MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 7921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011901	CGG	2	6	387636	387641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011901	GCA	2	6	387642	387647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011901	ATG	2	6	387673	387678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011901	GGCG	2	8	387731	387738	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_011901	TAT	2	6	387753	387758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011901	AGC	2	6	387807	387812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011901	CGC	2	6	388359	388364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_011901	GGGC	2	8	389739	389746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_011901	CGC	2	6	390451	390456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_011901	GGC	2	6	390473	390478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011901	CTG	2	6	390489	390494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011901	TAGA	2	8	390504	390511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011901	GCCC	2	8	390522	390529	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1014	NC_011901	ATT	2	6	391435	391440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011901	A	8	8	391513	391520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011901	T	6	6	391540	391545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011901	CT	3	6	393953	393958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_011901	GTG	2	6	394847	394852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011901	TTA	2	6	394864	394869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011901	TCA	2	6	394901	394906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011901	GCTTC	2	10	394922	394931	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1022	NC_011901	T	6	6	396172	396177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011901	TAAT	2	8	396184	396191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011901	GCCCG	2	10	396256	396265	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1025	NC_011901	AT	3	6	396312	396317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011901	GC	3	6	396349	396354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_011901	TGAT	2	8	396358	396365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011901	A	7	7	396558	396564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011901	GCA	2	6	397338	397343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011901	A	8	8	397343	397350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011901	G	6	6	398719	398724	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011901	GTG	2	6	398728	398733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011901	GGC	2	6	398843	398848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011901	CGC	2	6	398856	398861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_011901	TGG	2	6	400178	400183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011901	CGC	2	6	400213	400218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_011901	C	6	6	400245	400250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1038	NC_011901	CGGCC	2	10	400632	400641	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1039	NC_011901	GC	3	6	400651	400656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_011901	GAT	2	6	400674	400679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011901	TA	3	6	400700	400705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011901	CGT	2	6	400719	400724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_011901	GC	3	6	400729	400734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_011901	CCGAA	2	10	400744	400753	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1045	NC_011901	ATCAG	2	10	400760	400769	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_011901	GT	3	6	400792	400797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011901	TCG	2	6	402146	402151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011901	T	6	6	406320	406325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011901	GCG	2	6	406346	406351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011901	CTG	2	6	407952	407957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011901	TGTT	2	8	407958	407965	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011901	GGT	2	6	409307	409312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011901	CCG	2	6	409343	409348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_011901	GCG	2	6	409361	409366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011901	GGGA	2	8	409405	409412	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011901	G	6	6	410396	410401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011901	G	7	7	410417	410423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011901	ACG	2	6	410828	410833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011901	ATG	3	9	410840	410848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011901	TGT	2	6	410852	410857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011901	GATG	2	8	410907	410914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011901	CGA	2	6	410930	410935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011901	TTC	2	6	410954	410959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011901	GCC	2	6	410982	410987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_011901	ATG	2	6	410992	410997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011901	CTGGA	2	10	411010	411019	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_011901	CGAT	2	8	411393	411400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_011901	ATG	2	6	411413	411418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011901	TGG	3	9	412344	412352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011901	AG	3	6	412404	412409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011901	AAAC	2	8	412430	412437	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_011901	GAA	2	6	412496	412501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011901	A	6	6	413861	413866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011901	AG	3	6	413898	413903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011901	TCTT	2	8	414946	414953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_011901	TGA	2	6	415024	415029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011901	G	6	6	415813	415818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011901	TG	3	6	421201	421206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011901	GGGT	2	8	421226	421233	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011901	CTT	2	6	421240	421245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011901	GGGAGA	2	12	421263	421274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011901	TAA	2	6	421333	421338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011901	CTTT	2	8	421380	421387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_011901	AAAG	2	8	421396	421403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011901	AAAGA	2	10	421409	421418	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011901	GC	3	6	421451	421456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_011901	CGC	2	6	421511	421516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_011901	GCG	2	6	421523	421528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011901	G	6	6	421579	421584	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011901	GCA	2	6	421597	421602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011901	TGT	2	6	421624	421629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011901	CCA	2	6	421663	421668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_011901	GCCC	2	8	421731	421738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1094	NC_011901	ACGG	2	8	421823	421830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_011901	CTT	2	6	421903	421908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011901	CAAG	2	8	421927	421934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_011901	CTTTGA	4	24	421973	421996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1098	NC_011901	C	6	6	422014	422019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1099	NC_011901	C	6	6	422033	422038	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1100	NC_011901	CAT	2	6	422063	422068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011901	ACC	2	6	422073	422078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_011901	C	6	6	422098	422103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1103	NC_011901	AAC	2	6	422151	422156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_011901	GAG	2	6	422181	422186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011901	CGA	2	6	423936	423941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011901	GGTT	2	8	423962	423969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011901	GTTG	2	8	424007	424014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011901	CA	3	6	431789	431794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_011901	TAA	2	6	431882	431887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011901	TGG	2	6	431955	431960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011901	GCC	2	6	432567	432572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_011901	AGC	2	6	436715	436720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011901	CAG	2	6	436746	436751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011901	CACCC	2	10	436810	436819	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1115	NC_011901	GCACC	2	10	436824	436833	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1116	NC_011901	CGG	2	6	436863	436868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_011901	GC	3	6	438205	438210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_011901	CG	4	8	439177	439184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_011901	G	6	6	440730	440735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011901	TGG	2	6	440848	440853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011901	CAC	3	9	440885	440893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_011901	TCCCTG	2	12	441595	441606	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_011901	AGA	2	6	441612	441617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011901	CCG	2	6	441698	441703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_011901	GGC	2	6	441716	441721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011901	CGC	2	6	441788	441793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_011901	CG	3	6	441838	441843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_011901	CAG	2	6	442732	442737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011901	A	6	6	442749	442754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011901	CGG	2	6	442755	442760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011901	CCA	2	6	442763	442768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_011901	GC	3	6	442796	442801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_011901	CAGA	2	8	442813	442820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_011901	CAGG	2	8	446744	446751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_011901	CAC	3	9	448240	448248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_011901	AGG	2	6	448267	448272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011901	AGCCA	2	10	450203	450212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1138	NC_011901	GCCG	2	8	450234	450241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1155	NC_011901	TCCC	2	8	461555	461562	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1276	NC_011901	CCG	2	6	518523	518528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1403	NC_011901	GGT	2	6	591848	591853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_011901	AACCAT	2	12	593757	593768	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_011901	T	7	7	594294	594300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_011901	GGGC	2	8	594311	594318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1409	NC_011901	TG	3	6	596129	596134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_011901	GCC	2	6	596144	596149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_011901	TCA	2	6	596191	596196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_011901	CGAG	2	8	598558	598565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1413	NC_011901	GCCC	2	8	598592	598599	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1414	NC_011901	GCG	2	6	598626	598631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_011901	TCCA	2	8	598640	598647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1416	NC_011901	GGCC	2	8	598664	598671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1417	NC_011901	GCCTT	2	10	598745	598754	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1418	NC_011901	GTG	2	6	598806	598811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_011901	AGAGG	2	10	598835	598844	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_011901	CTGCA	2	10	601602	601611	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1421	NC_011901	GGC	2	6	601624	601629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_011901	GCG	2	6	601654	601659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1423	NC_011901	GGCCC	2	10	601712	601721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1424	NC_011901	G	6	6	602152	602157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_011901	TCT	2	6	602231	602236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_011901	CT	3	6	602339	602344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1427	NC_011901	GA	3	6	604997	605002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_011901	GGC	2	6	608588	608593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_011901	GTC	2	6	608612	608617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1433	NC_011901	CAG	2	6	608693	608698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1435	NC_011901	CAG	2	6	610854	610859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_011901	GCCC	2	8	615342	615349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1445	NC_011901	AGGC	2	8	616349	616356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1446	NC_011901	TGCGC	2	10	616360	616369	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1448	NC_011901	AGC	2	6	616463	616468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_011901	CG	3	6	618342	618347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1453	NC_011901	CTG	2	6	618364	618369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1456	NC_011901	TTG	2	6	619857	619862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_011901	TCC	2	6	619867	619872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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