MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 2744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012804	TGG	3	9	703426	703434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012804	GTC	2	6	704231	704236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_012804	GTT	2	6	704237	704242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012804	GGA	2	6	704268	704273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012804	TAAA	2	8	704327	704334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012804	AGT	2	6	707750	707755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012804	ACT	2	6	707764	707769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012804	ACC	2	6	708289	708294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_012804	A	6	6	708320	708325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012804	AAG	2	6	712421	712426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012804	AAC	2	6	713132	713137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_012804	AACT	2	8	713187	713194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_012804	CT	3	6	713224	713229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_012804	T	6	6	713264	713269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012804	TTA	2	6	713309	713314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012804	AG	3	6	713345	713350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_012804	TCTT	2	8	714595	714602	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_012804	T	6	6	714601	714606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012804	GGT	2	6	714665	714670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012804	A	6	6	719823	719828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012804	CT	3	6	723588	723593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_012804	TCA	2	6	723617	723622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012804	ACT	2	6	723631	723636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_012804	CAA	2	6	731758	731763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_012804	AATA	2	8	735796	735803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012804	GA	3	6	735828	735833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012804	TTCTC	2	10	736851	736860	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1028	NC_012804	TGT	2	6	737954	737959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012804	TGG	2	6	740983	740988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012804	GAA	2	6	741680	741685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012804	CTT	2	6	741686	741691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_012804	TTC	2	6	741699	741704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_012804	GAG	2	6	741747	741752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012804	GGT	2	6	741768	741773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012804	GAA	2	6	741785	741790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012804	GGTT	2	8	742042	742049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012804	TA	3	6	742057	742062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012804	GGT	2	6	744837	744842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012804	GGA	2	6	751387	751392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012804	G	6	6	751400	751405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_012804	TCC	2	6	751466	751471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_012804	AGT	2	6	751485	751490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_012804	AGT	2	6	751497	751502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012804	G	6	6	751555	751560	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012804	AC	3	6	751570	751575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_012804	GTA	2	6	751738	751743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012804	TGG	2	6	751755	751760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012804	GAT	2	6	751810	751815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012804	AGG	2	6	751817	751822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_012804	CGG	2	6	751830	751835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_012804	ACC	2	6	751856	751861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_012804	T	6	6	751908	751913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012804	GAA	2	6	752295	752300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012804	ATT	2	6	752318	752323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012804	ATCA	2	8	752342	752349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_012804	TCA	2	6	752393	752398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_012804	TTA	2	6	752423	752428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012804	CTTTTT	2	12	756364	756375	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1059	NC_012804	AG	3	6	756418	756423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012804	AAAG	2	8	756430	756437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012804	ACC	2	6	757508	757513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_012804	ACTCC	2	10	759369	759378	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1063	NC_012804	T	6	6	759392	759397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012804	CCA	2	6	760930	760935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_012804	T	6	6	762821	762826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012804	T	6	6	769756	769761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012804	TAA	2	6	771214	771219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012804	TCAG	2	8	775358	775365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_012804	TTTA	2	8	775435	775442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012804	TA	3	6	775458	775463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012804	GA	3	6	778096	778101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012804	T	6	6	780158	780163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012804	CGG	2	6	780168	780173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_012804	ATCTTT	2	12	780670	780681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1075	NC_012804	TCC	2	6	780773	780778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_012804	TCTT	2	8	781392	781399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_012804	ATC	2	6	781406	781411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_012804	ATA	2	6	782412	782417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_012804	TGG	2	6	782440	782445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012804	AGT	2	6	784732	784737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012804	TAGT	2	8	784740	784747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012804	AAGG	2	8	784851	784858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012804	A	6	6	785154	785159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012804	TTA	2	6	785211	785216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012804	TCT	2	6	789685	789690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_012804	TAAAGA	2	12	789770	789781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012804	TAA	2	6	789784	789789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012804	GTT	2	6	790160	790165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012804	A	7	7	790194	790200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012804	T	7	7	790642	790648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012804	ATT	2	6	793440	793445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012804	CT	3	6	793464	793469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_012804	GAAA	2	8	794661	794668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012804	A	7	7	794757	794763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012804	TGT	2	6	796670	796675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012804	ATT	2	6	796683	796688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012804	T	6	6	796693	796698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012804	A	6	6	796719	796724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012804	CCAA	2	8	800009	800016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_012804	A	6	6	800015	800020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012804	GAA	2	6	800687	800692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012804	TCA	2	6	800916	800921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_012804	ATTC	2	8	801017	801024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_012804	TAGCC	2	10	801217	801226	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1105	NC_012804	CCGC	2	8	801261	801268	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1106	NC_012804	A	6	6	801362	801367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012804	GT	3	6	801410	801415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012804	CTT	2	6	801487	801492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_012804	TGT	2	6	801537	801542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012804	ACAA	2	8	801556	801563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_012804	AAGAG	2	10	801564	801573	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012804	AGG	2	6	802485	802490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012804	CCCT	2	8	802535	802542	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1114	NC_012804	GAA	2	6	805912	805917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012804	AG	3	6	805918	805923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012804	CCT	2	6	806988	806993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_012804	TAA	2	6	807026	807031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012804	GAAT	2	8	807053	807060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012804	GA	3	6	807072	807077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012804	AAG	3	9	809388	809396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012804	ACC	2	6	809864	809869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_012804	GCC	2	6	809895	809900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_012804	AAG	2	6	810383	810388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012804	G	6	6	811831	811836	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012804	CGG	2	6	814400	814405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_012804	CAC	2	6	818126	818131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_012804	CT	3	6	819145	819150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_012804	TGT	2	6	819157	819162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012804	GAAA	2	8	819184	819191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012804	TAA	2	6	821397	821402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012804	CAC	2	6	822162	822167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_012804	CTC	2	6	823803	823808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_012804	CCT	2	6	824510	824515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_012804	GATA	2	8	824533	824540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012804	ATA	2	6	824576	824581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_012804	T	6	6	824611	824616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_012804	TC	3	6	824672	824677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1407	NC_012804	TCC	2	6	1095513	1095518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1408	NC_012804	TCA	3	9	1095570	1095578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_012804	TC	3	6	1095623	1095628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1410	NC_012804	CGA	2	6	1095660	1095665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_012804	TTA	2	6	1095671	1095676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_012804	ATT	2	6	1097445	1097450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_012804	GC	3	6	1097471	1097476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1414	NC_012804	CAC	2	6	1098245	1098250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1415	NC_012804	TCA	2	6	1101151	1101156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_012804	AAATGC	2	12	1101643	1101654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1417	NC_012804	GCCAA	2	10	1103043	1103052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1418	NC_012804	TTA	2	6	1107513	1107518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_012804	CGG	2	6	1110144	1110149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1420	NC_012804	GAT	2	6	1115806	1115811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_012804	AT	3	6	1115810	1115815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_012804	TTC	2	6	1115834	1115839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1423	NC_012804	AGT	2	6	1115883	1115888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_012804	AAG	2	6	1115897	1115902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_012804	GAAA	2	8	1115909	1115916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_012804	CTG	2	6	1117644	1117649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1427	NC_012804	TC	3	6	1117665	1117670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1428	NC_012804	GAC	2	6	1117694	1117699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1429	NC_012804	CTG	2	6	1117720	1117725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_012804	AAT	2	6	1117747	1117752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_012804	CTT	3	9	1117781	1117789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_012804	TAAAA	2	10	1117790	1117799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_012804	ATC	2	6	1118839	1118844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1434	NC_012804	CTC	2	6	1119501	1119506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1435	NC_012804	A	7	7	1126885	1126891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_012804	TAT	2	6	1126895	1126900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_012804	CCA	2	6	1127521	1127526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1438	NC_012804	ATC	2	6	1128689	1128694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1439	NC_012804	CGGC	2	8	1128725	1128732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1440	NC_012804	TCA	2	6	1128760	1128765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_012804	TCA	2	6	1128785	1128790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_012804	TGGG	2	8	1130995	1131002	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_012804	TTA	2	6	1131006	1131011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_012804	GAG	2	6	1132017	1132022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_012804	CCG	2	6	1132693	1132698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1447	NC_012804	TCA	2	6	1134698	1134703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1448	NC_012804	AGGG	2	8	1134710	1134717	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_012804	GTC	2	6	1134723	1134728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_012804	T	6	6	1135308	1135313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_012804	CGTC	2	8	1135316	1135323	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1453	NC_012804	AG	3	6	1135343	1135348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_012804	ATC	2	6	1138705	1138710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1457	NC_012804	TAA	2	6	1142517	1142522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_012804	GAA	2	6	1144571	1144576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_012804	ATGG	2	8	1144587	1144594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1466	NC_012804	AAAG	2	8	1147971	1147978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1467	NC_012804	ACC	2	6	1148776	1148781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1469	NC_012804	GCCG	2	8	1150198	1150205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1470	NC_012804	CTG	2	6	1150234	1150239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1472	NC_012804	CTTT	2	8	1151353	1151360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1473	NC_012804	CTTTTT	2	12	1151701	1151712	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1474	NC_012804	CA	3	6	1151721	1151726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1480	NC_012804	CGG	2	6	1153215	1153220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1481	NC_012804	CAC	2	6	1153240	1153245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1482	NC_012804	TAG	2	6	1154810	1154815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1484	NC_012804	GA	3	6	1154866	1154871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1485	NC_012804	TC	3	6	1160391	1160396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1491	NC_012804	CA	3	6	1163071	1163076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1492	NC_012804	AAAG	2	8	1163093	1163100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1493	NC_012804	ACC	2	6	1163308	1163313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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