MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 5438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013889	GCG	2	6	262222	262227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_013889	GGA	2	6	265514	265519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013889	ATG	2	6	266259	266264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013889	CACT	2	8	266278	266285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_013889	GTG	2	6	266311	266316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013889	TGT	2	6	266539	266544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013889	T	6	6	266544	266549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013889	CAC	2	6	266587	266592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_013889	ATG	2	6	266656	266661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013889	GGA	2	6	266704	266709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013889	CCG	2	6	266727	266732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_013889	CGG	2	6	266858	266863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_013889	TCA	2	6	268546	268551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013889	CCA	2	6	268570	268575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_013889	CAGCA	2	10	268585	268594	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
516	NC_013889	GGGAA	2	10	268653	268662	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013889	GGC	2	6	268667	268672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_013889	GCCA	2	8	269864	269871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
519	NC_013889	GAAGCC	2	12	269888	269899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_013889	GGT	2	6	269913	269918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013889	CCA	2	6	269923	269928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_013889	CTG	2	6	269961	269966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013889	GCT	2	6	270029	270034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_013889	GCG	2	6	270051	270056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_013889	GCG	2	6	270208	270213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013889	GA	3	6	270232	270237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013889	GGCAG	2	10	270250	270259	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
528	NC_013889	CGT	2	6	272180	272185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013889	AATC	2	8	272224	272231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_013889	AGA	2	6	272244	272249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013889	CGCC	2	8	272269	272276	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
532	NC_013889	TCG	2	6	274192	274197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013889	CGC	2	6	274257	274262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_013889	GGT	2	6	274284	274289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013889	TCGCT	2	10	274331	274340	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
536	NC_013889	CCG	2	6	274408	274413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_013889	GC	3	6	278905	278910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_013889	GGGC	2	8	278914	278921	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
539	NC_013889	A	6	6	278944	278949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013889	GCGT	2	8	283217	283224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
541	NC_013889	GGC	2	6	283288	283293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013889	TTTTG	2	10	283349	283358	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013889	GCC	2	6	284166	284171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_013889	GCG	2	6	286671	286676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013889	CGG	2	6	294748	294753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013889	GCC	2	6	294833	294838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_013889	GCC	2	6	296257	296262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_013889	TCCC	2	8	303416	303423	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
549	NC_013889	AAT	2	6	303509	303514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013889	CTCGG	2	10	304055	304064	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
551	NC_013889	TAT	2	6	304073	304078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013889	GGGT	2	8	304092	304099	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013889	TCC	2	6	304123	304128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_013889	CG	3	6	304460	304465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_013889	T	6	6	304483	304488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013889	GCG	2	6	306209	306214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013889	GC	3	6	306232	306237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_013889	TG	3	6	306274	306279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013889	CAGA	2	8	306342	306349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_013889	GCT	2	6	306464	306469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_013889	GCT	2	6	306488	306493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_013889	GTC	2	6	306545	306550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_013889	GTTT	2	8	306551	306558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013889	AGG	2	6	306564	306569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013889	GTCC	2	8	307251	307258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_013889	CGG	2	6	307285	307290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013889	T	6	6	307295	307300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013889	GTG	3	9	307327	307335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013889	GGA	2	6	307392	307397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013889	GAT	2	6	313882	313887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013889	AAT	2	6	316867	316872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013889	ACC	2	6	316892	316897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_013889	CGT	2	6	322083	322088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013889	GCG	2	6	322115	322120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_013889	CGCA	2	8	322255	322262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
576	NC_013889	CGAGCG	2	12	322272	322283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_013889	AGCGC	2	10	322585	322594	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
578	NC_013889	GCCC	2	8	322595	322602	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
579	NC_013889	CGCA	2	8	322615	322622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_013889	GCG	2	6	324114	324119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_013889	GTC	2	6	324140	324145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_013889	AGC	2	6	325112	325117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013889	CG	3	6	328879	328884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_013889	CGC	3	9	329012	329020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_013889	CGT	2	6	329062	329067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013889	CATCC	2	10	329097	329106	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
587	NC_013889	GCTG	2	8	329119	329126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
588	NC_013889	TCA	2	6	329138	329143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013889	TCC	2	6	330010	330015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_013889	CTGG	2	8	331813	331820	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_013889	TGC	2	6	331821	331826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013889	CGC	2	6	331846	331851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_013889	AAT	2	6	331854	331859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013889	GAT	2	6	331880	331885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013889	GGGC	2	8	331910	331917	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
596	NC_013889	C	6	6	332903	332908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
597	NC_013889	GGC	2	6	342493	342498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013889	CGG	2	6	342663	342668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_013889	GT	3	6	342669	342674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013889	CTG	2	6	342676	342681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013889	CCGCC	2	10	345144	345153	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
602	NC_013889	CGA	2	6	346243	346248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_013889	GCG	2	6	346251	346256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013889	GT	3	6	347733	347738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013889	ACT	2	6	347757	347762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_013889	GC	3	6	349290	349295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_013889	CCA	2	6	349325	349330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_013889	CGGG	2	8	350451	350458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
609	NC_013889	GCCG	2	8	350519	350526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_013889	CAT	3	9	350534	350542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_013889	TCA	2	6	350889	350894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013889	CGC	2	6	352380	352385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_013889	GCG	2	6	354774	354779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013889	GCA	2	6	354804	354809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013889	G	6	6	354823	354828	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013889	CTC	2	6	356073	356078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_013889	AGG	2	6	356154	356159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013889	T	6	6	356571	356576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013889	GAG	2	6	361194	361199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013889	TGG	3	9	361210	361218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013889	CCGT	2	8	361241	361248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_013889	CGCTCG	2	12	361340	361351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
623	NC_013889	GCG	2	6	364703	364708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013889	GC	3	6	364751	364756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_013889	CAT	2	6	364762	364767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013889	CCG	2	6	364769	364774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013889	CGG	2	6	364783	364788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013889	CAA	2	6	364842	364847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013889	GCG	2	6	364918	364923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013889	GC	3	6	364966	364971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_013889	CAT	2	6	364977	364982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013889	CGG	2	6	364998	365003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_013889	AGGC	2	8	365050	365057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_013889	AAC	2	6	365058	365063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013889	GCG	2	6	365133	365138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013889	CGAC	2	8	365145	365152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
637	NC_013889	CGC	2	6	365156	365161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_013889	CAT	2	6	365193	365198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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