MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 3699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011529	C	6	6	1253403	1253408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2502	NC_011529	TGA	2	6	1253455	1253460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_011529	TTG	2	6	1253463	1253468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_011529	ACT	2	6	1253530	1253535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_011529	GAA	2	6	1253558	1253563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_011529	CAT	2	6	1253661	1253666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_011529	AAT	2	6	1253679	1253684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011529	TCC	2	6	1253708	1253713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_011529	AAC	2	6	1253716	1253721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_011529	TA	5	10	1253736	1253745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_011529	AG	3	6	1253793	1253798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_011529	TGA	2	6	1253813	1253818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_011529	GCC	2	6	1253863	1253868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_011529	TC	3	6	1253907	1253912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_011529	CAA	2	6	1253925	1253930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_011529	TGC	2	6	1253931	1253936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_011529	TC	3	6	1253960	1253965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_011529	TCA	2	6	1254010	1254015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_011529	AGT	2	6	1254076	1254081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011529	CATCG	2	10	1254096	1254105	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2522	NC_011529	AG	3	6	1254117	1254122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_011529	TCGTGC	2	12	1254135	1254146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_011529	ATCA	2	8	1254150	1254157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_011529	AT	3	6	1254160	1254165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_011529	A	6	6	1254166	1254171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_011529	TA	3	6	1254211	1254216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011529	AAT	2	6	1254293	1254298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011529	AAG	2	6	1254306	1254311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_011529	TTC	2	6	1254941	1254946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_011529	TTGT	2	8	1254950	1254957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_011529	CAG	2	6	1254982	1254987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_011529	TCAC	2	8	1254999	1255006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2534	NC_011529	TTC	2	6	1255008	1255013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_011529	ATA	2	6	1255025	1255030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_011529	T	6	6	1255067	1255072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_011529	ATT	2	6	1255114	1255119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_011529	ATTA	2	8	1255158	1255165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_011529	TA	3	6	1255201	1255206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_011529	ATA	2	6	1255238	1255243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_011529	TTC	2	6	1255279	1255284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_011529	CGC	2	6	1255306	1255311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_011529	T	6	6	1255336	1255341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_011529	TAGA	2	8	1255407	1255414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_011529	TGATTG	2	12	1255449	1255460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2547	NC_011529	TTG	2	6	1258374	1258379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_011529	TAT	2	6	1258414	1258419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2550	NC_011529	TTA	2	6	1258470	1258475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_011529	TA	3	6	1258485	1258490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_011529	TAC	2	6	1258496	1258501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2554	NC_011529	TAA	2	6	1259113	1259118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_011529	AAG	2	6	1259164	1259169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2557	NC_011529	AT	3	6	1259193	1259198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_011529	AAGG	2	8	1259223	1259230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_011529	A	6	6	1261635	1261640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_011529	TGTC	2	8	1261642	1261649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2561	NC_011529	GA	3	6	1262279	1262284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_011529	TA	3	6	1267745	1267750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_011529	CAC	2	6	1269574	1269579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_011529	A	6	6	1269605	1269610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_011529	GAAA	2	8	1269650	1269657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_011529	AAT	2	6	1269686	1269691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2571	NC_011529	AGG	2	6	1272098	1272103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_011529	CAG	2	6	1274240	1274245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_011529	T	10	10	1274246	1274255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_011529	TCCA	2	8	1274278	1274285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2575	NC_011529	AAATG	2	10	1274291	1274300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_011529	AGCT	2	8	1274506	1274513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2577	NC_011529	GCTC	2	8	1274530	1274537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2588	NC_011529	GCC	2	6	1275509	1275514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2589	NC_011529	C	6	6	1275542	1275547	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2593	NC_011529	C	6	6	1275971	1275976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2594	NC_011529	CGG	2	6	1276169	1276174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2596	NC_011529	G	6	6	1276187	1276192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2600	NC_011529	TGC	2	6	1276458	1276463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_011529	CGCC	2	8	1276534	1276541	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2602	NC_011529	GCT	2	6	1276660	1276665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_011529	GTT	2	6	1276754	1276759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2605	NC_011529	CGG	2	6	1276807	1276812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2608	NC_011529	CCGG	2	8	1276894	1276901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2609	NC_011529	CGG	2	6	1276921	1276926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_011529	GACG	2	8	1277209	1277216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2611	NC_011529	TCCCC	2	10	1277229	1277238	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2612	NC_011529	CACC	2	8	1277294	1277301	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2613	NC_011529	CGC	2	6	1277305	1277310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_011529	CCG	2	6	1277429	1277434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_011529	CCGA	2	8	1277440	1277447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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