MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 5438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013889	GCA	2	6	2478664	2478669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_013889	CAG	2	6	2478671	2478676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_013889	TCC	2	6	2482394	2482399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_013889	AG	3	6	2484004	2484009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013889	ACGGC	2	10	2484016	2484025	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5006	NC_013889	GACC	2	8	2485510	2485517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_013889	GCC	2	6	2485556	2485561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_013889	GGC	2	6	2485575	2485580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_013889	TCG	2	6	2485644	2485649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_013889	GCC	2	6	2489088	2489093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_013889	CGC	2	6	2489172	2489177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_013889	GCA	2	6	2490135	2490140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_013889	AGCGA	2	10	2491227	2491236	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5014	NC_013889	GCC	2	6	2491245	2491250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_013889	CTT	2	6	2491308	2491313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_013889	AAG	2	6	2491324	2491329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_013889	GGCGC	2	10	2491350	2491359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5018	NC_013889	GCAG	2	8	2491374	2491381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_013889	CGA	3	9	2491409	2491417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_013889	AGC	2	6	2491442	2491447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_013889	GGCG	2	8	2493567	2493574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_013889	CCGG	2	8	2493599	2493606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_013889	CGGTG	2	10	2493637	2493646	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5024	NC_013889	G	7	7	2496735	2496741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013889	ACC	2	6	2496764	2496769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_013889	GGT	2	6	2496773	2496778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_013889	CGG	2	6	2496785	2496790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_013889	ATCA	2	8	2496819	2496826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_013889	CTT	2	6	2498069	2498074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_013889	CGCA	2	8	2500079	2500086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_013889	CG	3	6	2500106	2500111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_013889	ATAGC	2	10	2500366	2500375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5033	NC_013889	CGAC	2	8	2500553	2500560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_013889	TCAA	2	8	2500581	2500588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_013889	GC	3	6	2500632	2500637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_013889	CCGA	2	8	2502039	2502046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_013889	A	7	7	2504445	2504451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_013889	TGC	2	6	2504475	2504480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_013889	TCC	2	6	2505560	2505565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_013889	GTA	2	6	2505585	2505590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013889	A	6	6	2505590	2505595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_013889	GC	3	6	2507081	2507086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_013889	GAAAA	2	10	2508296	2508305	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013889	GGC	2	6	2511499	2511504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_013889	GCG	2	6	2511510	2511515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_013889	GCG	2	6	2511526	2511531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_013889	CA	3	6	2511563	2511568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_013889	AGC	2	6	2511604	2511609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_013889	G	7	7	2511728	2511734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_013889	TCG	2	6	2511746	2511751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_013889	GAG	2	6	2513029	2513034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013889	GTT	2	6	2514561	2514566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013889	GGGC	2	8	2514580	2514587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_013889	CTT	2	6	2514608	2514613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_013889	GGA	2	6	2514621	2514626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013889	CCG	2	6	2524376	2524381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_013889	GCG	2	6	2525358	2525363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_013889	CT	3	6	2525805	2525810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_013889	CA	3	6	2525853	2525858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_013889	TGCC	2	8	2525866	2525873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_013889	AGC	2	6	2525880	2525885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_013889	AGC	2	6	2529851	2529856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_013889	CGT	2	6	2533738	2533743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_013889	CCCG	2	8	2533763	2533770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5065	NC_013889	GCC	2	6	2533850	2533855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_013889	GTT	2	6	2533857	2533862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_013889	GC	4	8	2533874	2533881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_013889	CGG	2	6	2533917	2533922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_013889	CGCA	2	8	2533938	2533945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_013889	CGAGCG	2	12	2533955	2533966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_013889	GAG	2	6	2534977	2534982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013889	TTCGC	2	10	2534998	2535007	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5073	NC_013889	CGGG	2	8	2537363	2537370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_013889	GCC	2	6	2538441	2538446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_013889	GCCCC	2	10	2538456	2538465	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5076	NC_013889	CCGC	2	8	2538505	2538512	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5077	NC_013889	GGC	2	6	2538515	2538520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5079	NC_013889	GC	3	6	2540197	2540202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_013889	CTTG	2	8	2540216	2540223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_013889	AAG	2	6	2540240	2540245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_013889	G	6	6	2540384	2540389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013889	CGCC	2	8	2540489	2540496	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5085	NC_013889	TCCC	2	8	2540631	2540638	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5086	NC_013889	CTT	2	6	2540802	2540807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_013889	AAG	2	6	2540818	2540823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013889	CAA	2	6	2540836	2540841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_013889	GGCA	2	8	2540872	2540879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5090	NC_013889	ACG	2	6	2540929	2540934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_013889	CCGG	2	8	2540966	2540973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_013889	A	7	7	2543206	2543212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013889	ATC	2	6	2543228	2543233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_013889	CGG	2	6	2546008	2546013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5096	NC_013889	GGC	2	6	2546512	2546517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_013889	GCC	2	6	2546518	2546523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_013889	A	6	6	2546586	2546591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013889	GAT	2	6	2546610	2546615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013889	TGC	2	6	2547195	2547200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_013889	CGG	2	6	2547205	2547210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_013889	CGG	2	6	2547238	2547243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_013889	GCTG	2	8	2547259	2547266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_013889	TTC	2	6	2547276	2547281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_013889	AAG	2	6	2550492	2550497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_013889	GAG	2	6	2550569	2550574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013889	GCC	2	6	2554786	2554791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_013889	TCG	2	6	2554832	2554837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_013889	CGT	2	6	2556243	2556248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_013889	ACG	2	6	2557264	2557269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_013889	CCACC	2	10	2558713	2558722	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5112	NC_013889	GCAA	2	8	2558723	2558730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_013889	CA	3	6	2559632	2559637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_013889	TG	3	6	2559713	2559718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_013889	GGC	2	6	2559733	2559738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_013889	GCC	2	6	2559775	2559780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5119	NC_013889	T	6	6	2559800	2559805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013889	TCG	2	6	2559811	2559816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_013889	TTG	2	6	2560809	2560814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_013889	GC	3	6	2561341	2561346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_013889	CG	3	6	2563292	2563297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_013889	AGC	2	6	2563322	2563327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5126	NC_013889	TGT	2	6	2563393	2563398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_013889	CGT	2	6	2563431	2563436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_013889	AGG	2	6	2563478	2563483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_013889	CA	3	6	2564979	2564984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_013889	CCT	2	6	2565025	2565030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_013889	CCCAGA	2	12	2566329	2566340	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_013889	ACA	2	6	2566799	2566804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_013889	A	6	6	2566830	2566835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_013889	GAC	2	6	2571231	2571236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5137	NC_013889	CTG	2	6	2575526	2575531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5138	NC_013889	TGAC	2	8	2575567	2575574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5139	NC_013889	AAT	2	6	2575684	2575689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_013889	CGAC	2	8	2575697	2575704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5141	NC_013889	CG	4	8	2575749	2575756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5142	NC_013889	CCA	2	6	2575816	2575821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5144	NC_013889	A	6	6	2576163	2576168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_013889	CCA	2	6	2608896	2608901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5263	NC_013889	ACG	2	6	2609957	2609962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_013889	CG	3	6	2609991	2609996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5265	NC_013889	CGCTCG	2	12	2610055	2610066	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5267	NC_013889	CA	3	6	2610143	2610148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5272	NC_013889	CG	3	6	2610749	2610754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5273	NC_013889	TGC	2	6	2610755	2610760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5277	NC_013889	GCG	2	6	2611894	2611899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5282	NC_013889	GCGTC	2	10	2613633	2613642	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5300	NC_013889	GACT	2	8	2619776	2619783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5303	NC_013889	ATCG	2	8	2620553	2620560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5363	NC_013889	TGCG	2	8	2688083	2688090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5389	NC_013889	CGCTCG	2	12	2705511	2705522	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5391	NC_013889	CCG	2	6	2705555	2705560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5392	NC_013889	CGGG	2	8	2705693	2705700	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5393	NC_013889	ACG	2	6	2705720	2705725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_013889	GT	3	6	2705761	2705766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_013889	ACCG	2	8	2706764	2706771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5396	NC_013889	CAGC	2	8	2706784	2706791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5397	NC_013889	CG	3	6	2706851	2706856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5398	NC_013889	CCA	2	6	2708829	2708834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5399	NC_013889	CGG	2	6	2709794	2709799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5400	NC_013889	T	6	6	2709803	2709808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_013889	CGAC	2	8	2714093	2714100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5402	NC_013889	GCG	2	6	2715538	2715543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5403	NC_013889	CG	3	6	2717654	2717659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5404	NC_013889	GCA	2	6	2720025	2720030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5405	NC_013889	ACC	2	6	2720062	2720067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5406	NC_013889	ATG	2	6	2720095	2720100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5407	NC_013889	GCC	2	6	2721631	2721636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5408	NC_013889	CGG	2	6	2721651	2721656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5409	NC_013889	T	6	6	2721658	2721663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5410	NC_013889	GCG	2	6	2723359	2723364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5411	NC_013889	GCC	2	6	2723382	2723387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5412	NC_013889	CA	3	6	2723431	2723436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5413	NC_013889	CAAAA	2	10	2725363	2725372	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5414	NC_013889	GC	3	6	2725748	2725753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5415	NC_013889	CCCG	2	8	2725768	2725775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5416	NC_013889	CTC	2	6	2727684	2727689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5417	NC_013889	ATG	2	6	2727699	2727704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5418	NC_013889	CGCTCG	2	12	2727713	2727724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5419	NC_013889	TGCG	2	8	2727734	2727741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5420	NC_013889	GCG	2	6	2727750	2727755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5421	NC_013889	CTG	2	6	2727757	2727762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5422	NC_013889	CAA	2	6	2727817	2727822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5423	NC_013889	GGC	2	6	2727825	2727830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5424	NC_013889	ACG	2	6	2727908	2727913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5425	NC_013889	TCA	2	6	2727959	2727964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5426	NC_013889	TCG	2	6	2729405	2729410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5427	NC_013889	GCCGA	2	10	2731260	2731269	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5428	NC_013889	CGG	2	6	2731281	2731286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5429	NC_013889	CACC	2	8	2736351	2736358	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5430	NC_013889	GC	3	6	2736374	2736379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5431	NC_013889	CGCGCT	2	12	2737353	2737364	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5432	NC_013889	TGCG	2	8	2737376	2737383	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5433	NC_013889	GCA	2	6	2737406	2737411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5434	NC_013889	GC	4	8	2737439	2737446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5435	NC_013889	ACG	2	6	2737534	2737539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5436	NC_013889	GGC	2	6	2740878	2740883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5437	NC_013889	CAG	2	6	2740899	2740904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5438	NC_013889	GTGGCG	2	12	2740915	2740926	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

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