MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 7921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011901	GCA	2	6	1827724	1827729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_011901	TGC	2	6	1827736	1827741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_011901	TTCA	2	8	1827746	1827753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_011901	GGC	2	6	1827771	1827776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_011901	TCA	2	6	1830094	1830099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_011901	GT	3	6	1830181	1830186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011901	GGC	3	9	1836429	1836437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_011901	GCC	3	9	1836444	1836452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_011901	ATC	2	6	1836870	1836875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_011901	TCAG	3	12	1836965	1836976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_011901	GTC	2	6	1836980	1836985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_011901	GAGG	2	8	1836995	1837002	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011901	GAA	2	6	1837010	1837015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011901	G	7	7	1837024	1837030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011901	TGC	2	6	1837045	1837050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_011901	GCG	2	6	1837154	1837159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_011901	GAT	2	6	1837174	1837179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011901	GT	3	6	1837213	1837218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011901	CCT	2	6	1837971	1837976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_011901	A	6	6	1838418	1838423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011901	GCC	2	6	1838425	1838430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_011901	GGC	2	6	1838437	1838442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_011901	AGG	2	6	1838463	1838468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011901	CTTG	2	8	1838482	1838489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4025	NC_011901	CTT	2	6	1839785	1839790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_011901	TGA	2	6	1839796	1839801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011901	CAT	2	6	1839802	1839807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_011901	TTG	2	6	1839833	1839838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011901	TGT	2	6	1839839	1839844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011901	TGT	2	6	1840209	1840214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011901	GTG	2	6	1840227	1840232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011901	CTG	4	12	1840371	1840382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_011901	ATGG	2	8	1840385	1840392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011901	CG	4	8	1840435	1840442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_011901	CG	4	8	1840460	1840467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_011901	GAGG	2	8	1840474	1840481	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011901	G	7	7	1840516	1840522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_011901	CTC	2	6	1841909	1841914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_011901	GTC	2	6	1841935	1841940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_011901	AGT	2	6	1841951	1841956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_011901	CGTT	2	8	1842025	1842032	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_011901	CGC	2	6	1842040	1842045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_011901	TAA	2	6	1842066	1842071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011901	TTA	2	6	1842078	1842083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011901	ATC	2	6	1842084	1842089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_011901	ATTG	2	8	1842095	1842102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011901	CCT	2	6	1842107	1842112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_011901	CCA	2	6	1842120	1842125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_011901	CG	4	8	1843746	1843753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_011901	ACTGC	2	10	1843777	1843786	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4051	NC_011901	GCT	2	6	1847855	1847860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_011901	GGCG	2	8	1847876	1847883	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_011901	GCCG	2	8	1848035	1848042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_011901	CTG	2	6	1848055	1848060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_011901	CCT	2	6	1848118	1848123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_011901	ATC	2	6	1848142	1848147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_011901	TCCC	2	8	1848168	1848175	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4058	NC_011901	TCA	2	6	1848725	1848730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_011901	CTGT	2	8	1848751	1848758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_011901	G	6	6	1848766	1848771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_011901	CCGGC	2	10	1851346	1851355	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4062	NC_011901	TG	3	6	1851363	1851368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011901	CTGT	2	8	1851403	1851410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_011901	CAC	2	6	1851421	1851426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_011901	CGCC	2	8	1851427	1851434	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4066	NC_011901	CTA	2	6	1851488	1851493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_011901	TGCAG	2	10	1853270	1853279	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_011901	GAG	2	6	1854143	1854148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011901	CCGCG	2	10	1854796	1854805	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4070	NC_011901	CAG	2	6	1855219	1855224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_011901	GAAA	2	8	1855237	1855244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_011901	GTCG	2	8	1855356	1855363	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_011901	TGGG	2	8	1856427	1856434	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011901	AGC	2	6	1856477	1856482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_011901	CGG	2	6	1856488	1856493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_011901	TGCT	2	8	1856494	1856501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_011901	GC	3	6	1856523	1856528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_011901	ACC	2	6	1856529	1856534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_011901	G	6	6	1857493	1857498	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011901	GGC	2	6	1858297	1858302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_011901	A	8	8	1858412	1858419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011901	AGG	2	6	1858445	1858450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_011901	CAA	2	6	1858465	1858470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_011901	CGG	2	6	1858738	1858743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_011901	ACCC	2	8	1858763	1858770	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4086	NC_011901	TCA	2	6	1858776	1858781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_011901	CCGGT	2	10	1859148	1859157	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4088	NC_011901	T	6	6	1859232	1859237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011901	TC	3	6	1859272	1859277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_011901	GAA	2	6	1859296	1859301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_011901	GA	3	6	1859342	1859347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_011901	GTC	2	6	1859361	1859366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_011901	A	7	7	1859370	1859376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_011901	TC	3	6	1859384	1859389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_011901	GAA	2	6	1859553	1859558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011901	GA	3	6	1859581	1859586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011901	ATC	2	6	1862941	1862946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_011901	GC	3	6	1862995	1863000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_011901	CCAA	2	8	1863005	1863012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_011901	CGGGC	2	10	1864222	1864231	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4101	NC_011901	CGG	2	6	1864330	1864335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_011901	GTA	2	6	1864367	1864372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011901	CTTTT	2	10	1864403	1864412	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4104	NC_011901	TCCC	2	8	1864439	1864446	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4105	NC_011901	CAA	2	6	1864456	1864461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_011901	CAA	2	6	1864476	1864481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_011901	TACGA	2	10	1864497	1864506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4108	NC_011901	CA	3	6	1864510	1864515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_011901	G	6	6	1864539	1864544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011901	TCA	2	6	1865633	1865638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_011901	ATT	2	6	1865644	1865649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_011901	GAAT	2	8	1865700	1865707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011901	GAAT	2	8	1865721	1865728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011901	GAG	2	6	1865772	1865777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_011901	GCG	2	6	1865944	1865949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_011901	CAG	2	6	1865950	1865955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_011901	ACG	2	6	1866126	1866131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_011901	GT	3	6	1866151	1866156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011901	ACA	2	6	1867096	1867101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_011901	A	6	6	1867140	1867145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011901	CAA	2	6	1867192	1867197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_011901	TGC	2	6	1867394	1867399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_011901	TTAT	2	8	1871199	1871206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011901	ATC	2	6	1871245	1871250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_011901	AC	3	6	1871270	1871275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_011901	CTC	2	6	1871280	1871285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_011901	TCA	2	6	1871470	1871475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_011901	CGTTC	2	10	1871480	1871489	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4129	NC_011901	TCA	2	6	1871524	1871529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_011901	GCC	2	6	1871544	1871549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_011901	TCT	2	6	1871640	1871645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_011901	TCA	2	6	1871664	1871669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_011901	TCA	2	6	1871680	1871685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_011901	GAT	2	6	1871767	1871772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4136	NC_011901	TTA	2	6	1871899	1871904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_011901	TAA	2	6	1871933	1871938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_011901	CCGG	2	8	1926229	1926236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4267	NC_011901	AAC	2	6	1926292	1926297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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