MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 5438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013889	CGC	2	6	2177782	2177787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_013889	GCA	2	6	2177802	2177807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_013889	CACAG	2	10	2177828	2177837	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4504	NC_013889	CGA	2	6	2177838	2177843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013889	GAC	2	6	2177916	2177921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_013889	TAA	2	6	2177930	2177935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_013889	TCC	2	6	2181838	2181843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_013889	CTT	2	6	2181908	2181913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_013889	AAG	2	6	2181924	2181929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_013889	GCG	2	6	2182011	2182016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_013889	TCGCT	2	10	2182024	2182033	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4512	NC_013889	CT	3	6	2182048	2182053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_013889	CGA	2	6	2182081	2182086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_013889	G	6	6	2182091	2182096	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013889	GCC	2	6	2182369	2182374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_013889	GCAA	2	8	2182442	2182449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_013889	GC	3	6	2182464	2182469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_013889	AGTC	2	8	2182475	2182482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4519	NC_013889	GCCA	2	8	2182533	2182540	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_013889	CAA	2	6	2182541	2182546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_013889	GGC	2	6	2182551	2182556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_013889	GCT	2	6	2182575	2182580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_013889	CGGT	2	8	2184953	2184960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_013889	TGC	2	6	2185887	2185892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_013889	CGC	2	6	2185921	2185926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_013889	ACC	2	6	2185932	2185937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_013889	CGC	2	6	2185944	2185949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_013889	CAGC	2	8	2185951	2185958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_013889	GAC	2	6	2185997	2186002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_013889	CGA	2	6	2186083	2186088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_013889	GGAT	2	8	2186140	2186147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_013889	CAT	2	6	2186235	2186240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_013889	TAA	2	6	2186275	2186280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013889	T	6	6	2186297	2186302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013889	TCCAT	2	10	2187418	2187427	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4536	NC_013889	GAG	2	6	2187429	2187434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_013889	C	7	7	2187498	2187504	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4538	NC_013889	TGT	2	6	2187509	2187514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_013889	CG	3	6	2187583	2187588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_013889	TGCCA	2	10	2187618	2187627	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4541	NC_013889	CAA	2	6	2187636	2187641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_013889	CCCG	2	8	2188613	2188620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4543	NC_013889	GGCCC	2	10	2188632	2188641	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4544	NC_013889	CTGC	2	8	2188713	2188720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_013889	C	6	6	2188902	2188907	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4546	NC_013889	GACG	2	8	2188913	2188920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_013889	G	6	6	2189964	2189969	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_013889	CG	3	6	2190495	2190500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_013889	GCC	2	6	2190527	2190532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_013889	ATC	2	6	2190546	2190551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_013889	CCT	2	6	2192044	2192049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_013889	AG	3	6	2192058	2192063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_013889	CTC	2	6	2192835	2192840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_013889	GTC	2	6	2192893	2192898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_013889	CCA	2	6	2194025	2194030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_013889	CAA	2	6	2194064	2194069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_013889	A	6	6	2194068	2194073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_013889	CGTGC	2	10	2194128	2194137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4559	NC_013889	AGA	2	6	2196378	2196383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_013889	GTT	2	6	2196386	2196391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013889	AGC	2	6	2196439	2196444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_013889	CTG	2	6	2196445	2196450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_013889	CGG	2	6	2196536	2196541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_013889	GGT	2	6	2197144	2197149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_013889	CGG	2	6	2197176	2197181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_013889	CGA	2	6	2197211	2197216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_013889	TGG	2	6	2197305	2197310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_013889	GCTC	2	8	2197312	2197319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_013889	CGT	2	6	2197332	2197337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_013889	GCT	2	6	2197341	2197346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_013889	CGC	2	6	2197347	2197352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_013889	GCC	2	6	2197363	2197368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_013889	AGGG	2	8	2197451	2197458	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_013889	CCA	2	6	2198023	2198028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_013889	CAT	2	6	2198090	2198095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_013889	GCTG	2	8	2198096	2198103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_013889	TCT	2	6	2198125	2198130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_013889	CTGG	2	8	2198150	2198157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4579	NC_013889	CCA	2	6	2198547	2198552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_013889	TGC	2	6	2198592	2198597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_013889	GAT	2	6	2198619	2198624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_013889	GGCCGG	2	12	2198665	2198676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_013889	CGT	2	6	2199342	2199347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_013889	GC	3	6	2199444	2199449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_013889	GGA	2	6	2199500	2199505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_013889	CG	3	6	2200474	2200479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_013889	GC	3	6	2200480	2200485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_013889	CG	3	6	2200532	2200537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_013889	CGC	2	6	2200563	2200568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_013889	GAGG	2	8	2200643	2200650	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_013889	GC	3	6	2201362	2201367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_013889	CCT	2	6	2201861	2201866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_013889	AT	3	6	2201959	2201964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_013889	CGC	2	6	2202040	2202045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_013889	ACGA	2	8	2202957	2202964	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_013889	CATC	2	8	2203350	2203357	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_013889	TC	3	6	2203356	2203361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_013889	CTTCG	2	10	2203472	2203481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4599	NC_013889	TCA	2	6	2204486	2204491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_013889	CCG	2	6	2204525	2204530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_013889	GAG	2	6	2205071	2205076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013889	GGCT	2	8	2205128	2205135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_013889	ATC	2	6	2205272	2205277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_013889	TG	3	6	2205281	2205286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_013889	CG	3	6	2205307	2205312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_013889	TGCG	2	8	2205332	2205339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_013889	GC	4	8	2205396	2205403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_013889	AAC	2	6	2205415	2205420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_013889	GGC	2	6	2205422	2205427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_013889	AATC	2	8	2205495	2205502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_013889	CGGG	2	8	2205508	2205515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_013889	ACG	2	6	2205535	2205540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_013889	G	6	6	2205559	2205564	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_013889	TGA	2	6	2205670	2205675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_013889	CGGGCA	2	12	2205679	2205690	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_013889	ACC	2	6	2205717	2205722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_013889	ATC	2	6	2205750	2205755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_013889	CGG	2	6	2205809	2205814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_013889	CTG	2	6	2205822	2205827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_013889	CGG	2	6	2205919	2205924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_013889	CCA	2	6	2206006	2206011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_013889	CAC	2	6	2206037	2206042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_013889	CGAGGC	2	12	2206049	2206060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_013889	CTG	2	6	2206062	2206067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_013889	GCG	2	6	2206078	2206083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_013889	GCC	2	6	2206090	2206095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_013889	C	6	6	2206094	2206099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4628	NC_013889	AC	3	6	2206108	2206113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_013889	CTG	2	6	2207622	2207627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_013889	GGC	2	6	2207678	2207683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_013889	CAG	2	6	2208899	2208904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_013889	TCC	2	6	2210306	2210311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_013889	GAT	2	6	2210320	2210325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_013889	GCC	2	6	2210329	2210334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4635	NC_013889	GCC	2	6	2210365	2210370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4636	NC_013889	TCA	2	6	2212055	2212060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4637	NC_013889	CAT	2	6	2218149	2218154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4639	NC_013889	CG	3	6	2220580	2220585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4640	NC_013889	GCT	2	6	2220617	2220622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4641	NC_013889	CAA	2	6	2220643	2220648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4642	NC_013889	TTGCA	2	10	2220649	2220658	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4646	NC_013889	GGAT	2	8	2221678	2221685	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4647	NC_013889	ACC	2	6	2221695	2221700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4648	NC_013889	GCT	2	6	2221706	2221711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4650	NC_013889	TGCC	2	8	2222486	2222493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4651	NC_013889	CTT	2	6	2224268	2224273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4652	NC_013889	TCG	2	6	2225855	2225860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4654	NC_013889	CCA	2	6	2228842	2228847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4655	NC_013889	CGC	2	6	2229417	2229422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4658	NC_013889	CG	3	6	2237597	2237602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4661	NC_013889	GGCC	2	8	2239251	2239258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4662	NC_013889	G	6	6	2242148	2242153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4663	NC_013889	GGC	2	6	2246634	2246639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4665	NC_013889	CG	3	6	2247733	2247738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4666	NC_013889	CGCTCG	2	12	2250154	2250165	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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4729	NC_013889	TTCCA	2	10	2297450	2297459	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4744	NC_013889	AGCC	2	8	2308278	2308285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4748	NC_013889	GT	3	6	2311961	2311966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4749	NC_013889	CGG	2	6	2312018	2312023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4761	NC_013889	CGTC	2	8	2328700	2328707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4762	NC_013889	AGC	2	6	2328721	2328726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4894	NC_013889	CAGAA	2	10	2425790	2425799	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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