MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 3186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013522	GGATG	2	10	592661	592670	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013522	CGG	2	6	592781	592786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_013522	A	7	7	592803	592809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013522	G	9	9	592854	592862	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013522	CGG	2	6	592888	592893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013522	CCT	2	6	592966	592971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_013522	GGC	2	6	593046	593051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_013522	CCG	2	6	593104	593109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_013522	CGGTA	2	10	595269	595278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_013522	TA	3	6	595298	595303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013522	TC	3	6	596797	596802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_013522	C	6	6	596811	596816	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1013	NC_013522	G	6	6	596850	596855	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013522	TCTTG	2	10	596901	596910	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_013522	TAA	2	6	597834	597839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013522	CAT	2	6	597847	597852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_013522	TTG	2	6	597867	597872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013522	G	6	6	597949	597954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013522	GGT	2	6	598997	599002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013522	GGGC	2	8	600153	600160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_013522	GATC	2	8	604674	604681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_013522	C	6	6	606182	606187	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1023	NC_013522	GGA	2	6	606204	606209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013522	C	7	7	606219	606225	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1025	NC_013522	CATGAC	2	12	606233	606244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_013522	G	7	7	606246	606252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013522	CTC	2	6	607229	607234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_013522	G	7	7	607271	607277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013522	CGG	2	6	607292	607297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_013522	TCA	2	6	607313	607318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_013522	TGA	3	9	607320	607328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013522	GTG	2	6	607329	607334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013522	C	6	6	607464	607469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1034	NC_013522	CAGCC	2	10	607493	607502	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1035	NC_013522	GTC	2	6	607539	607544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013522	GGC	2	6	607551	607556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013522	T	6	6	607565	607570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013522	GA	3	6	608461	608466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013522	GTG	2	6	608470	608475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013522	C	6	6	609210	609215	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1041	NC_013522	TGG	2	6	611003	611008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013522	ACA	2	6	612252	612257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013522	G	6	6	612687	612692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013522	GAT	2	6	612696	612701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013522	G	6	6	612724	612729	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013522	C	6	6	612737	612742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_013522	CT	3	6	616260	616265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_013522	T	6	6	616273	616278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013522	TGA	2	6	616301	616306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013522	TATT	2	8	616351	616358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013522	GT	3	6	616401	616406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_013522	CCCT	2	8	617352	617359	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1053	NC_013522	TAG	2	6	617412	617417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013522	GGC	2	6	617480	617485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_013522	GC	3	6	617484	617489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_013522	GTC	2	6	617490	617495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013522	AGGG	2	8	617511	617518	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013522	C	6	6	617833	617838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1059	NC_013522	TCA	2	6	618212	618217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_013522	TA	3	6	618246	618251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013522	TGGC	2	8	618252	618259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_013522	TG	3	6	618421	618426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013522	TG	3	6	618437	618442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013522	TAT	2	6	618452	618457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013522	G	6	6	618474	618479	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013522	GGGA	2	8	622285	622292	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013522	AATTA	2	10	623246	623255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013522	TCA	2	6	623286	623291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_013522	G	6	6	623295	623300	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013522	C	6	6	630309	630314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1071	NC_013522	CCG	2	6	630322	630327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_013522	T	6	6	630424	630429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013522	G	6	6	630496	630501	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013522	T	6	6	630532	630537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013522	C	6	6	631020	631025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1076	NC_013522	AGG	2	6	632414	632419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013522	CTC	2	6	633889	633894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_013522	CCT	2	6	634599	634604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_013522	C	6	6	634624	634629	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1080	NC_013522	ATC	2	6	634680	634685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_013522	GGGA	2	8	634699	634706	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013522	CCTT	3	12	639778	639789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_013522	GCG	2	6	639795	639800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013522	A	6	6	639810	639815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013522	GAG	3	9	639952	639960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013522	G	6	6	642012	642017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013522	T	6	6	642030	642035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013522	TGA	2	6	642081	642086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013522	G	6	6	642096	642101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_013522	GCC	2	6	642474	642479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_013522	CGCA	2	8	642502	642509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_013522	GT	3	6	642972	642977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013522	ATAGAG	2	12	644292	644303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013522	GGATC	2	10	646478	646487	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_013522	C	6	6	646687	646692	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1096	NC_013522	T	6	6	646693	646698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_013522	TAAAT	2	10	646705	646714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013522	GGC	2	6	647184	647189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_013522	CT	3	6	648885	648890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_013522	CGG	2	6	648894	648899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013522	GAG	3	9	648915	648923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013522	CGGTT	2	10	651587	651596	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_013522	AGG	2	6	651621	651626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013522	ATC	2	6	651629	651634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013522	CGGGG	2	10	652483	652492	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1106	NC_013522	CCCCG	2	10	652499	652508	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1107	NC_013522	CGG	2	6	654323	654328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_013522	G	6	6	654352	654357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013522	T	8	8	654361	654368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013522	GTG	3	9	654415	654423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013522	TA	3	6	656074	656079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013522	G	6	6	657918	657923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013522	GGA	2	6	659130	659135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013522	CTTCG	2	10	662070	662079	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1115	NC_013522	G	6	6	665135	665140	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013522	CGGG	2	8	665817	665824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_013522	CCT	2	6	665928	665933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_013522	C	6	6	665937	665942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1119	NC_013522	AT	3	6	665995	666000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013522	AGT	2	6	666001	666006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013522	CAA	3	9	669334	669342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_013522	TC	3	6	669381	669386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_013522	TAT	2	6	669400	669405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013522	TCG	2	6	669426	669431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_013522	TCG	2	6	674094	674099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013522	A	7	7	674173	674179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013522	T	6	6	676049	676054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013522	GGGGA	2	10	676073	676082	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013522	CGC	2	6	677633	677638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_013522	GGCC	2	8	677651	677658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_013522	TGG	2	6	677707	677712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013522	AGG	2	6	677716	677721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013522	GGT	2	6	680375	680380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013522	G	6	6	684795	684800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_013522	ATGT	2	8	686808	686815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013522	CGG	2	6	686830	686835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_013522	GAG	2	6	686854	686859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_013522	TTC	2	6	687660	687665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1140	NC_013522	G	6	6	687960	687965	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1280	NC_013522	TCTG	2	8	771485	771492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1415	NC_013522	GGC	2	6	874535	874540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_013522	GATC	2	8	874588	874595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1417	NC_013522	CGG	2	6	874599	874604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_013522	CGC	2	6	874636	874641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1419	NC_013522	GCG	2	6	874675	874680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_013522	C	6	6	876590	876595	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1422	NC_013522	CCT	2	6	877700	877705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1429	NC_013522	TAT	2	6	879197	879202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_013522	GCG	2	6	879226	879231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_013522	GAT	2	6	879341	879346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_013522	CCA	2	6	879883	879888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1439	NC_013522	GTG	2	6	879912	879917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_013522	CCA	2	6	880089	880094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1447	NC_013522	ACT	2	6	880746	880751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_013522	TCG	2	6	881020	881025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_013522	CCA	2	6	881146	881151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1452	NC_013522	C	6	6	881161	881166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1453	NC_013522	G	6	6	881174	881179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1455	NC_013522	GTG	2	6	881216	881221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_013522	CGT	2	6	890865	890870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1461	NC_013522	T	6	6	890964	890969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1480	NC_013522	GA	3	6	931209	931214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1481	NC_013522	AT	3	6	934383	934388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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