MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 3699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011529	TAT	2	6	3952	3957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011529	TTC	2	6	3975	3980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011529	TGG	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011529	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011529	ACTC	2	8	7937	7944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011529	T	7	7	7998	8004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011529	TAA	2	6	8007	8012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011529	T	6	6	8014	8019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011529	TA	3	6	8040	8045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011529	GA	3	6	9260	9265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011529	GGA	2	6	11568	11573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011529	TTC	2	6	11897	11902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011529	CTT	2	6	11918	11923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011529	TGG	2	6	11942	11947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011529	GTCT	2	8	12016	12023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011529	TTTC	2	8	12137	12144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011529	TGA	2	6	12264	12269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011529	ACTA	2	8	12290	12297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011529	GTG	2	6	12327	12332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011529	TGG	2	6	12338	12343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011529	AGC	2	6	12351	12356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011529	AGG	2	6	12363	12368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011529	TCCT	2	8	12398	12405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011529	ACCT	2	8	12464	12471	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011529	GGT	2	6	12474	12479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011529	TTC	2	6	12708	12713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011529	TCT	2	6	12714	12719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011529	A	6	6	14263	14268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011529	CAC	2	6	14668	14673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011529	TTC	2	6	14682	14687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011529	TGT	2	6	15195	15200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011529	TTA	2	6	17787	17792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011529	TGG	2	6	17830	17835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011529	GTCC	2	8	19382	19389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011529	GTG	2	6	19403	19408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011529	CGA	2	6	19760	19765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011529	GA	3	6	19764	19769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011529	GGAT	2	8	19875	19882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011529	G	6	6	19930	19935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011529	TGA	2	6	19943	19948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011529	TC	3	6	20032	20037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011529	TTGC	2	8	20076	20083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011529	AGC	2	6	20088	20093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011529	ATCGC	2	10	20104	20113	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_011529	GGT	2	6	20226	20231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011529	T	6	6	20948	20953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011529	TAG	2	6	20968	20973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011529	CTG	2	6	21023	21028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011529	CT	3	6	21046	21051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011529	CTGGT	2	10	21055	21064	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011529	TAT	2	6	21069	21074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011529	AGG	2	6	21119	21124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011529	AGC	2	6	21228	21233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011529	GAGAA	2	10	21315	21324	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011529	GGT	2	6	21346	21351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011529	TCTT	2	8	23613	23620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011529	GTG	2	6	23960	23965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011529	GGT	2	6	24257	24262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011529	GGT	2	6	25068	25073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011529	AG	3	6	25335	25340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011529	GGCG	2	8	26164	26171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011529	T	7	7	29215	29221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011529	GGT	2	6	29237	29242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011529	G	6	6	29582	29587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011529	TTC	2	6	30047	30052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011529	GGT	2	6	30053	30058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011529	A	6	6	31253	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011529	AGA	2	6	32301	32306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011529	CAC	2	6	33158	33163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011529	TCA	2	6	33211	33216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011529	GAA	2	6	33224	33229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011529	TGG	2	6	36831	36836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011529	GAG	2	6	36882	36887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011529	AGC	2	6	36912	36917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011529	TGGG	2	8	41475	41482	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011529	AACG	2	8	42051	42058	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011529	GAA	2	6	42077	42082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011529	GGA	2	6	42088	42093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011529	AGA	2	6	50693	50698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011529	TTC	2	6	50711	50716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011529	CTA	2	6	53077	53082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011529	AGA	2	6	53111	53116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011529	ATAAA	2	10	54116	54125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011529	GGC	2	6	54175	54180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011529	GGT	2	6	54224	54229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011529	CGG	2	6	56789	56794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011529	GAA	2	6	56879	56884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011529	CCACT	2	10	58143	58152	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_011529	GCTTA	2	10	58166	58175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011529	AGCGC	2	10	58759	58768	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011529	CTT	2	6	58776	58781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011529	GAT	2	6	58823	58828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011529	TGA	2	6	58861	58866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011529	ATT	2	6	58925	58930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011529	CTT	2	6	58947	58952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011529	TGG	2	6	58953	58958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011529	CTT	2	6	60112	60117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011529	T	6	6	60116	60121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011529	AAC	2	6	60226	60231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011529	AAT	2	6	60350	60355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011529	GTGA	2	8	63415	63422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011529	GGT	2	6	64548	64553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011529	AG	3	6	70850	70855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011529	AG	3	6	72170	72175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011529	ATTTA	2	10	73108	73117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011529	CTTTC	2	10	74587	74596	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011529	CTT	2	6	74628	74633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011529	CCT	2	6	74641	74646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011529	GA	3	6	75805	75810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011529	TC	3	6	78807	78812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011529	TC	4	8	78829	78836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011529	TCT	2	6	78866	78871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011529	CT	3	6	78880	78885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011529	T	6	6	78895	78900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011529	TCT	2	6	78911	78916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011529	A	6	6	78949	78954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011529	TCC	2	6	79032	79037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_011529	CT	3	6	80864	80869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011529	TCG	2	6	80919	80924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011529	TTTG	2	8	80931	80938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011529	TAC	2	6	80950	80955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011529	TA	3	6	80995	81000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011529	TTA	2	6	81018	81023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011529	TGG	2	6	81068	81073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011529	ATT	2	6	81196	81201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011529	GATT	2	8	81332	81339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011529	GGT	2	6	81695	81700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011529	TTTTTG	2	12	81755	81766	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011529	TGG	2	6	81778	81783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011529	GAACTC	2	12	81786	81797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011529	CCGG	2	8	81805	81812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011529	GAT	2	6	81817	81822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011529	ACC	2	6	81854	81859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011529	AGG	2	6	81873	81878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011529	AGG	2	6	82220	82225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011529	TGG	2	6	82256	82261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011529	ATT	2	6	82271	82276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011529	TGG	2	6	82312	82317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011529	TCTA	2	8	82318	82325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011529	TAG	2	6	82414	82419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011529	GAA	2	6	82442	82447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011529	CT	3	6	83187	83192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011529	GGT	2	6	83671	83676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011529	CTT	2	6	84648	84653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011529	T	6	6	84652	84657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011529	GGT	2	6	84658	84663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011529	GTCCC	2	10	85492	85501	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_011529	CCCCGC	2	12	85524	85535	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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151	NC_011529	G	6	6	87055	87060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_011529	CGG	2	6	92674	92679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_011529	AG	3	6	96684	96689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011529	TA	4	8	97775	97782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_011529	T	6	6	98013	98018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_011529	GAG	2	6	130222	130227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_011529	T	6	6	130331	130336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011529	TTC	2	6	130342	130347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_011529	ATAAA	2	10	131428	131437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_011529	TCA	2	6	131559	131564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_011529	ATT	2	6	133151	133156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_011529	TATG	2	8	133212	133219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
278	NC_011529	TTCTT	2	10	133299	133308	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_011529	CAA	2	6	133434	133439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_011529	AGGG	2	8	133445	133452	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011529	GAT	2	6	133456	133461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011529	ATG	2	6	133484	133489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011529	TCATT	2	10	133524	133533	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_011529	GCT	2	6	133548	133553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_011529	TTA	2	6	133554	133559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011529	A	6	6	133575	133580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_011529	TA	3	6	133650	133655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011529	TTTG	2	8	133660	133667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_011529	TA	3	6	133705	133710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011529	TC	3	6	135026	135031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
293	NC_011529	CTT	2	6	135060	135065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_011529	T	6	6	193432	193437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_011529	CTT	2	6	193703	193708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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