MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 7921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011901	GCTTG	2	10	2039447	2039456	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4502	NC_011901	GGC	2	6	2039523	2039528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_011901	TCGG	2	8	2043442	2043449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_011901	GCC	2	6	2043510	2043515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_011901	GGC	2	6	2043520	2043525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_011901	GC	3	6	2044021	2044026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_011901	A	6	6	2044059	2044064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_011901	TTCT	2	8	2044099	2044106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_011901	CCCCA	2	10	2045130	2045139	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4510	NC_011901	GGGA	2	8	2045159	2045166	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_011901	GTG	2	6	2045180	2045185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_011901	CTTC	2	8	2045217	2045224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_011901	CCGC	2	8	2045235	2045242	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4514	NC_011901	TCA	2	6	2046226	2046231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_011901	GAA	2	6	2048298	2048303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_011901	AT	3	6	2049848	2049853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_011901	CCG	2	6	2049916	2049921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_011901	CTC	2	6	2050170	2050175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_011901	CA	3	6	2050197	2050202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_011901	ACGA	2	8	2051474	2051481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_011901	TG	3	6	2051868	2051873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_011901	G	6	6	2052229	2052234	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_011901	GTGG	2	8	2052252	2052259	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_011901	G	6	6	2052286	2052291	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_011901	TCTG	2	8	2052459	2052466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_011901	TCG	2	6	2055246	2055251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_011901	TTA	2	6	2055253	2055258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_011901	GAC	2	6	2055267	2055272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_011901	AG	3	6	2055299	2055304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_011901	TATT	2	8	2055352	2055359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_011901	TAAA	2	8	2055364	2055371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_011901	TCT	2	6	2057406	2057411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_011901	ATT	3	9	2057449	2057457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_011901	CGG	2	6	2058216	2058221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_011901	TGCT	2	8	2058240	2058247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4536	NC_011901	GGA	2	6	2058284	2058289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_011901	GCA	2	6	2058430	2058435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_011901	GGA	2	6	2059475	2059480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_011901	TTG	2	6	2059515	2059520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_011901	AAC	2	6	2059607	2059612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_011901	CGG	2	6	2061237	2061242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_011901	GC	3	6	2061306	2061311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_011901	CCG	2	6	2061312	2061317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_011901	TC	3	6	2062718	2062723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_011901	G	6	6	2062742	2062747	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011901	A	6	6	2062753	2062758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_011901	TGA	2	6	2063349	2063354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_011901	CCT	2	6	2064378	2064383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_011901	CGT	2	6	2064402	2064407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_011901	AGC	2	6	2064425	2064430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_011901	TC	3	6	2064540	2064545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_011901	CTTT	2	8	2064601	2064608	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_011901	TCT	2	6	2064645	2064650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_011901	GA	3	6	2064671	2064676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_011901	CCTG	2	8	2065246	2065253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_011901	GGA	2	6	2065359	2065364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011901	CCG	2	6	2065372	2065377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_011901	GAC	2	6	2066863	2066868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_011901	TGT	2	6	2066881	2066886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_011901	A	6	6	2066948	2066953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_011901	CGCC	2	8	2066972	2066979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4562	NC_011901	GGCA	2	8	2067000	2067007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_011901	TCA	2	6	2067043	2067048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_011901	GCC	2	6	2067054	2067059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_011901	GAT	2	6	2067787	2067792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_011901	AAG	2	6	2067872	2067877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_011901	TATT	2	8	2067883	2067890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_011901	GCCTCG	2	12	2067897	2067908	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_011901	C	6	6	2067917	2067922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4570	NC_011901	CAT	2	6	2068479	2068484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_011901	ATC	2	6	2068517	2068522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_011901	CAT	2	6	2068556	2068561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_011901	AGA	2	6	2068680	2068685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_011901	TATT	2	8	2068691	2068698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_011901	CT	3	6	2068704	2068709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_011901	AG	3	6	2068725	2068730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_011901	ACA	2	6	2068738	2068743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_011901	TAA	2	6	2068769	2068774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_011901	AGAA	2	8	2068832	2068839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_011901	CTAT	2	8	2068840	2068847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_011901	CTT	2	6	2068856	2068861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_011901	TCA	2	6	2068930	2068935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_011901	TAA	2	6	2068937	2068942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_011901	GAA	2	6	2068974	2068979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_011901	GAT	2	6	2069002	2069007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_011901	T	7	7	2069011	2069017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_011901	CT	3	6	2069108	2069113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_011901	CT	3	6	2069154	2069159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_011901	CGAA	2	8	2069184	2069191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_011901	TGGT	2	8	2069234	2069241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_011901	TGA	2	6	2069905	2069910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_011901	CG	3	6	2069978	2069983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_011901	TCCC	2	8	2070066	2070073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4594	NC_011901	GCG	2	6	2070153	2070158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_011901	TTA	2	6	2070185	2070190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_011901	A	6	6	2070197	2070202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_011901	CTC	2	6	2070230	2070235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_011901	CCA	2	6	2070240	2070245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_011901	ACA	2	6	2070286	2070291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_011901	TC	3	6	2070299	2070304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_011901	GGA	2	6	2070323	2070328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_011901	TC	3	6	2070856	2070861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_011901	T	6	6	2070936	2070941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_011901	GA	3	6	2070989	2070994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_011901	GA	3	6	2071034	2071039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_011901	CCT	2	6	2072520	2072525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_011901	TGA	2	6	2072609	2072614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_011901	GCC	2	6	2072652	2072657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_011901	TGCGC	2	10	2072683	2072692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4610	NC_011901	GTTTG	2	10	2072757	2072766	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_011901	CCA	2	6	2072791	2072796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_011901	GTG	2	6	2072864	2072869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_011901	TCA	2	6	2072876	2072881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_011901	AGG	2	6	2072890	2072895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_011901	CGG	2	6	2073364	2073369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_011901	CCG	2	6	2073440	2073445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_011901	CAG	2	6	2073506	2073511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_011901	CAAGC	2	10	2073573	2073582	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4619	NC_011901	A	6	6	2073625	2073630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011901	T	6	6	2073660	2073665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_011901	GTCG	2	8	2074174	2074181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4622	NC_011901	CCT	2	6	2075492	2075497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_011901	CGT	2	6	2076633	2076638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_011901	CGT	2	6	2076734	2076739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_011901	CG	3	6	2076823	2076828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_011901	CGT	2	6	2076835	2076840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_011901	CT	3	6	2080350	2080355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_011901	TC	3	6	2080410	2080415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_011901	TCACC	2	10	2080427	2080436	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4630	NC_011901	GC	3	6	2081179	2081184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4631	NC_011901	ACG	2	6	2081225	2081230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_011901	GTC	2	6	2081277	2081282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_011901	GC	3	6	2084821	2084826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4634	NC_011901	GGC	2	6	2084838	2084843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4761	NC_011901	GCCCG	2	10	2129615	2129624	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4762	NC_011901	T	6	6	2133399	2133404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4899	NC_011901	GCG	2	6	2205017	2205022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4900	NC_011901	CGC	2	6	2205027	2205032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4986	NC_011901	GCG	2	6	2246644	2246649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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