330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013889	GAT	2	6	581343	581348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013889	CTGTC	2	10	582273	582282	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1115	NC_013889	GC	3	6	582308	582313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_013889	GGC	2	6	583886	583891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_013889	GCC	2	6	583912	583917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_013889	TGGT	2	8	587894	587901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013889	CGG	2	6	587918	587923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013889	G	6	6	587957	587962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013889	TGA	2	6	588000	588005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013889	CGT	2	6	588051	588056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_013889	GC	5	10	588100	588109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_013889	CGG	2	6	588143	588148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_013889	ACGC	2	8	588163	588170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_013889	CGA	2	6	588176	588181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_013889	GTC	2	6	592755	592760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013889	GAG	2	6	596551	596556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013889	TAA	2	6	597853	597858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_013889	CGG	2	6	600681	600686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_013889	TGC	2	6	600759	600764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_013889	GCCG	2	8	602092	602099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_013889	CGG	2	6	602123	602128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_013889	CGCGG	2	10	602140	602149	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1135	NC_013889	TGC	2	6	602159	602164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_013889	CGG	2	6	602181	602186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_013889	ATT	2	6	602296	602301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_013889	GC	3	6	602384	602389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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