MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 1879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011978	A	6	6	7	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011978	TTTG	2	8	63	70	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011978	TAA	2	6	71	76	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011978	GAG	2	6	104	109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011978	GT	3	6	113	118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011978	ATA	2	6	119	124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011978	CGG	2	6	2039	2044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011978	GAAC	2	8	2078	2085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011978	TTC	2	6	3433	3438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011978	CTC	2	6	7519	7524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011978	AC	3	6	8420	8425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011978	AGGG	2	8	8427	8434	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011978	GGC	2	6	10368	10373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011978	GCC	2	6	10377	10382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011978	CCT	2	6	13848	13853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011978	CTC	3	9	18053	18061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011978	CAGA	2	8	18105	18112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011978	CTTAA	2	10	18167	18176	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011978	TA	3	6	18213	18218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011978	AGGG	2	8	18693	18700	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011978	GAA	2	6	18951	18956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011978	GAA	2	6	18967	18972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011978	CTT	2	6	19032	19037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011978	AAG	2	6	19039	19044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011978	A	6	6	19123	19128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011978	CCA	2	6	19160	19165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011978	CTTT	2	8	19315	19322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011978	TTAA	2	8	19751	19758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011978	GAA	2	6	21805	21810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011978	AGG	2	6	21818	21823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011978	ATA	2	6	22108	22113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011978	AGG	2	6	22153	22158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011978	ATG	2	6	22166	22171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011978	T	7	7	22195	22201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011978	GTTC	2	8	22288	22295	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011978	AAG	2	6	22302	22307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011978	A	7	7	22376	22382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011978	CTTA	2	8	22405	22412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011978	CTT	2	6	22429	22434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011978	A	6	6	22446	22451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011978	GAG	2	6	22481	22486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011978	ATT	2	6	22509	22514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011978	A	10	10	22552	22561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011978	TTG	2	6	22571	22576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011978	AATA	2	8	23396	23403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011978	AAAG	2	8	31692	31699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011978	T	7	7	31705	31711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011978	AG	3	6	31738	31743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011978	GAA	2	6	31765	31770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011978	CAA	2	6	34388	34393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011978	AT	3	6	34418	34423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011978	ACC	2	6	34506	34511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011978	GA	3	6	34587	34592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011978	GAA	2	6	34594	34599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011978	TCTT	2	8	34666	34673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011978	TGT	2	6	34681	34686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011978	AT	3	6	34716	34721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011978	TAG	2	6	34752	34757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011978	TCT	2	6	34866	34871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011978	TTG	2	6	35029	35034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011978	CGT	2	6	35041	35046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011978	GA	3	6	36581	36586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011978	GTA	2	6	36775	36780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011978	AAACA	2	10	36787	36796	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011978	ATA	2	6	36801	36806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011978	TGTC	2	8	37999	38006	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011978	TTC	2	6	38279	38284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011978	TGA	2	6	38307	38312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011978	CTG	2	6	38611	38616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011978	TGT	2	6	38619	38624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011978	GAA	2	6	38625	38630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011978	AAGT	2	8	38631	38638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011978	ATT	2	6	38654	38659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011978	TGTT	2	8	38888	38895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011978	TTTTAC	2	12	38939	38950	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011978	TAAAA	2	10	38957	38966	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011978	TTAA	2	8	38974	38981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011978	TGT	2	6	38991	38996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011978	TTC	2	6	39043	39048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011978	GAAG	2	8	39082	39089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011978	TGG	2	6	39090	39095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011978	CGG	2	6	39102	39107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011978	CAG	2	6	39652	39657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011978	ACC	2	6	39675	39680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011978	AGCA	2	8	39709	39716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011978	TAT	2	6	39765	39770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011978	GTTT	2	8	39807	39814	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011978	GTA	2	6	39833	39838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011978	TCA	2	6	41638	41643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011978	AT	3	6	41655	41660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011978	GTT	2	6	41689	41694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011978	GAT	2	6	41719	41724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011978	AGC	2	6	41751	41756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011978	ATTC	2	8	41786	41793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011978	CAA	2	6	41799	41804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011978	ATA	2	6	44223	44228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011978	CCT	2	6	46974	46979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011978	GTA	2	6	47036	47041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011978	CCTC	2	8	48500	48507	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_011978	ACC	2	6	54514	54519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011978	TTC	2	6	55807	55812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011978	AGG	2	6	55866	55871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011978	TCC	2	6	57151	57156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011978	CTTTT	2	10	57159	57168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011978	TAA	2	6	58596	58601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011978	GGA	2	6	59359	59364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011978	CTT	2	6	64337	64342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011978	CAA	2	6	64351	64356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011978	TTC	2	6	74899	74904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011978	CCTC	2	8	75012	75019	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_011978	CAG	2	6	75035	75040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011978	AGG	2	6	75361	75366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011978	AAGG	2	8	75397	75404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011978	AAGG	2	8	75467	75474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011978	TCA	2	6	75557	75562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011978	AC	3	6	75575	75580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011978	AAT	2	6	75616	75621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011978	AAAG	2	8	75643	75650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011978	GT	3	6	75778	75783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011978	GATA	2	8	75799	75806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011978	ATT	2	6	75858	75863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011978	CT	3	6	75886	75891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011978	T	6	6	75906	75911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011978	CA	3	6	75939	75944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011978	CAC	2	6	75963	75968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011978	TCT	2	6	76040	76045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011978	AAC	2	6	76046	76051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011978	A	7	7	84514	84520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011978	A	8	8	85699	85706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011978	ACC	2	6	85728	85733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_011978	CCT	2	6	87160	87165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_011978	AC	3	6	87190	87195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011978	A	6	6	87214	87219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011978	G	6	6	94691	94696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011978	ACA	2	6	95232	95237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011978	CTT	2	6	95238	95243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011978	ACT	2	6	95260	95265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011978	CAT	3	9	95268	95276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011978	TG	3	6	97523	97528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011978	AGT	2	6	97718	97723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011978	AGG	2	6	97824	97829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011978	ACC	2	6	108300	108305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_011978	G	6	6	113290	113295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011978	T	6	6	113296	113301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011978	ATC	2	6	113311	113316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011978	T	6	6	113350	113355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011978	TCA	2	6	113372	113377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011978	ATCG	2	8	113412	113419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011978	CTG	2	6	113439	113444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_011978	GGA	2	6	123636	123641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011978	TTC	2	6	128032	128037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011978	AAG	2	6	128056	128061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011978	AAG	2	6	128066	128071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011978	TTC	2	6	128072	128077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_011978	AAG	2	6	128172	128177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_011978	TCA	2	6	131962	131967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_011978	CCT	2	6	133759	133764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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169	NC_011978	TTC	3	9	139513	139521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_011978	GGA	2	6	154623	154628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_011978	TCCC	2	8	263345	263352	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
284	NC_011978	TAA	2	6	263378	263383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_011978	TGG	2	6	263439	263444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_011978	TCC	2	6	263454	263459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_011978	CAGC	2	8	263465	263472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
290	NC_011978	TTTTTA	2	12	263518	263529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_011978	TCC	2	6	271169	271174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_011978	TTAT	2	8	271175	271182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_011978	TCAT	2	8	295345	295352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
332	NC_011978	GATA	2	8	295404	295411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_011978	G	6	6	354673	354678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
410	NC_011978	AG	3	6	354679	354684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
411	NC_011978	GGC	2	6	360101	360106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_011978	CGA	2	6	360113	360118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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414	NC_011978	TCG	2	6	360271	360276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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416	NC_011978	CTT	2	6	366426	366431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_011978	TAT	2	6	370180	370185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_011978	AC	3	6	371108	371113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
420	NC_011978	ATGA	2	8	371122	371129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
421	NC_011978	T	7	7	371148	371154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_011978	ACC	2	6	371185	371190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_011978	AAAC	2	8	371204	371211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
424	NC_011978	TCA	2	6	371314	371319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_011978	TCA	2	6	376462	376467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_011978	AC	3	6	380560	380565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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