MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 2968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013642	ATC	2	6	735863	735868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_013642	GGC	2	6	735937	735942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_013642	GAGG	2	8	735998	736005	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013642	CCT	2	6	740702	740707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_013642	AGG	2	6	740749	740754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_013642	AAG	2	6	740755	740760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013642	ACC	2	6	746847	746852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_013642	TCC	2	6	759897	759902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_013642	AAT	2	6	764604	764609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013642	TAT	2	6	764649	764654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013642	ACA	2	6	767479	767484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013642	ATT	2	6	767506	767511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013642	TAAT	2	8	767521	767528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013642	ATA	2	6	767535	767540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013642	AGG	2	6	767553	767558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013642	AGG	2	6	768704	768709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013642	GGTG	2	8	770849	770856	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013642	GAG	2	6	772584	772589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013642	CTC	2	6	772601	772606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_013642	A	6	6	776500	776505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013642	TGT	2	6	776515	776520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013642	A	6	6	776522	776527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013642	AGG	2	6	776529	776534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013642	CCT	2	6	781574	781579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_013642	GAA	2	6	781598	781603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013642	CGA	2	6	781612	781617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_013642	CCAT	2	8	781630	781637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_013642	ATA	2	6	781650	781655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013642	AT	3	6	781690	781695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013642	TG	3	6	781736	781741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013642	TTTGCA	2	12	781766	781777	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1032	NC_013642	GAG	2	6	788426	788431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013642	CCG	2	6	789664	789669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_013642	G	6	6	789797	789802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013642	ATA	3	9	801105	801113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_013642	TAT	2	6	801114	801119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013642	AGA	2	6	801121	801126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013642	GC	3	6	801199	801204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_013642	AGG	2	6	801218	801223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013642	T	7	7	801254	801260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013642	GAA	2	6	801264	801269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013642	ATT	2	6	801278	801283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013642	AGG	2	6	801286	801291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013642	TCC	2	6	803732	803737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_013642	ACC	2	6	807609	807614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_013642	TAT	2	6	807638	807643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_013642	TAG	3	9	807644	807652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013642	ATA	2	6	807656	807661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013642	GGT	2	6	807671	807676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013642	TGA	2	6	807711	807716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013642	TAA	2	6	807723	807728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_013642	ACC	2	6	807741	807746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_013642	GGTA	2	8	807752	807759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013642	GGTA	2	8	807763	807770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013642	GGT	2	6	807813	807818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013642	TTGT	2	8	807878	807885	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013642	TGA	2	6	807905	807910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013642	ACC	2	6	807926	807931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_013642	TGG	2	6	807965	807970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013642	GTTT	2	8	807974	807981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013642	AT	3	6	807985	807990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013642	TAC	2	6	808052	808057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013642	ACC	2	6	808076	808081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_013642	TAA	2	6	808105	808110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013642	CA	3	6	808127	808132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1067	NC_013642	TAA	2	6	810759	810764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013642	TG	3	6	810768	810773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013642	TGA	2	6	810835	810840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013642	GA	3	6	810869	810874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013642	AGG	2	6	810885	810890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013642	T	6	6	813914	813919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1074	NC_013642	C	6	6	814429	814434	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1075	NC_013642	A	6	6	814436	814441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013642	TGGT	2	8	816171	816178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013642	AGG	2	6	816237	816242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013642	ATT	2	6	824582	824587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013642	AGG	2	6	824608	824613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013642	G	6	6	835143	835148	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013642	AAG	2	6	836303	836308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013642	TAT	2	6	839429	839434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013642	AGA	2	6	839479	839484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013642	AGC	2	6	839567	839572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_013642	TTG	2	6	839581	839586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013642	GGC	2	6	839640	839645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013642	GAG	2	6	839689	839694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013642	GCG	2	6	839701	839706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013642	TGG	2	6	839800	839805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013642	GGA	2	6	839829	839834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013642	TGG	2	6	839859	839864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013642	CCA	2	6	839874	839879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_013642	CGA	2	6	839883	839888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_013642	GGT	2	6	839908	839913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013642	GCA	2	6	839957	839962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1098	NC_013642	GAA	2	6	840053	840058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_013642	GGA	2	6	840067	840072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013642	CAG	2	6	840125	840130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013642	GT	3	6	840199	840204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013642	G	6	6	840440	840445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013642	GCC	2	6	840482	840487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_013642	GGT	2	6	840605	840610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013642	GGT	2	6	840663	840668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013642	CGT	2	6	840676	840681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1108	NC_013642	GGA	2	6	840790	840795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013642	AGG	2	6	840796	840801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_013642	CGC	2	6	840980	840985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_013642	AC	3	6	841010	841015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_013642	AGGG	2	8	841071	841078	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013642	G	7	7	841076	841082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013642	G	6	6	841104	841109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013642	CCT	2	6	841155	841160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_013642	GCT	2	6	841180	841185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_013642	GGCTCG	2	12	841200	841211	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013642	GGT	2	6	841254	841259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013642	TGG	2	6	841283	841288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013642	AGG	2	6	841327	841332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013642	CCA	2	6	841357	841362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_013642	AGG	2	6	841399	841404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_013642	TAG	2	6	841632	841637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013642	GCGA	2	8	841640	841647	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1129	NC_013642	GTG	2	6	841670	841675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_013642	CTC	2	6	841758	841763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_013642	ACC	2	6	841771	841776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_013642	GGGA	2	8	841820	841827	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013642	G	6	6	841883	841888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013642	ACC	2	6	841889	841894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_013642	TAC	2	6	841908	841913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_013642	CCG	2	6	841914	841919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1411	NC_013642	TGA	2	6	985610	985615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_013642	GATG	2	8	985700	985707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_013642	TG	3	6	985706	985711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_013642	T	6	6	985713	985718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_013642	AGA	2	6	986800	986805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_013642	ATC	2	6	986816	986821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_013642	T	6	6	995010	995015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1453	NC_013642	A	7	7	1002328	1002334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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