MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermomonospora curvata DSM 43183 chromosome

Total Repeats: 22623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_013510	GCA	2	6	5620398	5620403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22502	NC_013510	CGC	2	6	5620429	5620434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22503	NC_013510	T	6	6	5620440	5620445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22504	NC_013510	GGC	2	6	5621957	5621962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22505	NC_013510	GCG	2	6	5621990	5621995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22506	NC_013510	TC	3	6	5622789	5622794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22507	NC_013510	AG	3	6	5622801	5622806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22508	NC_013510	CG	3	6	5623021	5623026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22509	NC_013510	GCC	2	6	5623050	5623055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22510	NC_013510	CTC	2	6	5623128	5623133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22511	NC_013510	TG	4	8	5623149	5623156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22512	NC_013510	CCG	2	6	5623181	5623186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22513	NC_013510	GT	3	6	5623204	5623209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22514	NC_013510	CGC	2	6	5623234	5623239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22515	NC_013510	CGGC	2	8	5623255	5623262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22516	NC_013510	TCA	2	6	5623299	5623304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22517	NC_013510	GAT	2	6	5623315	5623320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22518	NC_013510	CA	3	6	5623339	5623344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22519	NC_013510	GAT	2	6	5623356	5623361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22520	NC_013510	CG	3	6	5623375	5623380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22521	NC_013510	G	6	6	5623380	5623385	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22522	NC_013510	CCG	2	6	5623431	5623436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22523	NC_013510	CCG	2	6	5624776	5624781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22524	NC_013510	GC	3	6	5624795	5624800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22525	NC_013510	GGC	2	6	5624803	5624808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22526	NC_013510	CCGG	2	8	5624810	5624817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22527	NC_013510	CCT	2	6	5624827	5624832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22528	NC_013510	CGGA	2	8	5624846	5624853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22529	NC_013510	GCG	2	6	5624854	5624859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22530	NC_013510	GCC	2	6	5624872	5624877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22531	NC_013510	AGC	2	6	5626200	5626205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22532	NC_013510	CCG	2	6	5626216	5626221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22533	NC_013510	CGCC	2	8	5626232	5626239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22534	NC_013510	GA	3	6	5626240	5626245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22535	NC_013510	CGG	2	6	5626266	5626271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22536	NC_013510	CCG	2	6	5626287	5626292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22537	NC_013510	GA	3	6	5626334	5626339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22538	NC_013510	CGG	2	6	5626360	5626365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22539	NC_013510	GCC	2	6	5626380	5626385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22540	NC_013510	GA	3	6	5626428	5626433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22541	NC_013510	CCCA	2	8	5626438	5626445	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22542	NC_013510	CG	3	6	5626475	5626480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22543	NC_013510	CGG	2	6	5626506	5626511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22544	NC_013510	CTC	2	6	5626516	5626521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22545	NC_013510	GAG	2	6	5626536	5626541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22546	NC_013510	CGG	2	6	5626549	5626554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22547	NC_013510	ACC	2	6	5628261	5628266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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22549	NC_013510	CGCC	2	8	5629013	5629020	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22550	NC_013510	GCGG	2	8	5629022	5629029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22551	NC_013510	GGCG	2	8	5629044	5629051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22552	NC_013510	CCGG	2	8	5629085	5629092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22553	NC_013510	CCG	2	6	5629110	5629115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22554	NC_013510	ACCGGC	2	12	5629154	5629165	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22555	NC_013510	GGC	2	6	5629187	5629192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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22557	NC_013510	GGC	2	6	5629212	5629217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22558	NC_013510	CGC	2	6	5629222	5629227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22559	NC_013510	CTT	2	6	5629234	5629239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22561	NC_013510	AGG	2	6	5630621	5630626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22562	NC_013510	GCG	2	6	5630629	5630634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22563	NC_013510	GCC	2	6	5631631	5631636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22564	NC_013510	CGG	2	6	5631660	5631665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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22578	NC_013510	TCC	2	6	5632090	5632095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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22585	NC_013510	C	6	6	5634271	5634276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22586	NC_013510	GGCG	2	8	5634280	5634287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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22592	NC_013510	TGC	2	6	5634626	5634631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22593	NC_013510	GGCC	2	8	5634650	5634657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22594	NC_013510	TGA	2	6	5635370	5635375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22596	NC_013510	C	6	6	5635395	5635400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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22599	NC_013510	GTC	2	6	5635506	5635511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22600	NC_013510	CGCC	2	8	5635602	5635609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22601	NC_013510	GCG	2	6	5635748	5635753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22602	NC_013510	GCCG	2	8	5635770	5635777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22603	NC_013510	GTAC	2	8	5635778	5635785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22604	NC_013510	GATC	2	8	5635797	5635804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22605	NC_013510	A	6	6	5635811	5635816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22606	NC_013510	TCG	2	6	5636390	5636395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22608	NC_013510	GTG	2	6	5638201	5638206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22609	NC_013510	TGC	2	6	5638371	5638376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22611	NC_013510	CTCGC	2	10	5638489	5638498	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22612	NC_013510	GCG	2	6	5638622	5638627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22613	NC_013510	GCC	2	6	5638663	5638668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22614	NC_013510	GCC	2	6	5638689	5638694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22615	NC_013510	GCC	3	9	5638719	5638727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22616	NC_013510	TG	3	6	5638735	5638740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22617	NC_013510	GCCCC	2	10	5638745	5638754	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22618	NC_013510	CGT	2	6	5638793	5638798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22620	NC_013510	CGT	2	6	5638831	5638836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22621	NC_013510	GGA	2	6	5638879	5638884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22622	NC_013510	CGG	2	6	5638934	5638939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22623	NC_013510	GA	3	6	5639002	5639007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.