MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 3186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013522	CGG	2	6	278969	278974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_013522	C	6	6	279005	279010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
503	NC_013522	CGA	2	6	279023	279028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013522	CAG	2	6	279049	279054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013522	C	6	6	279060	279065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
506	NC_013522	G	6	6	279078	279083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013522	CCA	2	6	279156	279161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_013522	TGG	2	6	279177	279182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013522	CGC	2	6	279192	279197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_013522	CGT	2	6	279306	279311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013522	AGG	2	6	279317	279322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013522	GGTCCA	2	12	279342	279353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_013522	AGG	2	6	279356	279361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013522	AGGGG	2	10	279368	279377	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013522	CTC	2	6	279394	279399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_013522	CCGG	2	8	279420	279427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_013522	GTG	2	6	279523	279528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013522	CAC	2	6	279565	279570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_013522	C	7	7	279570	279576	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
520	NC_013522	CCTCCC	2	12	279597	279608	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
521	NC_013522	GGA	2	6	279663	279668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013522	C	6	6	279696	279701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
523	NC_013522	TGG	2	6	279702	279707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013522	GGT	2	6	279730	279735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013522	CCT	2	6	279786	279791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_013522	CAC	2	6	279868	279873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_013522	CGA	2	6	279907	279912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_013522	GAG	2	6	279979	279984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013522	CTC	2	6	279993	279998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_013522	TCC	2	6	280028	280033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_013522	ACC	2	6	280040	280045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_013522	TGG	3	9	280119	280127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013522	TGGG	2	8	280133	280140	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013522	ATC	2	6	280185	280190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013522	TCA	2	6	280195	280200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013522	A	6	6	280257	280262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013522	CTT	2	6	281210	281215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013522	CGGC	2	8	281257	281264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_013522	GAT	2	6	281294	281299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013522	C	6	6	283361	283366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
541	NC_013522	CCTT	2	8	283385	283392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_013522	GGA	2	6	283405	283410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013522	GGA	2	6	283456	283461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013522	T	6	6	283462	283467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013522	C	8	8	287093	287100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
546	NC_013522	GAA	2	6	287145	287150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013522	CGG	2	6	287165	287170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013522	C	7	7	287177	287183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
549	NC_013522	C	6	6	290339	290344	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
550	NC_013522	CTC	2	6	291331	291336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_013522	ATATG	2	10	291390	291399	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013522	TAT	2	6	291468	291473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013522	ACG	2	6	291516	291521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_013522	TCA	2	6	292540	292545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013522	CCG	2	6	292575	292580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_013522	TCG	2	6	292616	292621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013522	GGA	2	6	296437	296442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013522	CGC	2	6	297028	297033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_013522	CCTTC	2	10	297067	297076	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
560	NC_013522	T	8	8	297168	297175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013522	GCC	2	6	297213	297218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_013522	CCT	2	6	298570	298575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_013522	CCT	2	6	305285	305290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_013522	GCG	2	6	305333	305338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_013522	CAT	2	6	305358	305363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_013522	CTCAAA	2	12	305364	305375	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013522	GAGG	2	8	305385	305392	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013522	GGT	2	6	308893	308898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013522	CGG	2	6	308903	308908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013522	CT	3	6	310119	310124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_013522	GAG	2	6	310179	310184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013522	TAT	2	6	310614	310619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013522	CTC	2	6	310632	310637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_013522	GTT	2	6	310672	310677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013522	A	6	6	310691	310696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013522	AAT	2	6	310731	310736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013522	AGG	3	9	310805	310813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013522	AGGG	2	8	312505	312512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013522	CCG	2	6	313349	313354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_013522	CCG	2	6	313375	313380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_013522	AGG	2	6	313398	313403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013522	GA	3	6	315381	315386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013522	A	6	6	315402	315407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013522	AGG	2	6	315412	315417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013522	GAGG	2	8	316997	317004	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013522	CCTCCC	2	12	317016	317027	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
587	NC_013522	CCG	2	6	317115	317120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_013522	C	6	6	321352	321357	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
589	NC_013522	TG	3	6	321360	321365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013522	GGC	2	6	321379	321384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013522	GAG	2	6	321455	321460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013522	TCT	2	6	321465	321470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013522	ATC	2	6	321491	321496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_013522	GGTCAA	2	12	321530	321541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
595	NC_013522	GTG	2	6	321557	321562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013522	GTA	2	6	321982	321987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013522	T	6	6	321988	321993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013522	CA	3	6	322034	322039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_013522	CCACC	2	10	322066	322075	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
600	NC_013522	CGT	2	6	322152	322157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013522	GAG	2	6	322201	322206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013522	GGC	2	6	323380	323385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_013522	GA	3	6	324923	324928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013522	TGC	2	6	324984	324989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013522	GGAG	3	12	325002	325013	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013522	CCCT	2	8	325017	325024	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
607	NC_013522	AAAC	2	8	326755	326762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_013522	TG	3	6	326788	326793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013522	ATA	2	6	326794	326799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013522	G	6	6	326828	326833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013522	GAG	2	6	326852	326857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013522	GCCCCT	2	12	327625	327636	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_013522	C	6	6	329005	329010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
614	NC_013522	GAG	2	6	329075	329080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013522	GCC	2	6	329584	329589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_013522	C	6	6	329616	329621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
617	NC_013522	T	6	6	329630	329635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013522	AT	3	6	329642	329647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013522	G	6	6	331750	331755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013522	C	6	6	331766	331771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
621	NC_013522	GGC	2	6	331781	331786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013522	TGAT	2	8	333679	333686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013522	TCT	2	6	333768	333773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013522	GTT	2	6	333775	333780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013522	C	6	6	333814	333819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
626	NC_013522	CTC	2	6	337949	337954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013522	GAT	2	6	338020	338025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013522	GCT	2	6	339214	339219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013522	GCC	2	6	339229	339234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_013522	ATA	2	6	339276	339281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013522	AT	3	6	341266	341271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013522	A	6	6	341283	341288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013522	GAATA	2	10	341326	341335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013522	GGTT	2	8	341373	341380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013522	AGG	2	6	341410	341415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013522	CAC	2	6	342708	342713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_013522	TTG	2	6	344732	344737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013522	GGGA	2	8	344750	344757	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013522	TCA	2	6	346048	346053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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778	NC_013522	TCG	2	6	417435	417440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_013522	TCC	2	6	417468	417473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
780	NC_013522	GGC	2	6	417476	417481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_013522	CGG	2	6	417555	417560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
782	NC_013522	CCG	2	6	417573	417578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
783	NC_013522	CGG	2	6	417600	417605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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