MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 3245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011296	ACC	2	6	633295	633300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_011296	CA	3	6	633302	633307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_011296	GGC	2	6	633367	633372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011296	GCA	2	6	633434	633439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011296	TGC	2	6	633445	633450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_011296	CGA	2	6	633488	633493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011296	TGT	2	6	633522	633527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011296	CCT	2	6	633570	633575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_011296	TCT	2	6	633588	633593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011296	CA	3	6	633636	633641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_011296	ATTGT	2	10	633783	633792	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011296	AGG	2	6	633928	633933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011296	ACA	2	6	633949	633954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011296	T	6	6	633977	633982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011296	ATG	2	6	634006	634011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011296	AT	3	6	634013	634018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011296	GA	3	6	634115	634120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011296	AATT	2	8	636241	636248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011296	TAA	2	6	636297	636302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011296	T	6	6	642875	642880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011296	TGAT	2	8	642882	642889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011296	GAA	2	6	642893	642898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011296	TCT	2	6	642911	642916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_011296	TAA	2	6	642993	642998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011296	GCT	2	6	643061	643066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011296	A	6	6	643104	643109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011296	TG	3	6	643172	643177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011296	ACAT	2	8	648332	648339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_011296	TA	3	6	648340	648345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011296	TTA	2	6	648355	648360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011296	A	7	7	648389	648395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011296	AATT	2	8	655102	655109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011296	T	6	6	655170	655175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011296	TA	3	6	657757	657762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011296	CCT	2	6	664928	664933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_011296	TAA	2	6	664948	664953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011296	ATT	2	6	664998	665003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011296	AAT	2	6	667196	667201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011296	T	6	6	667277	667282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1041	NC_011296	A	8	8	676428	676435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011296	TA	3	6	676478	676483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011296	TAT	2	6	676492	676497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011296	ATA	2	6	676507	676512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011296	G	6	6	676513	676518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011296	TGT	2	6	676797	676802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011296	CAG	2	6	677001	677006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1049	NC_011296	TAT	2	6	679013	679018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011296	ATAA	2	8	679036	679043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011296	A	7	7	679042	679048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011296	T	7	7	679049	679055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011296	A	6	6	679063	679068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011296	TAA	2	6	679073	679078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011296	GAT	2	6	679085	679090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011296	T	6	6	679889	679894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011296	AGAA	2	8	679904	679911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_011296	T	6	6	683892	683897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011296	T	8	8	683916	683923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011296	AAT	2	6	683924	683929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011296	A	7	7	683937	683943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011296	TA	3	6	686382	686387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011296	A	6	6	686431	686436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011296	T	7	7	686443	686449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1068	NC_011296	AAT	2	6	691066	691071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011296	TTTG	2	8	691083	691090	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_011296	TA	3	6	691446	691451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011296	ATT	2	6	691855	691860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011296	GAT	2	6	691891	691896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_011296	T	7	7	698874	698880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011296	T	7	7	698934	698940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_011296	A	7	7	705241	705247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011296	A	9	9	705263	705271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011296	GAG	2	6	705452	705457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011296	GAG	2	6	705468	705473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011296	T	6	6	705483	705488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_011296	TAA	2	6	705742	705747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011296	T	7	7	712317	712323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011296	T	6	6	713087	713092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011296	A	6	6	713138	713143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011296	A	6	6	713157	713162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_011296	AAG	2	6	713438	713443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_011296	TTTA	2	8	717141	717148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011296	GTT	2	6	717153	717158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1120	NC_011296	TCAA	2	8	717177	717184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_011296	AT	3	6	719781	719786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011296	T	9	9	719786	719794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011296	T	6	6	719802	719807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011296	AT	3	6	719820	719825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_011296	GAG	2	6	729082	729087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_011296	ATT	2	6	730713	730718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_011296	TTA	2	6	730741	730746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_011296	T	6	6	730750	730755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1418	NC_011296	TTA	2	6	919529	919534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_011296	G	6	6	919540	919545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_011296	AGG	2	6	919550	919555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_011296	TC	3	6	919620	919625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1425	NC_011296	GAG	2	6	919860	919865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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