MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 3186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013522	AGG	2	6	1728323	1728328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_013522	C	6	6	1728374	1728379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3003	NC_013522	C	7	7	1728404	1728410	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3004	NC_013522	GTG	2	6	1728451	1728456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_013522	GT	3	6	1728466	1728471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013522	GT	3	6	1728636	1728641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_013522	ATG	2	6	1728661	1728666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_013522	CGT	2	6	1728673	1728678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_013522	TCC	2	6	1728687	1728692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_013522	CACGA	2	10	1728787	1728796	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3011	NC_013522	GAC	2	6	1728800	1728805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_013522	GCA	2	6	1728812	1728817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_013522	ACC	2	6	1728869	1728874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_013522	AGGTG	2	10	1728889	1728898	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_013522	CATC	2	8	1729049	1729056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_013522	GCC	2	6	1729139	1729144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_013522	TCC	2	6	1729159	1729164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_013522	GCC	2	6	1729285	1729290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_013522	GCT	2	6	1729349	1729354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_013522	CTT	2	6	1729399	1729404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_013522	CA	3	6	1729407	1729412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_013522	CTT	2	6	1729436	1729441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_013522	CTG	2	6	1729495	1729500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_013522	CTA	2	6	1729598	1729603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_013522	CAG	2	6	1729683	1729688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_013522	CTA	2	6	1729767	1729772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_013522	CGC	2	6	1729799	1729804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_013522	CCG	2	6	1729944	1729949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_013522	CTA	2	6	1730044	1730049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_013522	CGA	2	6	1730059	1730064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_013522	TCC	2	6	1738206	1738211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_013522	A	6	6	1738264	1738269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_013522	CCT	2	6	1739034	1739039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_013522	GAG	2	6	1739085	1739090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_013522	CTC	2	6	1739101	1739106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_013522	CGG	2	6	1740339	1740344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_013522	CCT	2	6	1741060	1741065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_013522	TC	3	6	1741112	1741117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_013522	CCCG	2	8	1741130	1741137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3040	NC_013522	TCC	2	6	1746843	1746848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_013522	CCCG	2	8	1746871	1746878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3042	NC_013522	TCC	2	6	1748066	1748071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_013522	C	7	7	1748081	1748087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3044	NC_013522	CCG	2	6	1748099	1748104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_013522	AAG	2	6	1749466	1749471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_013522	TAT	2	6	1749504	1749509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013522	G	6	6	1753427	1753432	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_013522	TAC	2	6	1753434	1753439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_013522	GAA	2	6	1759089	1759094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_013522	GGC	2	6	1759178	1759183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_013522	CGG	2	6	1761824	1761829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_013522	ATCC	2	8	1765629	1765636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_013522	C	6	6	1767663	1767668	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3054	NC_013522	TAT	2	6	1767690	1767695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_013522	ATA	2	6	1774018	1774023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_013522	G	6	6	1774051	1774056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_013522	CGG	2	6	1775809	1775814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_013522	AT	3	6	1775823	1775828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_013522	CGGGGG	2	12	1776791	1776802	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3060	NC_013522	C	6	6	1776812	1776817	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3061	NC_013522	CTG	2	6	1780896	1780901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_013522	C	7	7	1785190	1785196	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3063	NC_013522	C	7	7	1785207	1785213	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3064	NC_013522	G	6	6	1785238	1785243	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_013522	A	7	7	1785267	1785273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013522	CCTTC	2	10	1790878	1790887	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3067	NC_013522	TCC	2	6	1791593	1791598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_013522	CTC	2	6	1791600	1791605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_013522	GAT	2	6	1791618	1791623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_013522	GTAT	2	8	1791663	1791670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_013522	GGA	2	6	1791690	1791695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_013522	G	6	6	1791728	1791733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_013522	AGGG	2	8	1791789	1791796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_013522	GCG	2	6	1791799	1791804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_013522	GC	4	8	1791806	1791813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_013522	C	6	6	1791835	1791840	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3077	NC_013522	G	6	6	1791862	1791867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_013522	G	6	6	1794674	1794679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_013522	GAT	2	6	1795940	1795945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_013522	CT	3	6	1795959	1795964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_013522	GCCC	2	8	1796016	1796023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3082	NC_013522	A	6	6	1796088	1796093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_013522	G	6	6	1796094	1796099	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_013522	AGG	2	6	1798292	1798297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_013522	C	6	6	1799702	1799707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3086	NC_013522	ATC	2	6	1801047	1801052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_013522	AAT	2	6	1801062	1801067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_013522	AGG	2	6	1801071	1801076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_013522	AAGG	2	8	1805654	1805661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013522	TCC	2	6	1809445	1809450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_013522	T	7	7	1809475	1809481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_013522	AG	3	6	1809487	1809492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_013522	C	7	7	1809579	1809585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3094	NC_013522	G	6	6	1809641	1809646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_013522	GCC	2	6	1809687	1809692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_013522	GGC	2	6	1809698	1809703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_013522	CAC	2	6	1810224	1810229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_013522	ACC	2	6	1810243	1810248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_013522	CCA	2	6	1810274	1810279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_013522	CCA	2	6	1810341	1810346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_013522	CGG	2	6	1810351	1810356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_013522	G	6	6	1810377	1810382	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_013522	GTC	2	6	1810392	1810397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_013522	GAAGGG	2	12	1810435	1810446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_013522	TTC	2	6	1810512	1810517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_013522	AAT	2	6	1810597	1810602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_013522	G	7	7	1810632	1810638	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013522	CTC	2	6	1810776	1810781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_013522	GCC	2	6	1810814	1810819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_013522	GGA	3	9	1810835	1810843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_013522	AGG	2	6	1810870	1810875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_013522	GGGA	2	8	1810897	1810904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_013522	G	6	6	1811054	1811059	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_013522	CGG	2	6	1811141	1811146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_013522	G	6	6	1811286	1811291	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_013522	AACATC	2	12	1811344	1811355	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_013522	AGCG	2	8	1811443	1811450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_013522	AGG	2	6	1811472	1811477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_013522	GGAG	2	8	1811516	1811523	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_013522	GCG	2	6	1811596	1811601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_013522	CCA	2	6	1811644	1811649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_013522	GA	3	6	1811691	1811696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_013522	CAG	2	6	1811728	1811733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_013522	CGCT	2	8	1811746	1811753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_013522	CGC	2	6	1811917	1811922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_013522	GCAG	2	8	1811930	1811937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_013522	CGG	2	6	1811988	1811993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_013522	ATTTTT	2	12	1812066	1812077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_013522	GGT	2	6	1812082	1812087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_013522	G	7	7	1812145	1812151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_013522	GAG	2	6	1814293	1814298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_013522	ATC	2	6	1815558	1815563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_013522	ATG	2	6	1815661	1815666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_013522	TCAAG	2	10	1815685	1815694	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3135	NC_013522	TC	3	6	1816813	1816818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_013522	TGT	2	6	1816831	1816836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_013522	ATC	2	6	1816843	1816848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_013522	GCCGT	2	10	1816869	1816878	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3139	NC_013522	CCGAA	2	10	1816921	1816930	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3140	NC_013522	G	6	6	1816948	1816953	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_013522	GGA	2	6	1820999	1821004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_013522	A	8	8	1821022	1821029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_013522	G	6	6	1821040	1821045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_013522	TCCCC	2	10	1824200	1824209	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3145	NC_013522	TGA	2	6	1825743	1825748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_013522	GGA	2	6	1826407	1826412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_013522	GGTA	2	8	1826426	1826433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_013522	G	6	6	1826443	1826448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_013522	GA	3	6	1827714	1827719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_013522	T	6	6	1827720	1827725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_013522	ATA	2	6	1831089	1831094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_013522	AGG	2	6	1832268	1832273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_013522	G	6	6	1833903	1833908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_013522	C	6	6	1833927	1833932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3155	NC_013522	T	6	6	1833936	1833941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_013522	A	6	6	1834037	1834042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_013522	CCA	2	6	1836412	1836417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3158	NC_013522	CGG	2	6	1836438	1836443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3159	NC_013522	C	6	6	1836587	1836592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3160	NC_013522	T	7	7	1839962	1839968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_013522	ATA	2	6	1839973	1839978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_013522	TGA	2	6	1840006	1840011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_013522	TGG	2	6	1840053	1840058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_013522	GTCTTC	2	12	1840077	1840088	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3165	NC_013522	CATA	2	8	1841396	1841403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3166	NC_013522	GGAT	2	8	1841449	1841456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_013522	AAT	2	6	1841498	1841503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_013522	GAGG	2	8	1841531	1841538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3169	NC_013522	G	6	6	1842292	1842297	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3170	NC_013522	CAT	2	6	1842442	1842447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3171	NC_013522	AG	3	6	1842475	1842480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_013522	TA	3	6	1842496	1842501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_013522	GGA	2	6	1842526	1842531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3174	NC_013522	G	6	6	1843779	1843784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3175	NC_013522	C	6	6	1843802	1843807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3176	NC_013522	CCG	2	6	1843825	1843830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3177	NC_013522	C	6	6	1845024	1845029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3178	NC_013522	ACA	2	6	1845061	1845066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3179	NC_013522	C	7	7	1846070	1846076	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3180	NC_013522	A	7	7	1846095	1846101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3181	NC_013522	CCTT	2	8	1848220	1848227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3182	NC_013522	CCA	2	6	1848290	1848295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3183	NC_013522	CCA	2	6	1848303	1848308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3184	NC_013522	CCT	2	6	1848332	1848337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3185	NC_013522	GGA	2	6	1848419	1848424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3186	NC_013522	CAT	2	6	1848443	1848448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.