MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 3699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011529	AGG	2	6	555048	555053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011529	TCT	2	6	556126	556131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011529	GAAAT	2	10	559449	559458	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011529	TAA	2	6	559459	559464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011529	CAC	2	6	559496	559501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_011529	AAG	2	6	559547	559552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011529	TAT	2	6	559598	559603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011529	CTG	2	6	559651	559656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011529	TTC	2	6	559744	559749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011529	TGT	2	6	559755	559760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011529	GTG	2	6	559772	559777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011529	ACT	2	6	559834	559839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_011529	ATG	2	6	559883	559888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011529	A	6	6	559903	559908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011529	A	6	6	559910	559915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011529	TCAT	2	8	563310	563317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011529	ATG	2	6	570241	570246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011529	TTC	2	6	570557	570562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011529	TA	3	6	571679	571684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011529	ACCG	2	8	572651	572658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_011529	GGGC	2	8	574466	574473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_011529	CCA	2	6	574541	574546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_011529	CAAA	2	8	574561	574568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_011529	TCT	2	6	574636	574641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011529	TTG	2	6	574755	574760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011529	TTAAT	2	10	577068	577077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_011529	GAG	2	6	577119	577124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011529	TCT	2	6	577138	577143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_011529	ATC	2	6	578323	578328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011529	ATC	2	6	578389	578394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011529	AGG	2	6	578470	578475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1035	NC_011529	TGA	2	6	579291	579296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011529	AGG	2	6	579304	579309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1042	NC_011529	TTTCT	2	10	583542	583551	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1044	NC_011529	TA	3	6	586787	586792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011529	TAC	2	6	586823	586828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1049	NC_011529	TG	3	6	589631	589636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_011529	TTTCT	2	10	594620	594629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1059	NC_011529	TTCT	2	8	594639	594646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1062	NC_011529	TCA	2	6	596348	596353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1064	NC_011529	TCTA	2	8	596402	596409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_011529	TTTC	2	8	596421	596428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_011529	GTT	2	6	596434	596439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1068	NC_011529	TGG	2	6	596491	596496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011529	TC	3	6	597507	597512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1071	NC_011529	AAAG	2	8	597565	597572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011529	GA	3	6	598692	598697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_011529	A	6	6	599598	599603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_011529	CAG	2	6	614009	614014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011529	AAG	2	6	615324	615329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011529	CCT	2	6	615344	615349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_011529	GAA	3	9	615373	615381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011529	GTA	2	6	616262	616267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1107	NC_011529	GGA	2	6	616854	616859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011529	G	6	6	617909	617914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011529	TC	3	6	617932	617937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1112	NC_011529	TCG	2	6	620599	620604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1114	NC_011529	GCA	2	6	620639	620644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011529	A	6	6	620665	620670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011529	CGT	2	6	620692	620697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_011529	GC	3	6	620700	620705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_011529	AGG	2	6	622125	622130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011529	TAAA	2	8	622147	622154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011529	TTCCGT	2	12	622227	622238	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_011529	T	6	6	625174	625179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011529	A	6	6	625220	625225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_011529	GGT	2	6	626364	626369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011529	CCGG	2	8	626422	626429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_011529	TC	3	6	626441	626446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_011529	AGC	2	6	626462	626467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_011529	CAC	2	6	626470	626475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_011529	TAA	2	6	626520	626525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_011529	T	6	6	626683	626688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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