MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 2671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011961	CCACGC	2	12	862854	862865	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_011961	AGG	2	6	862873	862878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_011961	ACCGC	2	10	862934	862943	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2504	NC_011961	TCC	2	6	862987	862992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_011961	TCGA	2	8	865326	865333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2506	NC_011961	GGT	2	6	865337	865342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_011961	CAG	2	6	865359	865364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_011961	AGT	2	6	865404	865409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011961	CG	3	6	865464	865469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_011961	CA	3	6	866831	866836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2511	NC_011961	CCCT	2	8	866859	866866	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2512	NC_011961	CG	3	6	866887	866892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2513	NC_011961	ATC	2	6	867021	867026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_011961	GGCA	2	8	867067	867074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_011961	GCA	2	6	867125	867130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_011961	CAC	2	6	867150	867155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2517	NC_011961	GCA	2	6	867184	867189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_011961	CT	3	6	867267	867272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2519	NC_011961	GCAGG	2	10	867306	867315	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2520	NC_011961	GCT	2	6	867329	867334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_011961	TGG	2	6	867692	867697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_011961	ACGC	2	8	867715	867722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_011961	GCAG	2	8	867728	867735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_011961	CAT	2	6	868186	868191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_011961	C	6	6	868327	868332	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2526	NC_011961	GCT	2	6	868375	868380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_011961	GTC	2	6	868428	868433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_011961	GC	3	6	868496	868501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_011961	TC	3	6	868662	868667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_011961	ACC	2	6	872086	872091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_011961	CAG	2	6	872824	872829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_011961	CACT	2	8	872862	872869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_011961	TCC	2	6	874478	874483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_011961	CAG	2	6	874549	874554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_011961	CAG	2	6	874620	874625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_011961	CTCTC	2	10	874665	874674	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2537	NC_011961	AC	3	6	874685	874690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_011961	CTC	2	6	874705	874710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_011961	GC	3	6	874739	874744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_011961	CGCC	2	8	874750	874757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2541	NC_011961	TGT	2	6	874809	874814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_011961	CTG	2	6	874865	874870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_011961	GTT	2	6	874873	874878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_011961	CGTA	2	8	874893	874900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2545	NC_011961	CAG	2	6	874929	874934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_011961	CGCTG	2	10	874986	874995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2547	NC_011961	CGC	2	6	875068	875073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_011961	CTCGG	2	10	875093	875102	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2549	NC_011961	CCT	2	6	875136	875141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_011961	CGG	2	6	875181	875186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_011961	GAC	2	6	875220	875225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_011961	CCT	2	6	875325	875330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_011961	AGG	2	6	875388	875393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_011961	AGG	2	6	875874	875879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_011961	CAC	2	6	876437	876442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_011961	TGC	2	6	877708	877713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_011961	GC	3	6	877720	877725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_011961	TCG	2	6	877956	877961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_011961	TGA	2	6	878068	878073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_011961	CAG	2	6	878076	878081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_011961	AGG	2	6	878109	878114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_011961	CT	3	6	878161	878166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_011961	CTG	2	6	878201	878206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_011961	GCCC	2	8	878215	878222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2565	NC_011961	GC	3	6	878336	878341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2566	NC_011961	TCG	2	6	878349	878354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_011961	AGC	2	6	878358	878363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_011961	ATC	2	6	878379	878384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_011961	TC	3	6	878410	878415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_011961	TCC	2	6	878466	878471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2571	NC_011961	GAC	2	6	879914	879919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_011961	GTC	2	6	879925	879930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_011961	GTT	2	6	879987	879992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_011961	CGC	2	6	880040	880045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2576	NC_011961	AGC	2	6	880087	880092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2578	NC_011961	CGAG	2	8	880185	880192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2579	NC_011961	TCG	2	6	880205	880210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_011961	GTC	2	6	880243	880248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2583	NC_011961	GAC	2	6	880293	880298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2586	NC_011961	GGAG	2	8	880395	880402	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_011961	GTA	2	6	883849	883854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2591	NC_011961	CAG	2	6	884006	884011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_011961	TCC	3	9	884016	884024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2593	NC_011961	CG	3	6	884029	884034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2594	NC_011961	GCCT	2	8	885438	885445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2599	NC_011961	CGC	2	6	886211	886216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_011961	CGG	2	6	886246	886251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_011961	TGA	2	6	886272	886277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_011961	CAG	2	6	886292	886297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_011961	CAC	2	6	886340	886345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_011961	GAAG	2	8	886347	886354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_011961	GAG	2	6	886385	886390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2608	NC_011961	GA	3	6	887808	887813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_011961	TCC	2	6	889148	889153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_011961	ACA	2	6	889177	889182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_011961	GTG	2	6	889216	889221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_011961	CGC	2	6	889226	889231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2613	NC_011961	CG	4	8	889294	889301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_011961	CCCG	2	8	889666	889673	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2615	NC_011961	GCC	2	6	889717	889722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2616	NC_011961	AACC	2	8	889805	889812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2617	NC_011961	AGGAA	2	10	889897	889906	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_011961	GGA	2	6	891756	891761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_011961	ACGC	2	8	891791	891798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_011961	GGA	2	6	893289	893294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_011961	TCGG	2	8	893451	893458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2622	NC_011961	GGA	2	6	893469	893474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2626	NC_011961	GCCG	2	8	894602	894609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2627	NC_011961	CCGG	2	8	894622	894629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2628	NC_011961	GGA	3	9	896751	896759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_011961	GACG	2	8	896769	896776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2630	NC_011961	GCG	2	6	896785	896790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_011961	CTC	2	6	896837	896842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2632	NC_011961	TCC	2	6	897790	897795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2633	NC_011961	CGA	2	6	897822	897827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_011961	GAC	2	6	897896	897901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2635	NC_011961	GGA	2	6	897911	897916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_011961	TTGT	2	8	898950	898957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_011961	GCA	3	9	898961	898969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2638	NC_011961	CTT	2	6	898997	899002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2639	NC_011961	AGG	2	6	899206	899211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_011961	AGG	2	6	901397	901402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_011961	CTTC	2	8	903773	903780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2642	NC_011961	ACC	2	6	903796	903801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2643	NC_011961	GA	3	6	904268	904273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2644	NC_011961	GCC	2	6	904342	904347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2645	NC_011961	CG	3	6	904364	904369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2646	NC_011961	TGC	2	6	904455	904460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2649	NC_011961	CAT	2	6	904579	904584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2653	NC_011961	CGG	2	6	904691	904696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2654	NC_011961	GAG	2	6	904766	904771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2656	NC_011961	G	6	6	907932	907937	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2657	NC_011961	GGA	2	6	910385	910390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_011961	CAA	2	6	913219	913224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2659	NC_011961	GAG	2	6	914177	914182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2661	NC_011961	GGC	2	6	915180	915185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2662	NC_011961	GCT	2	6	917244	917249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2663	NC_011961	G	7	7	917267	917273	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_011961	GCAGC	2	10	917327	917336	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2665	NC_011961	TCGT	2	8	917531	917538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2667	NC_011961	CGGG	2	8	917569	917576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2668	NC_011961	CGA	2	6	917604	917609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2669	NC_011961	CTCG	2	8	917635	917642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2670	NC_011961	CCAG	2	8	917649	917656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2671	NC_011961	GGCA	2	8	917703	917710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.