MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 5631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011653	ACCGA	2	10	1853894	1853903	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5002	NC_011653	CGG	2	6	1853916	1853921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_011653	GAA	2	6	1854144	1854149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011653	ACC	2	6	1854187	1854192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_011653	CCT	2	6	1854276	1854281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_011653	GC	3	6	1854296	1854301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_011653	GTC	2	6	1854431	1854436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011653	CATCC	2	10	1854528	1854537	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5009	NC_011653	CGT	2	6	1854607	1854612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_011653	GGTC	2	8	1854619	1854626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_011653	CTG	2	6	1854632	1854637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_011653	AGG	2	6	1854645	1854650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011653	GGT	2	6	1854856	1854861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011653	GCA	2	6	1854868	1854873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_011653	ACC	2	6	1854978	1854983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_011653	GCC	2	6	1855011	1855016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_011653	GTA	2	6	1855028	1855033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011653	GTAG	2	8	1855055	1855062	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011653	TTAA	2	8	1855092	1855099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011653	T	6	6	1855120	1855125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011653	ACTT	2	8	1855138	1855145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_011653	T	8	8	1855160	1855167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011653	TG	3	6	1855173	1855178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011653	T	6	6	1855268	1855273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011653	ATA	2	6	1855300	1855305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011653	T	7	7	1855307	1855313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011653	AGT	2	6	1855324	1855329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011653	ATTTT	2	10	1855359	1855368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011653	ATT	2	6	1855371	1855376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011653	T	7	7	1855386	1855392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011653	T	7	7	1855395	1855401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011653	ATT	2	6	1855402	1855407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011653	ATT	2	6	1855425	1855430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011653	ATAA	2	8	1855431	1855438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011653	T	7	7	1855460	1855466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011653	A	6	6	1855477	1855482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_011653	A	6	6	1861103	1861108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_011653	ATT	2	6	1861121	1861126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011653	AGG	2	6	1861134	1861139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011653	G	6	6	1862952	1862957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011653	CTC	2	6	1875595	1875600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_011653	TTTTA	2	10	1875605	1875614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011653	TCATT	2	10	1875702	1875711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_011653	AGGG	2	8	1877410	1877417	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011653	ATAA	2	8	1883880	1883887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011653	AGG	2	6	1886294	1886299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_011653	TAGG	2	8	1889164	1889171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011653	AAG	2	6	1893831	1893836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011653	TA	3	6	1898751	1898756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011653	T	6	6	1898770	1898775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011653	CCT	2	6	1900374	1900379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_011653	TA	3	6	1900401	1900406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011653	TTAA	2	8	1904701	1904708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5056	NC_011653	TTA	2	6	1904717	1904722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011653	AGT	2	6	1904755	1904760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011653	GT	3	6	1904759	1904764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_011653	AATTTT	2	12	1904787	1904798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011653	T	6	6	1904795	1904800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011653	GGTGT	2	10	1904805	1904814	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011653	ATA	2	6	1908971	1908976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011653	GGT	2	6	1909004	1909009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011653	T	8	8	1909085	1909092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_011653	ACA	2	6	1909098	1909103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_011653	A	6	6	1910401	1910406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011653	ATA	2	6	1913761	1913766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011653	TTTTA	2	10	1913792	1913801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011653	TAAT	2	8	1913804	1913811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_011653	TTAA	2	8	1913821	1913828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011653	T	7	7	1913860	1913866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_011653	ATT	2	6	1913867	1913872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011653	T	6	6	1913878	1913883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011653	TTAA	2	8	1913938	1913945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_011653	T	9	9	1913951	1913959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_011653	ATA	3	9	1913963	1913971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_011653	T	6	6	1914113	1914118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011653	TGT	2	6	1914167	1914172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_011653	AT	3	6	1914199	1914204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_011653	GTA	2	6	1914289	1914294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5085	NC_011653	TAA	2	6	1914469	1914474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_011653	TGA	2	6	1914547	1914552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_011653	A	6	6	1914557	1914562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_011653	TAT	2	6	1914589	1914594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011653	ATT	2	6	1914608	1914613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011653	TAT	2	6	1914633	1914638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011653	GTT	2	6	1914674	1914679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_011653	TGAAT	2	10	1914805	1914814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_011653	AAT	3	9	1914812	1914820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_011653	TGT	2	6	1914892	1914897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011653	A	6	6	1914909	1914914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5103	NC_011653	TAA	2	6	1915075	1915080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011653	CAAA	2	8	1915205	1915212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_011653	GCA	2	6	1915229	1915234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5109	NC_011653	AGC	2	6	1915318	1915323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_011653	AAT	2	6	1915361	1915366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_011653	A	7	7	1915391	1915397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011653	AAG	2	6	1915413	1915418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011653	GTT	2	6	1915436	1915441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_011653	ATAA	2	8	1915493	1915500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011653	GCA	2	6	1915529	1915534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5118	NC_011653	GAA	2	6	1915583	1915588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011653	TGA	2	6	1915591	1915596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_011653	GAT	2	6	1915615	1915620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011653	GAA	2	6	1915664	1915669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011653	GTA	2	6	1915679	1915684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011653	TAGTT	2	10	1915721	1915730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011653	CCT	2	6	1916487	1916492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_011653	A	6	6	1916502	1916507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011653	T	8	8	1916508	1916515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_011653	ATG	2	6	1917998	1918003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_011653	TATG	2	8	1918036	1918043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_011653	TAA	2	6	1918054	1918059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_011653	CT	3	6	1919544	1919549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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