MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 3699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011529	TTC	2	6	1468228	1468233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_011529	GGT	2	6	1468235	1468240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011529	TAC	2	6	1469803	1469808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_011529	T	6	6	1469901	1469906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011529	AACG	2	8	1469940	1469947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_011529	GA	4	8	1470280	1470287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_011529	AT	3	6	1471547	1471552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_011529	CCT	2	6	1471588	1471593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_011529	GAAAA	2	10	1471616	1471625	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011529	ATTGT	2	10	1471656	1471665	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_011529	AAAAAT	2	12	1472930	1472941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011529	AGA	2	6	1472945	1472950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011529	A	6	6	1473903	1473908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_011529	T	7	7	1473916	1473922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011529	CAA	2	6	1473939	1473944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_011529	TAA	2	6	1473953	1473958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_011529	CAA	2	6	1473974	1473979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_011529	AG	3	6	1473984	1473989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_011529	TGC	2	6	1474005	1474010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_011529	GAA	2	6	1474013	1474018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011529	TCTT	2	8	1475339	1475346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_011529	ATT	2	6	1475353	1475358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011529	T	6	6	1475392	1475397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011529	CAG	2	6	1475412	1475417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_011529	AGG	2	6	1475432	1475437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3027	NC_011529	AGGG	2	8	1475499	1475506	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_011529	CAT	3	9	1476375	1476383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3030	NC_011529	GGA	2	6	1476920	1476925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011529	ACC	2	6	1477489	1477494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_011529	GGA	2	6	1477495	1477500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011529	GAA	2	6	1477505	1477510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_011529	A	6	6	1477519	1477524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011529	TCA	2	6	1478019	1478024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_011529	ACCG	2	8	1479929	1479936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_011529	TA	4	8	1479954	1479961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011529	TAC	2	6	1479984	1479989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_011529	TAA	2	6	1479990	1479995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011529	A	6	6	1480004	1480009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_011529	GA	3	6	1480012	1480017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_011529	ATCC	2	8	1480457	1480464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_011529	TAA	2	6	1480506	1480511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011529	ACC	2	6	1482394	1482399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3047	NC_011529	ATA	2	6	1483556	1483561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011529	GA	3	6	1488314	1488319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011529	TGG	2	6	1489255	1489260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011529	ACC	2	6	1495146	1495151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_011529	ACC	2	6	1497716	1497721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_011529	A	6	6	1497748	1497753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011529	T	7	7	1498486	1498492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011529	GTG	2	6	1499348	1499353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011529	CGG	2	6	1499404	1499409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3059	NC_011529	AG	3	6	1499674	1499679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011529	CTTC	2	8	1499713	1499720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3062	NC_011529	A	8	8	1500656	1500663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_011529	ATA	3	9	1500671	1500679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011529	TA	3	6	1500678	1500683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_011529	GTAG	2	8	1509543	1509550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_011529	ATA	2	6	1510327	1510332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_011529	T	6	6	1510896	1510901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3084	NC_011529	T	6	6	1512079	1512084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_011529	ATA	2	6	1516034	1516039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011529	T	6	6	1516051	1516056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011529	AT	3	6	1516070	1516075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_011529	TCT	2	6	1524509	1524514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_011529	GAAAA	2	10	1524531	1524540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011529	ACC	2	6	1525927	1525932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_011529	GCT	2	6	1525940	1525945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_011529	AT	3	6	1525950	1525955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011529	GCC	2	6	1525982	1525987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_011529	ATGAAA	2	12	1526027	1526038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011529	AAG	2	6	1526065	1526070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011529	CCCA	2	8	1527541	1527548	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3110	NC_011529	CGG	2	6	1527603	1527608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_011529	TA	3	6	1527615	1527620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011529	AGGG	2	8	1529003	1529010	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_011529	A	6	6	1529033	1529038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011529	CTTC	2	8	1530471	1530478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3119	NC_011529	TTCTC	2	10	1532851	1532860	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3120	NC_011529	TCGT	2	8	1532871	1532878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_011529	TTC	2	6	1532902	1532907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_011529	CT	3	6	1535385	1535390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_011529	CTT	3	9	1535396	1535404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_011529	TTAT	2	8	1535410	1535417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011529	CAC	2	6	1537660	1537665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_011529	TC	3	6	1537737	1537742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3133	NC_011529	ACT	2	6	1537919	1537924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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